Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_014034 | 1,951,528 | 2 bp→GC | 100% | coding (65‑66/528 nt) | ssb1 ← | single‑stranded DNA‑binding protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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* | NC_014034 | 1,951,528 | 0 | C→G | 100.0% | 576.7 | 155 | T22T (ACG→ACC) | ssb1 | single‑stranded DNA‑binding protein |
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* | NC_014034 | 1,951,529 | 0 | G→C | 100.0% | 571.9 | 155 | T22R (ACG→AGG) | ssb1 | single‑stranded DNA‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (56/99): ref base (0/0): total (56/99) |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
CATTCGGTGCGCTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAACGTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGACCCG > NC_014034/1951433‑1951623
||
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ttCGGTGCGCTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCa < 1:2725935/101‑1 (MQ=255)
tCGGTGCGCTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCAc > 2:3615815/1‑101 (MQ=255)
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cTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTcgc > 2:893007/1‑101 (MQ=255)
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tCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAg > 1:3919741/1‑101 (MQ=255)
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cccGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGtt < 1:105004/101‑1 (MQ=255)
ccGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTg < 1:1828096/101‑1 (MQ=255)
gATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGcc > 1:1597107/1‑101 (MQ=255)
aTTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGccc < 2:360605/101‑1 (MQ=255)
ttGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCcca < 1:1105859/101‑1 (MQ=255)
gCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCccacc < 2:3856472/101‑1 (MQ=255)
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cTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCccacca < 2:2857750/101‑1 (MQ=255)
ttGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAg < 2:3431915/101‑1 (MQ=255)
tGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGa < 1:2088359/101‑1 (MQ=255)
tGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGa > 2:2307674/1‑101 (MQ=255)
cgcgCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATg > 2:1707987/1‑101 (MQ=255)
cgcgCCAGGTCTCCGAGGGGGCGATGCGCAGGTTGCAGCCCTTCCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCCCCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATg < 2:3847518/101‑1 (MQ=255)
cgggTATCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCtt < 2:1344867/99‑1 (MQ=255)
cAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCtt < 1:38705/101‑1 (MQ=255)
cAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCtt < 1:443496/101‑1 (MQ=255)
cAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCtt > 2:2799172/1‑101 (MQ=255)
cAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCtt < 2:1913980/101‑1 (MQ=255)
cAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCtt > 2:4129420/1‑101 (MQ=255)
ggTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGt > 2:235590/1‑101 (MQ=255)
ggTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGt < 2:2184966/101‑1 (MQ=255)
gTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGtt < 1:1850776/101‑1 (MQ=255)
tctcCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTc < 1:1624800/101‑1 (MQ=255)
ctcCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGCCCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCa < 1:24078/101‑1 (MQ=255)
ctcCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCa < 1:4168203/101‑1 (MQ=255)
tgcGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTCCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCAc < 2:1079737/99‑1 (MQ=255)
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ccGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCAcc < 2:1236937/101‑1 (MQ=255)
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ttGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACtctc < 1:2521350/101‑1 (MQ=255)
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gACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCCCCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAg < 2:1584004/101‑1 (MQ=255)
aCCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCTCGTAGCGCCCGAGGTTGCCCACCCGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGt < 1:3616068/101‑1 (MQ=255)
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cTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGGCCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTgg < 2:3108947/101‑1 (MQ=255)
cTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTgg > 2:3327646/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGcc > 1:1417725/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGcc > 1:3302443/1‑101 (MQ=255)
cgccATTGGCGAAGCTGCGCCCCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGa < 1:1946120/101‑1 (MQ=255)
cgccATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGa > 1:2837162/1‑101 (MQ=255)
gccATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAg > 1:4808/1‑101 (MQ=255)
ccATTGGCGAAGCTGCGCGCCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGc < 2:2948602/101‑1 (MQ=255)
ccATTGGCGAAGCTGCGCCCCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGc < 1:1656699/101‑1 (MQ=255)
ccATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGc < 1:2898076/101‑1 (MQ=255)
cATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCg > 1:2857528/1‑101 (MQ=255)
ttGGCGAAGCTGCGCCCCTCCGGGTCGCGCCCCAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGAc < 2:3323595/101‑1 (MQ=255)
ttGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGAc < 2:437246/101‑1 (MQ=255)
ggCGAAGCTGCGCCCCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGAccc < 1:2115145/101‑1 (MQ=255)
gCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGACCCg < 2:4001060/101‑1 (MQ=255)
||
CATTCGGTGCGCTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAACGTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGACCCG > NC_014034/1951433‑1951623
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 19 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|