| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,006 | 0 | C→G | 1.7% | 34.2 ‑3.0 ‑2.2 | 1519 | T217T (ACG→ACC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (20/7): ref base (797/693): total (818/701) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.95e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.94e-03 | ||||||||||
Only 100 of 1873 total aligned reads displayed.
TCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCG > NC_014034/221906‑222106
|
tggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 2:2215950‑M1/51‑101 (MQ=255)
gggatcggttggttccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:3959772‑M1/38‑101 (MQ=255)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg < 2:3532313‑M1/66‑1 (MQ=255)
gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt > 1:1382864‑M1/35‑101 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGgatcggtcggat < 1:3191860‑M1/67‑3 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGggtccgtcggat < 1:1070100‑M1/67‑3 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc > 1:1175066‑M1/34‑101 (MQ=255)
tCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc > 1:2264815/1‑101 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCg < 2:1286208‑M1/70‑1 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCg < 2:4290350‑M1/70‑1 (MQ=255)
gtcgggtccgtcggatcggtcgggcccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 2:2655668‑M1/31‑101 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtggt < 1:3088124‑M1/74‑2 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:2755861‑M1/76‑1 (MQ=255)
gccgtgggagcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 1:596901‑M1/25‑101 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg > 1:1968992‑M1/24‑101 (MQ=255)
tgggatccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 2:1762241‑M1/21‑101 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg > 1:1670108‑M1/19‑101 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg > 1:4625681‑M1/19‑101 (MQ=255)
atcggtcgggtccggtGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGgatcggtcgggt > 1:3853090‑M1/17‑99 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc > 1:3979980‑M1/15‑101 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTgggatcggtcggggcc < 2:3643164‑M1/87‑5 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCg < 1:538758‑M1/88‑1 (MQ=255)
gCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTcggg < 2:821425/101‑2 (MQ=11)
gtgcgtccgATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCAGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt < 1:1823649/97‑1 (MQ=11)
gtccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 1:2118693/94‑1 (MQ=11)
gggcgtgggatcggtcgggaccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 2:237256/94‑1 (MQ=11)
tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:3347650/101‑1 (MQ=255)
tcctggggagcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc < 1:2445630/95‑1 (MQ=11)
ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg < 2:1415952‑M1/96‑1 (MQ=255)
cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg < 1:3649362‑M1/97‑1 (MQ=255)
tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 1:441898‑M1/3‑101 (MQ=255)
tgGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 2:3808875‑M1/3‑101 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGCtcggcgg > 1:39275/2‑98 (MQ=14)
gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTAGGATCGGGCGGGTCGCGGGTAtcggtag > 2:208437/2‑99 (MQ=14)
ggcagctgtcgtgtccgctggttcggtcgagtccgtggggtccGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 2:3896714/94‑1 (MQ=1)
gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 1:2831648‑M1/100‑1 (MQ=255)
gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 2:3265250‑M1/100‑1 (MQ=255)
cggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTACACTCGGTCGGGGCCGTGGGATGGGTCGGGTCAGTTGGAtcggtcg > 2:746382/1‑101 (MQ=11)
ggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCggg < 1:1599715/99‑1 (MQ=14)
gtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGGCGGGGCCGTGGGATCGGCCGGGCCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCgggc > 1:2691363/5‑100 (MQ=11)
atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat > 1:3798115/1‑99 (MQ=11)
tcgggcgggtcggtgggatcggtcgggtccgtggggTCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGATc < 2:1522001/101‑1 (MQ=11)
tccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCgggac > 2:4634602/4‑99 (MQ=11)
tggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCTGTCTGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 2:3710024/100‑1 (MQ=11)
gtgtcggcggcgtcggaccggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc < 2:4550084/91‑1 (MQ=11)
cggtcgtgtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc < 2:42023/101‑1 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCTTGGGAACGGCCGGGTcg > 2:1036319/1‑100 (MQ=11)
cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 1:1286301/101‑1 (MQ=11)
gggcgggtccgggggagcggtcgggtccgggggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 1:1736066/98‑1 (MQ=11)
gtcgtgtccgtgggttcggtcgggtcggtcggatcgGTGGGATCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGt < 2:2709436/101‑1 (MQ=11)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAGCCGTGGGATCCGAGGGATCGGTCGGGTGCgg > 2:4371852/1‑100 (MQ=14)
gcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg > 1:4371261‑M2/2‑100 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 1:2357075‑M2/101‑3 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCgcgg > 1:4149193/1‑98 (MQ=11)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg > 1:2636330/1‑99 (MQ=11)
gggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAACGGGCGGGGCCGTGGGAACGGGCggggacgttgg > 2:1594157/1‑93 (MQ=11)
ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg < 2:2003864/98‑1 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga < 1:763490‑M2/101‑5 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGATCAGTGGGGTCGGTCGGGTCCgggggg > 2:2776408/1‑96 (MQ=14)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtggGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGggg > 1:2550950/1‑100 (MQ=11)
gtccgttgggtccttcggatccgtgggaccggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 2:3189754/101‑1 (MQ=11)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat > 1:3000811‑M2/1‑96 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat > 2:4054384‑M2/1‑96 (MQ=255)
gcccgtgggatcggccggggccgtggggtcggtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:943611/99‑1 (MQ=11)
atccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTCGTTGGGTTCCGTGGGac > 1:2196735/2‑100 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc > 1:3714240‑M2/1‑95 (MQ=255)
tccgggggatcgggcggatccgtgggagcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:848557/101‑1 (MQ=11)
ccgtgggatctgtcgagtcggggggatcggtcggAGCGGTGGGATCGGTCGGATGCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg < 2:925745/101‑1 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGACCGGTCGGGTCGGTGgggccgg > 2:2572915/1‑96 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTgggatcgg < 2:302227‑M2/101‑9 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAtcggg > 2:583252/1‑100 (MQ=14)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGACCGGTCGGCTCCGTGGCAtccgt > 1:3450751/1‑101 (MQ=11)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc < 2:2456202‑M2/101‑11 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGAGGGATCGGACGGATCCGTTGGCtcggtggg > 1:49218/1‑101 (MQ=11)
tcggtcgggtccgtggaatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtc < 1:4075399‑M2/101‑16 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc < 2:284395/101‑1 (MQ=11)
cggtcggggccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc > 1:4266743‑M2/1‑85 (MQ=255)
ggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg < 2:1139393‑M2/101‑18 (MQ=255)
tcgggtccgtgggctccttcggAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtg < 2:4448679/101‑2 (MQ=11)
gggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg > 2:3435741‑M2/1‑80 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatcggtggg < 1:2034988‑M2/101‑22 (MQ=255)
gatccgtaggatgggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg < 1:1003866/99‑1 (MQ=11)
atccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggat > 2:3105685‑M2/2‑78 (MQ=255)
atccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTTGGATCGgtcggttccgctgtac > 2:230767/2‑95 (MQ=11)
cgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcgg < 1:3539317‑M2/101‑27 (MQ=255)
gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTtgggtccgcggggtccgt > 2:1229194/1‑101 (MQ=11)
tggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtc < 1:1509584/101‑2 (MQ=11)
ggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg < 1:1230420‑M2/101‑31 (MQ=255)
ggacccctgcgATCCTTGGGATTGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgg < 2:654023/91‑1 (MQ=1)
ggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGa < 2:4103016/96‑1 (MQ=11)
gtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAt < 1:3266964/100‑1 (MQ=11)
cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGGGCCGTCGGAtcg > 2:3339640/1‑101 (MQ=11)
ggtcggTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg < 2:1890066/101‑1 (MQ=14)
gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGTCCGTCGGAtccgt > 1:661608/1‑101 (MQ=11)
tcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAGCGGTCGGGGCCCGGGGGGCCGTCGGAtccgtg > 2:2924872/1‑100 (MQ=11)
cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:1673580/1‑101 (MQ=11)
cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTGCGGGGGGTCGGTGGGAtccgtgg > 2:521604/1‑99 (MQ=11)
gggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 1:4489765/4‑101 (MQ=14)
aTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATGGGTCGGGGCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtggtag > 2:2150563/1‑96 (MQ=11)
tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatc > 1:2913349‑M2/1‑59 (MQ=255)
|
TCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCG > NC_014034/221906‑222106
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|