Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 2,123,404 | A→G | 3.6% | P256P (CCT→CCC) | wza ← | polysaccharide export protein Wza |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 2,123,404 | 0 | A→G | 3.6% | 8.1 ‑0.8 ‑0.1 | 193 | P256P (CCT→CCC) | wza | polysaccharide export protein Wza |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (5/2): ref base (96/90): total (101/92) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.48e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.81e-01 |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
AAGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGAAGGGCTTGAC.ATTTGGGCCAACAAATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGTTGTTGGCGCCGATG > NC_014034/2123306‑2123503
|
aaGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGGGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGAGgg > 1:317706/1‑101 (MQ=255)
aGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGAGggc > 1:1411800/1‑100 (MQ=255)
aTGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCtt < 2:1665997/101‑1 (MQ=255)
aTGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCtt > 1:2254863/1‑101 (MQ=255)
aTGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCtt < 1:1846349/101‑1 (MQ=255)
gCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGa < 2:2692880/101‑1 (MQ=255)
gCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGa > 2:480398/1‑101 (MQ=255)
ccccgGGCAGCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAc < 1:1281251/98‑1 (MQ=255)
ccGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAc < 2:3332860/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAc > 1:1097502/1‑101 (MQ=255)
cgcgGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcg < 2:597606/101‑2 (MQ=255)
cgGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgat > 1:4373978/1‑98 (MQ=255)
gggCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatc < 2:4457243/101‑5 (MQ=255)
ggCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatct < 1:501871/101‑6 (MQ=255)
ggCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatct < 2:3264949/101‑6 (MQ=255)
gCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatctg > 1:4370572/1‑95 (MQ=255)
gCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatctg < 2:3059359/101‑7 (MQ=255)
gCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatctg < 2:3146664/101‑7 (MQ=255)
gCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatctg < 1:1397633/101‑7 (MQ=255)
gCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatctg < 2:3184927/101‑7 (MQ=255)
gCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatctg > 1:2499395/1‑95 (MQ=255)
aTCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatctggc > 2:198228/1‑93 (MQ=255)
aTCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGGGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatctggc > 1:4121995/1‑93 (MQ=255)
aTCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGGGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatctggc > 2:1538175/1‑93 (MQ=255)
cGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatctggccc < 2:2417829/101‑11 (MQ=255)
cGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatctggccc < 1:3290370/101‑11 (MQ=255)
cGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatctggccc > 1:1011738/1‑91 (MQ=255)
tCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATa > 2:3081244/1‑101 (MQ=255)
cTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAgg < 2:2187652/101‑1 (MQ=255)
cTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAgg > 2:2184630/1‑101 (MQ=255)
cTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAgg < 1:2327585/101‑1 (MQ=255)
ggCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGcct < 1:2518110/101‑1 (MQ=255)
ggCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGcct > 1:2202610/1‑101 (MQ=255)
gCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGcctc < 1:3536923/101‑1 (MQ=255)
ccAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGGGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCCGATAGGcctcc > 2:4319472/1‑101 (MQ=255)
cAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGTGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGcctcct < 1:3234172/101‑1 (MQ=255)
cAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGcctcct > 2:3512161/1‑101 (MQ=255)
cAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGcctcct > 2:2275878/1‑101 (MQ=255)
gACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGc > 2:698349/1‑101 (MQ=255)
aCCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCa < 1:3344762/101‑1 (MQ=255)
aCCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGACTCCTGCa > 2:1071536/1‑101 (MQ=255)
ccgccgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCAc < 2:3893068/101‑1 (MQ=255)
ccgccgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCAc < 1:3573989/101‑1 (MQ=255)
ccgccgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCAc > 2:2519295/1‑101 (MQ=255)
cgccgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCAcc < 2:2261113/101‑1 (MQ=255)
cgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTc > 2:2323238/1‑101 (MQ=255)
cgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTc > 1:1320325/1‑101 (MQ=255)
gACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCt > 2:137713/1‑101 (MQ=255)
gACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCt < 2:4559469/101‑1 (MQ=255)
gACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCt < 2:2836818/101‑1 (MQ=255)
gACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCt < 1:3457884/101‑1 (MQ=255)
aCGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTg > 1:2631708/1‑101 (MQ=255)
cgGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTgccg < 1:71900/101‑1 (MQ=255)
gggTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTgccgc > 2:3318596/1‑101 (MQ=255)
tGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCg > 1:3898938/1‑101 (MQ=255)
gATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGa > 2:4011609/1‑101 (MQ=255)
aTCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGAc < 2:4370280/101‑1 (MQ=255)
cGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGc > 2:2714389/1‑101 (MQ=255)
ccTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTg < 2:874297/101‑1 (MQ=255)
ccTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTg > 1:3759568/1‑101 (MQ=255)
ccTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTg > 1:1446794/1‑101 (MQ=255)
ccTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTg > 1:2907347/1‑101 (MQ=255)
cTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTga < 2:3401456/101‑1 (MQ=255)
tGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTgac < 1:2156495/101‑1 (MQ=255)
ggTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTgacga > 1:4363052/1‑101 (MQ=255)
tCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACa > 1:624148/1‑101 (MQ=255)
cAGGGTGATGTTGTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACAt > 1:2531049/1‑101 (MQ=255)
aGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATc > 2:1180237/1‑101 (MQ=255)
aGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATc < 1:1633588/101‑1 (MQ=255)
tGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCg > 2:2128617/1‑101 (MQ=255)
tGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCg > 2:805187/1‑101 (MQ=255)
ttttCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTg < 2:3241932/101‑1 (MQ=255)
ttttCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTg < 2:2499229/101‑1 (MQ=255)
ttttCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTg < 1:1178471/101‑1 (MQ=255)
ttttCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGGCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTg > 1:3977754/1‑101 (MQ=255)
tttCCAGCGTCAGATCGGTCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgc < 2:4187956/101‑1 (MQ=255)
ttCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgca < 2:4373686/101‑1 (MQ=255)
ttCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgca < 1:1689937/101‑1 (MQ=255)
tCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgcag < 2:2060123/101‑1 (MQ=255)
tCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCggg < 1:4560524/101‑1 (MQ=255)
cAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgt > 1:3273101/1‑101 (MQ=255)
cAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgt > 1:2092641/1‑101 (MQ=255)
cAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgt < 1:2786832/101‑1 (MQ=255)
cAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgt > 1:700093/1‑101 (MQ=255)
aGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgtt > 2:2983433/1‑101 (MQ=255)
aGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgtt > 2:2620417/1‑101 (MQ=255)
aGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgtt > 2:2216038/1‑101 (MQ=255)
aGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgtt > 1:245048/1‑101 (MQ=255)
gatcgatcGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgttg > 1:426767/1‑101 (MQ=255)
gatcgatcGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgttg > 2:3501540/1‑101 (MQ=255)
tcgatcgTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgttgtt < 1:3257792/101‑1 (MQ=255)
cgatcgTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGttgttg > 1:2979545/1‑101 (MQ=255)
cgatcgTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGttgttg < 2:1011655/101‑1 (MQ=255)
atcgTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCCCCGGGTTGTTGgc > 1:2138461/1‑101 (MQ=255)
gtcgaGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGTTGTTGGCGcc > 1:2774438/5‑101 (MQ=255)
gtcgaGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGTTGTTGGCGcc > 1:2067227/5‑101 (MQ=255)
cgaGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGTTGTTGGCGCCGa > 1:997838/3‑101 (MQ=255)
aGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGTTGTTGGCGCCGATg > 1:864501/1‑101 (MQ=255)
aGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGTTGTTGGCGCCGATg > 2:1242474/1‑101 (MQ=255)
aGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGTTGTTGGCGCCGATg > 2:1844737/1‑101 (MQ=255)
|
AAGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGAAGGGCTTGAC.ATTTGGGCCAACAAATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGTTGTTGGCGCCGATG > NC_014034/2123306‑2123503
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 30 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|