| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,823,740 | +C | 100% | intergenic (+25/‑148) | RCAP_rcc01687 → / → RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,823,740 | 1 | .→C | 100.0% | 62.7 | 163 | intergenic (+25/‑148) | RCAP_rcc01687/RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (92/50): ref base (0/21): total (92/71) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.76e-09 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.78e-03 | ||||||||||
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
TATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGC > NC_014034/1823641‑1823832
|
aTGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCC.A.cc > 2:2180911/1‑101 (MQ=255)
aTGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.cc < 1:761590/101‑1 (MQ=255)
gCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.cccc < 1:4096377/101‑2 (MQ=255)
gCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.cccc < 1:2284758/101‑2 (MQ=255)
cGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.ccccg > 2:3818134/1‑99 (MQ=255)
cGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.ccccg < 2:1903127/101‑3 (MQ=255)
naNNANNCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.ccccgn < 1:1906454/100‑4 (MQ=255)
gAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.ccccgg > 2:567850/1‑98 (MQ=255)
gAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.ccccgg > 2:4305762/1‑98 (MQ=255)
aGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.ccccggc > 2:4273405/1‑97 (MQ=255)
aGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.ccccggc < 1:2107648/101‑5 (MQ=255)
gCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.ccccggct > 2:2163568/1‑96 (MQ=255)
cGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTgccgc > 1:1092621/1‑101 (MQ=255)
gggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTgccgcc > 1:1344084/1‑101 (MQ=255)
gggGGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTgccgcc < 1:3200571/101‑1 (MQ=255)
gTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCgg > 1:3126773/1‑101 (MQ=255)
gTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCgg > 2:23358/1‑101 (MQ=255)
gggCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGtt < 1:4453007/101‑1 (MQ=255)
gggCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGtt < 1:322163/101‑1 (MQ=255)
cggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGc > 1:1059961/1‑101 (MQ=255)
ggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGcc > 1:906717/1‑101 (MQ=255)
ggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGcc > 1:486132/1‑101 (MQ=255)
ggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGcc > 2:3505764/1‑101 (MQ=255)
cgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCgg < 1:3818419/101‑1 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGt > 1:296006/1‑101 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGt > 2:3804617/1‑101 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGAA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGt > 1:3703244/1‑101 (MQ=255)
aTGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTc < 2:2606297/101‑1 (MQ=255)
tGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcg < 2:4639916/101‑1 (MQ=255)
tCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGGCGGGcggg > 2:3593572/1‑101 (MQ=255)
tCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcggg < 2:4538527/101‑1 (MQ=255)
aGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGTCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggcg > 1:1966890/1‑101 (MQ=255)
aGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggcg < 2:2269787/101‑1 (MQ=255)
gCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggcgg > 2:3149198/1‑101 (MQ=255)
gCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggcgg < 2:4014852/101‑1 (MQ=255)
cGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggcggg > 2:1146035/1‑101 (MQ=255)
cGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggcggg > 1:4387853/1‑101 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCgggcgggc < 2:3370615/101‑1 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCgggcgggc > 1:3069600/1‑101 (MQ=255)
aTTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGggcgggcg < 1:2524037/101‑1 (MQ=255)
tttCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgc > 1:1807454/1‑101 (MQ=255)
tttCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgc > 1:2919881/1‑101 (MQ=255)
ttCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcg > 2:2244217/1‑101 (MQ=255)
cgccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcggg > 1:1423381/1‑101 (MQ=255)
cgccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcggg > 2:4352849/1‑101 (MQ=255)
gccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcgggc > 2:1038902/1‑101 (MQ=255)
cgctATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCtt < 1:3603489/101‑1 (MQ=255)
cgcgATCAAGCTGTGGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCtt < 2:3613512/101‑1 (MQ=255)
gcgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTc < 1:2250418/101‑1 (MQ=255)
cgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTcc > 1:2431666/1‑101 (MQ=255)
cgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTcc < 2:2862855/101‑1 (MQ=255)
gATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCg > 2:2754416/1‑101 (MQ=255)
gATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGAGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGCCGGGCGGGAGCCGGCGTCCg > 2:1348609/1‑101 (MQ=255)
tCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGc > 2:4181066/1‑101 (MQ=255)
tCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGc > 1:163087/1‑101 (MQ=255)
aaGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCg < 1:2765483/101‑1 (MQ=255)
aaGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCg > 2:3094592/1‑101 (MQ=255)
gCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCt < 2:1946393/101‑1 (MQ=255)
tGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGc > 2:3702074/1‑101 (MQ=255)
tGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGc > 1:4641359/1‑101 (MQ=255)
gTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGcc > 1:2137507/1‑101 (MQ=255)
tGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGGGGTGAAGGGGCGGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTa < 1:824373/101‑1 (MQ=255)
aaGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgc < 1:3779448/101‑1 (MQ=255)
aaGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgc > 1:4199079/1‑101 (MQ=255)
attttGCCGCCTCGTAAGGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgct < 1:23363/99‑1 (MQ=255)
aGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgct < 2:1807328/101‑1 (MQ=255)
aGTTTCCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCGGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgct < 2:2925330/101‑1 (MQ=255)
gTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctg > 1:892736/1‑101 (MQ=255)
tttGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgc > 1:3044813/1‑101 (MQ=255)
tttGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgc > 2:238805/1‑101 (MQ=255)
ttGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgct > 1:4580012/1‑101 (MQ=255)
gccgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctcc > 1:2534990/1‑101 (MQ=255)
cgccTCGTAGCGGGCGGGGAGGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccct < 2:833655/101‑1 (MQ=255)
cgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccct > 2:2633546/1‑101 (MQ=255)
cgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccct < 1:620312/101‑1 (MQ=255)
cgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCACCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctcccc > 2:661785/1‑100 (MQ=255)
ccTCGTAGCGGGGGGTGAAGGGGCGGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctcc < 1:983688/101‑1 (MQ=255)
ccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctcc < 1:1146127/101‑1 (MQ=255)
ccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctcc < 1:1509339/101‑1 (MQ=255)
cTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccg > 1:1210347/1‑101 (MQ=255)
gTACCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc < 2:367258/101‑1 (MQ=255)
gTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCTGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc < 2:1092532/101‑1 (MQ=255)
gTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc > 2:1341991/1‑101 (MQ=255)
tAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGCCGGGCGCGCCCTTCCGGCCGCCGCCTAGCTGCCCCCtccgtccc > 2:1863396/1‑100 (MQ=255)
aaCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGa > 2:1512051/1‑101 (MQ=255)
aggggCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAg < 2:1722037/99‑1 (MQ=255)
gggCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTg < 2:3213361/101‑1 (MQ=255)
ggCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTgg < 1:1165525/101‑1 (MQ=255)
ggTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCgg > 1:681409/1‑101 (MQ=255)
tGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTg > 2:3416523/1‑101 (MQ=255)
gAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGc > 1:4562302/1‑101 (MQ=255)
gAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGGGc > 2:1319161/1‑101 (MQ=255)
aaGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCg > 1:3657296/1‑101 (MQ=255)
aGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCgg < 1:3473901/101‑1 (MQ=255)
cGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTg < 2:3381246/101‑1 (MQ=255)
cGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTg > 2:879192/1‑101 (MQ=255)
cGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTg < 1:2181061/101‑1 (MQ=255)
cGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTg > 2:3342723/1‑101 (MQ=255)
cGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGGCTg > 1:3586378/1‑101 (MQ=255)
gggggCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGGCTgc > 1:554808/1‑101 (MQ=255)
|
TATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGC > NC_014034/1823641‑1823832
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 25 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|