Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,948,851 | +G | 89.3% | coding (1069/2472 nt) | quiP ← | acyl‑homoserine‑lactone acylase |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,948,851 | 1 | .→G | 89.3% | 69.3 ‑0.7 ‑0.7 | 214 | coding (1069/2472 nt) | quiP | acyl‑homoserine‑lactone acylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (98/93): ref base (10/13): total (108/106) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.15e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.81e-01 |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
TGATCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.GC.C.C.ACCCTCGGGGCTGCGGTA.CGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATGC > NC_014034/1948751‑1948943
|
gATCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.g < 2:3805757/101‑1 (MQ=255)
gATCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.g > 2:2493699/1‑101 (MQ=255)
aTCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.gg > 1:1582872/1‑100 (MQ=255)
tCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.ggc > 2:4132645/1‑99 (MQ=255)
ccGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Gg.c.c > 2:1195203/1‑101 (MQ=255)
ccGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Gg.c.c < 1:2538980/101‑1 (MQ=255)
gACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Gg.c.cca > 1:1556867/1‑99 (MQ=255)
gACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Gg.c.cca > 2:1535181/1‑99 (MQ=255)
gACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.GG.C.C.aa > 2:3573970/1‑100 (MQ=255)
aCGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Gg.c.ccaa > 2:303913/1‑98 (MQ=255)
gcagcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Gg.c.ccaaccc < 2:863988/101‑7 (MQ=255)
gcagcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Gg.c.ccaaccc < 2:2482048/101‑7 (MQ=255)
gcagcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Gg.c.ccaaccc < 1:4506986/101‑7 (MQ=255)
agcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Gg.c.ccaaccctc < 2:1424265/101‑9 (MQ=255)
agcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Gg.c.ccaaccctc > 1:969621/1‑93 (MQ=255)
agcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Gg.c.ccaaccctc < 1:783156/101‑9 (MQ=255)
caCCGGGCCTTTTTCGGTCGAGCTGAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCgg < 1:2363194/101‑1 (MQ=255)
ccGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCgggg > 2:561933/1‑101 (MQ=255)
cGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGc > 2:3371743/1‑101 (MQ=255)
cGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGc > 1:3711307/1‑101 (MQ=255)
ggCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTg < 2:3641741/101‑1 (MQ=255)
gCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGc < 1:2046592/101‑1 (MQ=255)
gcGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCg < 2:1118393/100‑1 (MQ=255)
ccGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCg > 2:222389/1‑101 (MQ=255)
ccGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCGTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCg > 1:3246214/1‑101 (MQ=255)
gTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGt < 2:189353/101‑1 (MQ=255)
gTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGt > 2:276323/1‑101 (MQ=255)
gTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGt < 2:1636842/101‑1 (MQ=255)
gTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGt < 1:190893/101‑1 (MQ=255)
ttttCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTa < 1:3649890/101‑1 (MQ=255)
ttttCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTa > 2:3454408/1‑101 (MQ=255)
gtttCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTa < 1:1489068/100‑1 (MQ=255)
ttCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTagc > 1:3207408/1‑99 (MQ=255)
cGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATTGGCGCGGCATCCTTGGCCATGAGGATAATTTTGCGGGGGGGGAGCTC.GC.CTCAACCCTCGGGGCTGCGGTA.ccgc > 1:3863177/1‑98 (MQ=255)
cGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTagcgc > 2:492467/1‑97 (MQ=255)
tCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCg < 1:1195295/101‑1 (MQ=255)
tCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCg > 2:800510/1‑101 (MQ=255)
gccAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCg < 1:3452724/100‑1 (MQ=255)
aGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGc > 2:1968255/1‑101 (MQ=255)
cgcAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGt < 2:172477/101‑1 (MQ=255)
tcAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGtt < 1:4359395/100‑1 (MQ=255)
gcAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCgct > 2:4510772/1‑99 (MQ=255)
gcAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGtt < 2:374463/101‑1 (MQ=255)
cAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGtta > 2:4359103/1‑100 (MQ=255)
cAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCAGCCTTTTCCGTGACGATCACCTTGCGTGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGttt < 1:545223/101‑1 (MQ=255)
agggtgagggtgATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGtttt > 2:3938271/1‑101 (MQ=255)
agggtgagggtgATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGtttt > 1:827997/1‑101 (MQ=255)
agggtgagggtgATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGtttt > 1:3531067/1‑101 (MQ=255)
agggtgagggtgATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGtttt < 1:2870459/101‑1 (MQ=255)
gggtgagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTc < 1:2177087/101‑1 (MQ=255)
ggtgagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCg > 1:2822675/1‑101 (MQ=255)
gtgagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCgg < 1:4590957/101‑1 (MQ=255)
agggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCTC.A.ACCCTCGGGCATGCGGTAGCGCTCGGGCGTCTTCGGGTc > 1:2310665/1‑101 (MQ=255)
agggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATc > 2:2410187/1‑101 (MQ=255)
gggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCa > 2:3107734/1‑101 (MQ=255)
ggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCaa < 1:3312781/101‑1 (MQ=255)
tgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGt > 2:3346285/1‑101 (MQ=255)
aTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTc < 2:2944437/101‑1 (MQ=255)
aTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCAGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTc > 2:2745254/1‑101 (MQ=255)
ggCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTc < 1:1003814/101‑1 (MQ=255)
ggCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTc < 1:4127360/101‑1 (MQ=255)
gcgcGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTcg > 1:4482967/1‑101 (MQ=255)
cgcgGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAgaaatcgga < 2:4669035/101‑9 (MQ=255)
cgGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTcgacg < 2:2028806/101‑1 (MQ=255)
ggCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTcgacga < 2:359776/101‑1 (MQ=255)
gCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTGGACGaa > 1:4330041/1‑101 (MQ=255)
gCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGaa > 2:1755630/1‑101 (MQ=255)
gCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGGAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGaa > 1:1338101/1‑101 (MQ=255)
cATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAAc < 1:2493865/101‑1 (MQ=255)
aTCCTTGACCGTGCCGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACa < 1:3107978/101‑1 (MQ=255)
aTCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACa > 2:1604694/1‑101 (MQ=255)
aTCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACa < 2:3542887/101‑1 (MQ=255)
tCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAAccg > 1:853838/1‑99 (MQ=255)
tCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAg > 2:1314648/1‑101 (MQ=255)
cTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAggc > 2:592835/1‑100 (MQ=255)
cTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGt > 2:2614802/1‑101 (MQ=255)
ttGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTc < 1:2270491/101‑1 (MQ=255)
tGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTcc > 1:1877008/1‑101 (MQ=255)
tGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTcc < 2:3409746/101‑1 (MQ=255)
tGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTcc < 2:2532785/101‑1 (MQ=255)
gACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCt < 2:460980/101‑1 (MQ=255)
gACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCt < 2:2701191/101‑1 (MQ=255)
aCCGTGACGATCACCTTTCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTc < 2:4185869/101‑1 (MQ=255)
aCCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTc < 2:1857045/101‑1 (MQ=255)
cGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGt > 1:1029920/1‑101 (MQ=255)
tGACGATCACCCTGCGGGTGGTGAACTCGGCTC.A.ACCCTCGGTGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCa < 2:2310503/101‑1 (MQ=255)
gACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCAt > 1:472281/1‑101 (MQ=255)
gATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCgg > 2:2129697/1‑101 (MQ=255)
tCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCg < 2:4170746/101‑1 (MQ=255)
tCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCg < 1:462269/101‑1 (MQ=255)
tCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCg > 1:3585923/1‑101 (MQ=255)
tCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGAGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCg < 1:3391500/101‑1 (MQ=255)
cTTGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAgg > 1:4198327/1‑101 (MQ=255)
tGCGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAggcg < 1:587935/101‑1 (MQ=255)
cGGGTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATTAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAggcggc > 2:1835360/1‑101 (MQ=255)
gggTGGTGAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGgcggcg > 1:1664412/1‑101 (MQ=255)
gtggtgAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGt < 2:3138152/101‑1 (MQ=255)
gatctgAACTCGGC.C.CAACCCGCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGt < 1:2237125/97‑1 (MQ=255)
gAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATGc > 2:40874/1‑101 (MQ=255)
gAACTCGGC.C.CAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATGc > 1:3766613/1‑101 (MQ=255)
|
TGATCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.GC.C.C.ACCCTCGGGGCTGCGGTA.CGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATGC > NC_014034/1948751‑1948943
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|