Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 2,141,322 | 2 bp→GC | 100% | coding (291‑292/1674 nt) | RCAP_rcc01984 → | phage terminase large subunit |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 2,141,322 | 0 | C→G | 100.0% | 625.6 | 165 | G97G (GGC→GGG) | RCAP_rcc01984 | phage terminase large subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (62/103): ref base (0/0): total (62/103) | ||||||||||
* | NC_014034 | 2,141,323 | 0 | G→C | 100.0% | 585.7 | 157 | M98M (GTG→CTG) | RCAP_rcc01984 | phage terminase large subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (54/103): ref base (0/0): total (54/103) |
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
CATACGGTCGGCCCGATGGCGGGCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGCGTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTGTTCACCCAGCTTCTGGA > NC_014034/2141224‑2141417
||
atctCGGCCCGATGGGGGGAAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTgcgc < 2:3212308/98‑1 (MQ=255)
ggTCTGTCCGATGGCGGGCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CCGGGGTGCGcc > 2:116402/1‑101 (MQ=255)
tCGGCCCGATGGCGGGCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCgg > 1:1677434/1‑101 (MQ=255)
cGGCCCGATGGCGGGCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCggg > 1:808923/1‑100 (MQ=255)
ggctgagggCGGGGAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTc < 2:3136075/94‑1 (MQ=255)
gCCCGAGGGCGGGCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTc < 2:3066787/101‑1 (MQ=255)
ctgATGGCGGGAAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCg < 2:3945816/99‑1 (MQ=255)
cGATGGCGGGCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGc > 1:17064/1‑101 (MQ=255)
gggggCGGGAAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCt < 1:1850856/98‑1 (MQ=255)
gATGGCGGGCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGGGGCGGGTCCGCt > 1:3582807/1‑101 (MQ=255)
gATGGCGGGCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGGTCCGCt > 1:2573790/1‑101 (MQ=255)
gtGGGGGGCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTc < 2:2487165/100‑1 (MQ=255)
ggggggggCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTc < 1:3426983/96‑1 (MQ=255)
aTGGCGGGCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTc < 1:2756179/101‑1 (MQ=255)
tGGCGGGCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCg > 1:2050192/1‑101 (MQ=255)
tGGCGGGCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCg < 1:121274/101‑1 (MQ=255)
gCGGGGAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCGTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGAc < 2:584596/101‑1 (MQ=255)
gggCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCt > 2:3869024/1‑101 (MQ=255)
gggCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGGTCCGCTCGACCt > 1:71141/1‑101 (MQ=255)
ggCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTa < 2:887338/101‑1 (MQ=255)
gCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAt < 2:1742873/101‑1 (MQ=255)
gCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAt < 1:247334/101‑1 (MQ=255)
cAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.c > 1:3155446/1‑101 (MQ=255)
aaGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.Ca < 1:2550110/101‑1 (MQ=255)
aaGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.Ca < 1:1118088/101‑1 (MQ=255)
aGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CAc < 2:3299630/101‑1 (MQ=255)
gCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CAcc < 2:2881655/101‑1 (MQ=255)
gCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CAcc > 1:1897920/1‑101 (MQ=255)
gCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAgg < 1:426936/101‑1 (MQ=255)
cTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTAGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCCAT.CACCAggc > 2:379744/1‑100 (MQ=255)
ggAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCg < 1:944003/101‑1 (MQ=255)
ggAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCg > 2:2218770/1‑101 (MQ=255)
aGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGGAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTGGGCCTCT.CACCAGGGCGGc > 1:3952896/1‑101 (MQ=255)
gCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCa < 2:3582554/101‑1 (MQ=255)
gCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCa < 1:3241667/101‑1 (MQ=255)
gCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCa > 1:2815790/1‑101 (MQ=255)
cTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCaa < 2:132408/101‑1 (MQ=255)
cTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTACGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCaa > 1:3553020/1‑101 (MQ=255)
tGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCaag < 1:2928715/101‑1 (MQ=255)
tGCAGCCCTGGCAGGCGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGTAGCGCCAAGGCTCCGGGCCT.CGCCGGTCCCGGTCGACCTATCCACCA.GTCGGCgag > 2:2428807/1‑101 (MQ=255)
gCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGGCGGCaaga > 2:526983/1‑101 (MQ=255)
cAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCaagaa > 1:3133135/1‑101 (MQ=255)
aGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCaagaag < 2:1192752/101‑1 (MQ=255)
aGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCaagaag < 1:2116903/101‑1 (MQ=255)
gCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAagaaga < 2:2224122/101‑1 (MQ=255)
cccTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAgaagaa > 1:371781/1‑101 (MQ=255)
cccTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAgaagaa < 1:946740/101‑1 (MQ=255)
ccTGGCAGGTGTTCCGGGATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAAc < 1:558069/101‑1 (MQ=255)
ccTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAAc < 2:1020909/101‑1 (MQ=255)
cTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACg < 2:2922566/101‑1 (MQ=255)
cTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACg > 2:1924646/1‑101 (MQ=255)
ggCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGGACGGc > 2:802595/1‑101 (MQ=255)
ggCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGc > 1:2343017/1‑101 (MQ=255)
ggCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGAGCGAAGGCT.CGGGGCTGCCCCGGGTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGc > 2:707407/1‑101 (MQ=255)
gCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCa < 1:919689/101‑1 (MQ=255)
cAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCaa < 2:3360148/101‑1 (MQ=255)
cAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCaa < 2:1433779/101‑1 (MQ=255)
aGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTTCGCTCGACCTAT.TATCAGGTCGGCAAGAAGAAGGGCaaa > 2:1703753/1‑100 (MQ=255)
ggTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGa < 1:1508241/101‑1 (MQ=255)
gtgtTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGac < 2:460218/101‑1 (MQ=255)
tCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGaccacc < 2:84278/101‑1 (MQ=255)
tCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGaccacc < 1:3170283/101‑1 (MQ=255)
tCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGaccacc < 2:1897800/101‑1 (MQ=255)
ggCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGAt < 1:86510/101‑1 (MQ=255)
cATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGAtcc > 1:1410002/1‑99 (MQ=255)
cATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATAc < 1:4007240/101‑1 (MQ=255)
ggCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACcgc < 1:3471522/101‑1 (MQ=255)
gCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACcgcg < 2:3026210/101‑1 (MQ=255)
tCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGt > 1:620263/1‑101 (MQ=255)
cGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTg > 1:1102393/1‑101 (MQ=255)
cGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTg < 2:2970838/101‑1 (MQ=255)
cGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTg > 2:2836441/1‑101 (MQ=255)
gTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGcc > 1:1350783/1‑101 (MQ=255)
gTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGcc < 2:1559336/101‑1 (MQ=255)
gTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGcc < 1:501734/101‑1 (MQ=255)
tCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCa > 1:1230578/1‑101 (MQ=255)
tCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCa > 2:3156484/1‑101 (MQ=255)
tttGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAAt < 1:3667871/101‑1 (MQ=255)
tttGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAAt > 2:3677706/1‑101 (MQ=255)
tttGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAAt > 1:1416513/1‑101 (MQ=255)
ttGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATg > 1:663324/1‑101 (MQ=255)
ttGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATg < 2:2725054/101‑1 (MQ=255)
tGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGc < 2:2955155/101‑1 (MQ=255)
ggCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCt > 2:4031531/1‑101 (MQ=255)
gCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTg < 1:871665/101‑1 (MQ=255)
tGGAAGCGCGAAGGCT.CTGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTGtt < 2:3807821/101‑1 (MQ=255)
ggAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTGTTc < 1:2836660/101‑1 (MQ=255)
gAAGCGCGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CCCCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCGAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTGTTCa < 1:1879786/101‑1 (MQ=255)
gcgcGAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTGTTCAccc < 2:129149/101‑1 (MQ=255)
cgcgCAGGCT.CGGGGCTGCGCCTGTTCTGCTCGAACTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGACACCGCGGTGCCAATGCTGTTCACCCa < 2:2114783/101‑1 (MQ=255)
cgcgAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTGTTCACCCa < 2:3496660/101‑1 (MQ=255)
gcgAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTGTTCACCCAg < 2:2522728/101‑1 (MQ=255)
gAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTGTTCACCCAGCt < 1:546059/101‑1 (MQ=255)
gAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTGTTCACCCAGCt > 2:2080010/1‑101 (MQ=255)
gAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTGTTCACCCAGCt > 2:2556375/1‑101 (MQ=255)
gAAGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTGTTCACCCAGCt > 2:1501138/1‑101 (MQ=255)
aGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTGTTCACCCAGCTTc > 1:462694/1‑101 (MQ=255)
aGGCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTGTTCACCCAGCTTc < 2:1230482/101‑1 (MQ=255)
ggCT.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTGTTCACCCAGCTTCt < 2:1595245/101‑1 (MQ=255)
t.CGGGGCTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTGTTCACCCAGCTTCTGGa > 2:1591826/1‑101 (MQ=255)
||
CATACGGTCGGCCCGATGGCGGGCAAGCCGCTGGAGCTGCAGCCCTGGCAGGTGTTCCGGCATGGCTCGGTCTTTGGCTGGAAGCGCGAAGGCT.CGGGCGTGCGCCGGTTCCGCTCGACCTAT.CACCAGGTCGGCAAGAAGAACGGCAAGACCACCGATACCGCGGTGCCAATGCTGTTCACCCAGCTTCTGGA > NC_014034/2141224‑2141417
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|