| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,099 | 0 | C→G | 1.7% | 1.6 0.0 ‑0.0 | 338 | P186P (CCG→CCC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: E-value exceeds prediction threshold. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (3/4): ref base (153/177): total (157/181) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.97e-01 | ||||||||||
Only 100 of 450 total aligned reads displayed.
TCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCGCAGCCC > NC_014034/221999‑222199
|
tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc < 1:2497332/101‑1 (MQ=11)
tcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGGCCGGGGGGtcggtc > 2:2685974/1‑101 (MQ=14)
gcggGTCCGTAGGAATGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:2892977/100‑1 (MQ=14)
gggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 1:3931124/2‑101 (MQ=17)
cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:1673580/1‑101 (MQ=11)
cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 2:3925250/101‑1 (MQ=11)
cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCTGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 1:375875/101‑1 (MQ=14)
gggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTGGGGtcggtggg > 2:4495658/4‑101 (MQ=11)
gggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:2231590/98‑1 (MQ=11)
gggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 1:4489765/4‑101 (MQ=14)
ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcggg > 1:553197/3‑100 (MQ=11)
aTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAt > 1:284427/1‑101 (MQ=11)
cggTGGGATCCGTGGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 1:2776606/99‑1 (MQ=18)
ccGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:1792634/101‑1 (MQ=14)
ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg > 2:1417577/5‑101 (MQ=17)
ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg < 1:354585/97‑1 (MQ=18)
ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg > 2:2587096/5‑101 (MQ=17)
gTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTGCGTGGGATCGGGGGGGTGGGTGGGacaggg > 2:1583326/1‑96 (MQ=0)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgg > 2:201886/1‑100 (MQ=11)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt < 2:2816991/101‑1 (MQ=14)
tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGACCGGTCGGGTCCGTg > 2:4247650/1‑101 (MQ=11)
aggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCGGTgg > 1:1012627/2‑101 (MQ=14)
aggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg > 1:269421/2‑99 (MQ=14)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGCTCGGACGGGTCCGTtgg > 2:3890946/1‑101 (MQ=11)
ggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg > 1:4378585/1‑101 (MQ=14)
gtccgtggggTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 1:1673691/94‑1 (MQ=18)
aTCCGTGGGGTTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTAGGATCGGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 2:2472939/101‑1 (MQ=18)
aTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt > 1:1967427/1‑101 (MQ=255)
tccttggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:328885/95‑1 (MQ=255)
tccgcggggTCGGGGGGCTCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGGGGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:2925101/95‑1 (MQ=18)
cggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTCGGAtcg > 2:1040878/1‑101 (MQ=14)
cggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg < 2:483292/101‑1 (MQ=14)
cggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg > 1:3196325/1‑101 (MQ=14)
gtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGAtcggt > 1:2997382/1‑101 (MQ=14)
tcggGTCCGTTGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:69227/101‑1 (MQ=17)
tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 1:3435385/1‑101 (MQ=17)
tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 1:3236324/101‑1 (MQ=17)
ggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 2:1525304/100‑1 (MQ=255)
ctggTACGTAGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcg < 1:385430/99‑1 (MQ=14)
gggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTTGGGTCCGTCGGAtcggtcgg > 2:125608/1‑101 (MQ=17)
gggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGCCGGAtcggtccg > 1:1075131/1‑99 (MQ=14)
ggTCCGTGGGATCCGTCGGATCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg < 2:4081237/101‑1 (MQ=17)
atCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGt > 1:1538640/2‑101 (MQ=11)
tCCGTGGGTTCGGTGGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 2:4187192/101‑1 (MQ=14)
ccGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc < 1:1624718/101‑1 (MQ=17)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTcc < 2:527728/101‑1 (MQ=11)
cGTGGGATCTGGCGGACCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCg < 2:3319341/101‑1 (MQ=2)
gtcggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCCGGTCCGGGGGATGCGTCGGGGCGGTCGGGTCGGTCGGGTcctg > 2:3860010/4‑99 (MQ=9)
gTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 2:2156011/1‑101 (MQ=17)
tcggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTg > 1:2128067/3‑101 (MQ=17)
tcggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTg > 2:586547/3‑101 (MQ=18)
tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGta > 1:611778/1‑100 (MQ=17)
cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGgg > 2:1968857/2‑101 (MQ=17)
ggttctgtcggTTCGTTGGGATCGGTCGGGTCGCGGGGTACGCTCTGTTCCGATGGGTCGGTGGGATCGGTTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTagg < 2:295481/95‑1 (MQ=2)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 1:3043151/1‑101 (MQ=255)
gATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTagga < 1:476576/101‑2 (MQ=17)
gATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGCCGGGTCCGTggga > 1:2562321/1‑100 (MQ=17)
gtcggttggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGc < 1:722414/100‑1 (MQ=255)
gtcggtcggATCCGGGGGAGCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggat < 2:1830019/100‑3 (MQ=14)
aTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggat < 1:2634231/101‑3 (MQ=14)
tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGGGGCGGgggggc > 2:3472029/1‑99 (MQ=11)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtg > 1:3619714/1‑101 (MQ=255)
cggtcggATCCTTGCGATCGGTGGGGTCCGTGGCATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcg < 1:4023107/101‑5 (MQ=14)
gatctgATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgg < 1:4101320/96‑6 (MQ=11)
cgtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcgg < 1:1463148/97‑6 (MQ=14)
tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggtc > 1:937065/1‑94 (MQ=14)
tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc < 2:1766718/101‑8 (MQ=11)
tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc < 2:1183427/101‑8 (MQ=11)
tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc < 2:4149616/101‑8 (MQ=11)
tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCGGGCGGGTCCGTgggatcgggg > 1:2342895/1‑94 (MQ=14)
ggggggccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggtg < 1:4301950/95‑1 (MQ=255)
gATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCCGTgggatcgggcggg > 1:3674423/1‑91 (MQ=11)
tCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGCGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCGGTGGGTcggaagagcac > 1:4150096/1‑91 (MQ=1)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcgg < 2:2307456/101‑1 (MQ=255)
gttggctcggtccgGTCCGTTGGGCTGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggt < 2:2768828/95‑1 (MQ=18)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggt > 2:3130816/1‑101 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGGGGGAtcggt > 1:1254336/1‑101 (MQ=255)
ggATCGGTCGGGTTCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtcgg < 1:3128357/101‑1 (MQ=255)
ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGc > 2:90249/1‑101 (MQ=255)
gggTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTc < 2:936985/101‑1 (MQ=255)
gggTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGGCTGGTGGGGTCGGTCGGACAGCTggc > 2:848169/1‑99 (MQ=255)
gTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgc > 1:1347498/1‑101 (MQ=255)
cttgggctgtgtcgggtccgtcgggtccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgc < 2:3414121/91‑1 (MQ=255)
gTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgcc > 1:4563026/1‑101 (MQ=255)
gTAGGAGCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGCGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgcc < 2:2380150/101‑1 (MQ=255)
aTCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCgg < 2:2437736/101‑1 (MQ=255)
tcggtcggGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGa > 2:4435096/1‑101 (MQ=255)
ggtcggGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACa > 1:1991224/1‑101 (MQ=255)
tcgggtcggtggggtccgTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGa < 1:859293/101‑1 (MQ=255)
cgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggc > 2:3993224/1‑101 (MQ=255)
gggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccggc > 1:82323/1‑101 (MQ=255)
gtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCa > 1:2424171/1‑101 (MQ=255)
ccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGa > 2:459768/1‑101 (MQ=255)
ccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGa < 2:2207139/101‑1 (MQ=255)
cgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGAc < 2:3580332/101‑1 (MQ=255)
cgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGAc > 2:3254156/1‑101 (MQ=255)
ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGc < 1:4236778/101‑1 (MQ=255)
aTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCg < 2:3655624/101‑1 (MQ=255)
aTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCg > 1:458952/1‑101 (MQ=255)
tcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGcccg < 2:3042907/101‑3 (MQ=255)
|
TCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCGCAGCCC > NC_014034/221999‑222199
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|