BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,099	C→G	2.0%	P186P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,099	0	C→G	2.0%	6.5 ‑2.1 ‑0.3	340	P186P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (1/6): ref base (166/166): total (168/172)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.21e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.97e-01

Only 100 of 436 total aligned reads displayed.


TCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCGCAGCCC  >  NC_014034/221999‑222199


tcggTTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                      <  2:1219327/101‑1 (MQ=14)


 gggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtaggtcg                                                                                                     >  2:1878886/2‑101 (MQ=14)


 ctgATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                     <  2:3969375/99‑1 (MQ=17)


 cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                     <  2:90869/101‑1 (MQ=11)


  gggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                    >  2:725607/4‑101 (MQ=11)


  ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg                                                                                                    >  1:3346899/1‑101 (MQ=11)


   gATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTGGGAtccgtgggc                                                                                                   >  2:3481738/1‑100 (MQ=14)


   gATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                                                                   <  1:1920778/101‑1 (MQ=11)


      ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                >  1:154222/1‑101 (MQ=14)


      ccGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                <  1:3335024/101‑1 (MQ=14)


       ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                               >  2:3409463/5‑101 (MQ=17)


        gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCgg                                                                                              >  2:2601644/1‑100 (MQ=14)


          gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                            >  2:3278672/1‑101 (MQ=14)


          cggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                            >  2:1189001/2‑101 (MQ=255)


           ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGGCCGTggg                                                                                           >  2:832753/1‑101 (MQ=11)


           ggATCGGTCGGGGCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                           <  1:140812/101‑1 (MQ=255)


           ggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                           >  1:894606/1‑101 (MQ=255)


           ggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                           <  2:2193470/101‑1 (MQ=255)


            gATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTGGGa                                                                                          >  2:2430068/1‑101 (MQ=17)


             aTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtagatcggaa                                                                                         >  2:651088/1‑92 (MQ=17)


                ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGGGCCCGTCGGAtcgg                                                                                      >  2:334933/1‑101 (MQ=14)


                cgtggggTCCGTGTGATCAGTCGGCGCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                      <  2:4131394/97‑1 (MQ=21)


                 gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                     <  1:2915890/101‑1 (MQ=17)


                 gtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggt                                                                                     <  1:3976545/101‑1 (MQ=14)


                 gtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggg                                                                                     >  1:3473937/1‑100 (MQ=14)


                  tgggttCCGTGGGATCCGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                    <  2:2495061/96‑1 (MQ=14)


                  tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGATCGGGGGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGGCCGTAGGAtcgatc                                                                                    >  2:1421478/1‑101 (MQ=14)


                   ggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                   >  1:4161582/2‑101 (MQ=255)


                    gggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                  >  2:3753978/1‑101 (MQ=255)


                      gTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCGGTCGGGt                                                                                >  1:309239/1‑101 (MQ=17)


                      atCCGGGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGt                                                                                <  1:3278913/100‑1 (MQ=11)


                       tCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                               >  2:365101/1‑101 (MQ=17)


                        gcGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                              <  2:1521221/100‑1 (MQ=255)


                        ccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGGCGGGTcg                                                                              >  2:1699995/1‑100 (MQ=14)


                        ccGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                              <  1:3835738/101‑1 (MQ=11)


                         cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                             >  2:2752635/1‑101 (MQ=255)


                          gtcggATCGGTCGGATGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                            >  1:3699512/4‑101 (MQ=14)


                          gtcggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                            >  1:2790864/4‑101 (MQ=17)


                           tGGGGTCGGTAGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                           <  1:3921363/101‑1 (MQ=255)


                           tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                           >  2:1288863/1‑101 (MQ=17)


                            gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                          <  1:3494137/101‑1 (MQ=255)


                            gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                          <  2:1975544/101‑1 (MQ=255)


                            gggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtag                                                                          <  1:1064186/101‑3 (MQ=17)


                            gggATCGGGCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                          <  1:2888559/101‑1 (MQ=255)


                               gtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggat                                                                       <  1:3053655/100‑3 (MQ=14)


                                tcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                                      <  1:1441680/101‑4 (MQ=14)


                                tcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                                      <  1:171873/101‑4 (MQ=14)


                                 cggtcggGTCGGTGGGATCTGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                                                     <  2:3617292/101‑5 (MQ=11)


                                 cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGcgg                                                                     >  1:573024/1‑99 (MQ=255)


                                 cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtg                                                                     >  1:502607/1‑101 (MQ=255)


                                 cggtcgcGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTcgggtcc                                                                     <  1:683117/101‑4 (MQ=11)


                                   gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggc                                                                   >  1:2347434/1‑95 (MQ=14)


                                    tcggGTCCGGTGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggtg                                                                  <  2:1772623/101‑1 (MQ=14)


                                    tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggataggtc                                                                  >  2:1859123/1‑94 (MQ=14)


                                    tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc                                                                  <  1:2446438/101‑8 (MQ=11)


                                     cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                                                 >  2:3128197/1‑93 (MQ=11)


                                      ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggtcgg                                                                >  2:613104/1‑92 (MQ=14)


                                      ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCGGTCGGGTCGGTCGGATCGGTGGGAGCCGGgggagcgggggg                                                                >  2:2125286/1‑92 (MQ=2)


                                      ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTACGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg                                                                >  1:3605113/1‑92 (MQ=11)


                                       ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGCTGGTGGGa                                                               >  2:1912461/3‑101 (MQ=255)


                                       ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTgggg                                                               >  1:1870810/3‑100 (MQ=255)


                                        gtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAt                                                              <  1:1288959/100‑1 (MQ=255)


                                          gcGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcg                                                            <  2:302983/100‑1 (MQ=255)


                                          ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcg                                                            >  1:629102/1‑101 (MQ=255)


                                             tGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtc                                                         <  2:2942855/101‑1 (MQ=255)


                                              gggATCCGTCTGATCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtcg                                                        <  2:465751/101‑1 (MQ=17)


                                                 atggggcggGTCCGGCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGat                                                     <  1:977062/95‑2 (MQ=11)


                                                  tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAcc                                                    >  2:2827452/1‑101 (MQ=255)


                                                     gtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCt                                                 <  1:3754235/101‑1 (MQ=255)


                                                       cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGGCCGCTGt                                               >  2:511330/1‑101 (MQ=255)


                                                        gggTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGCGGGATCGGTCGGACCGCTGTc                                              >  2:545688/1‑101 (MQ=255)


                                                            ccGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccg                                          >  1:748146/1‑101 (MQ=255)


                                                             cGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgc                                         >  1:2143810/1‑101 (MQ=255)


                                                              gTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgcc                                        >  1:477826/1‑101 (MQ=255)


                                                              gTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgcc                                        <  2:1537590/101‑1 (MQ=255)


                                                                aGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgccgc                                      <  1:1497026/101‑1 (MQ=255)


                                                                aGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgccgc                                      >  2:1058170/1‑101 (MQ=255)


                                                                    tcggtcggGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGa                                  <  1:832834/101‑1 (MQ=255)


                                                                        gcgggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGa                              <  2:3677887/100‑1 (MQ=255)


                                                                        cgatctccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGa                              <  1:1646609/96‑1 (MQ=255)


                                                                         cgggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAc                             >  2:2308780/1‑101 (MQ=255)


                                                                          gggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAcc                            <  2:1105587/101‑1 (MQ=255)


                                                                           ggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAccc                           >  2:3213297/1‑101 (MQ=255)


                                                                              ccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGaagatcg                        >  2:1646494/1‑95 (MQ=255)


                                                                              ccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAgg                        >  2:3861830/1‑101 (MQ=255)


                                                                              ccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAgg                        <  2:3808760/101‑1 (MQ=255)


                                                                                gtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggcc                      <  2:2359293/101‑1 (MQ=255)


                                                                                gtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAagcc                      >  1:4029066/1‑101 (MQ=255)


                                                                                  cgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGGCTGGGGGGACCGGCCGGCCCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGCCCCAgcccgc                    >  2:2901755/1‑100 (MQ=21)


                                                                                   gggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTTGGTGGGATCGGTGGGGCCGCTGTGGCCGCCGCGGGCCGGGCCCTggccggc                   >  1:1826810/1‑101 (MQ=17)


                                                                                   gggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccggc                   >  2:3528084/1‑101 (MQ=255)


                                                                                    ggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccggcc                  >  1:1006313/1‑101 (MQ=255)


                                                                                      tccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAg                <  2:3709616/101‑1 (MQ=255)


                                                                                        cgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGAc              >  1:1163558/1‑101 (MQ=255)


                                                                                             gATCCGTCGGACCCGGTGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGcc         <  2:2869918/101‑1 (MQ=38)


                                                                                                cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCGcc      >  1:410366/1‑100 (MQ=255)


                                                                                                cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCGca      >  1:2957235/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCGca      >  1:2573384/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                  gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCGcagc    <  1:2213358/101‑1 (MQ=255)


                                                                                                   tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCGcagcc   <  1:1975276/101‑1 (MQ=255)


TCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCGCAGCCC  >  NC_014034/221999‑222199

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG