BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,964	C→G	1.5%	P231P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	221,964	0	C→G	1.5%	7.3 0.0 ‑0.3	570	P231P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (6/5): ref base (289/269): total (296/274)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.15e-01

Only 100 of 1359 total aligned reads displayed.


TGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAG  >  NC_014034/221864‑222064


   ccGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGGTGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcggg                                                                                                   >  2:4466059/1‑101 (MQ=255)


      cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtag                                                                                                <  2:2326024‑M1/15‑3 (MQ=255)


      cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                                                >  1:659573‑M1/87‑101 (MQ=255)


          tggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                                                                            >  2:1317060‑M1/83‑101 (MQ=255)


             gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                                                         >  1:1321155‑M1/80‑101 (MQ=255)


                 gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                                                                                     <  1:4277303‑M1/26‑1 (MQ=255)


                   gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcg                                                                                   <  1:945250‑M1/28‑1 (MQ=255)


                   cggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcg                                                                                   <  1:3519194‑M1/28‑1 (MQ=255)


                    ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtagg                                                                                  <  1:2993585‑M1/29‑4 (MQ=255)


                     gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgga                                                                                 <  1:4547994‑M1/30‑2 (MQ=255)


                      atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggat                                                                                <  2:480605‑M1/31‑3 (MQ=255)


                         ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgggatgggtcgggtccg                                                                             <  2:4575003‑M1/34‑1 (MQ=255)


                             ttGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                                         <  1:54118/101‑1 (MQ=255)


                             gggtccgtgggctctgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                                         >  2:2671359‑M1/64‑101 (MQ=255)


                              ggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggg                                                                        <  1:2595446‑M1/39‑2 (MQ=255)


                                 ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggatccgtgggatcg                                                                     <  2:3518640‑M1/42‑1 (MQ=255)


                                  ggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                    <  1:3471606/101‑1 (MQ=255)


                                          cggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                            <  2:3706804‑M1/51‑1 (MQ=255)


                                          cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                            >  2:4145597‑M1/51‑101 (MQ=255)


                                           cGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                           <  1:1504243/101‑1 (MQ=255)


                                            tccgatctcgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                          >  1:1590826‑M1/49‑101 (MQ=255)


                                             tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                         >  1:2019326‑M1/48‑101 (MQ=255)


                                             tcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTg                                                         >  2:1820517‑M1/48‑101 (MQ=255)


                                              cGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                        >  1:821501/1‑101 (MQ=255)


                                                ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                      <  1:1196788‑M1/57‑1 (MQ=255)


                                                 gtcggtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt                                                     >  1:2748263‑M1/44‑101 (MQ=255)


                                                  tccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                    >  1:2434746‑M1/43‑101 (MQ=255)


                                                  tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                    <  2:3608643‑M1/59‑1 (MQ=255)


                                                    gcgcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGGTCGCTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                  <  1:3993012/101‑1 (MQ=255)


                                                    cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                  <  1:3053948‑M1/61‑1 (MQ=255)


                                                    cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                  <  2:2097829‑M1/61‑1 (MQ=255)


                                                     gtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                 >  2:2617447‑M1/40‑101 (MQ=255)


                                                      tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtc                                                >  1:2353987‑M1/39‑101 (MQ=255)


                                                       cTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                               >  2:899734/1‑101 (MQ=255)


                                                        tCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                              >  1:2903669/1‑101 (MQ=255)


                                                        tCATCGACGGTGGGCGCCGGATGCGTGGGCTCGGCCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGGTCGGCCGGGTCCGCGGGGtgggtcgg                                              >  2:1604662/1‑101 (MQ=18)


                                                        ggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                              >  2:1737545‑M1/37‑101 (MQ=255)


                                                          gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                            >  1:1382864‑M1/35‑101 (MQ=255)


                                                          gtcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                            >  2:1530704‑M1/35‑101 (MQ=255)


                                                           tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                           <  1:1239786‑M1/68‑1 (MQ=255)


                                                           tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                           <  2:2171374‑M1/68‑1 (MQ=255)


                                                             ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                         <  1:2814776‑M1/70‑1 (MQ=255)


                                                             cgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                         <  1:4407853‑M1/70‑1 (MQ=255)


                                                                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                     >  1:4625878‑M1/28‑101 (MQ=255)


                                                                    tccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                  >  1:1657491‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                                                     ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                 >  1:2662353‑M1/24‑101 (MQ=255)


                                                                       gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                               <  1:3189997‑M1/80‑1 (MQ=255)


                                                                       gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGCatcggc                               <  1:748616‑M1/80‑2 (MQ=255)


                                                                        tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                              <  1:3809160‑M1/81‑1 (MQ=255)


                                                                         ggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                             >  1:4354485‑M1/20‑101 (MQ=255)


                                                                         gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                             <  1:1009700‑M1/82‑1 (MQ=255)


                                                                          ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgggcgg                            >  1:497183/1‑101 (MQ=255)


                                                                            atcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGgagcggtcgggt                          <  2:4354193‑M1/85‑3 (MQ=255)


                                                                             tccGTGGGGTCCGGCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATc                         <  2:825592/99‑1 (MQ=14)


                                                                              gCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                        <  2:3028836/101‑1 (MQ=255)


                                                                              gCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGATcg                        >  2:2968869/1‑100 (MQ=255)


                                                                                gTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                      <  2:31531/101‑1 (MQ=255)


                                                                                 tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                     <  1:4466354/101‑1 (MQ=255)


                                                                                    ggtccgggggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGCCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                  <  1:3948674/93‑1 (MQ=11)


                                                                                      ttcgccttatcggttgggtccgtgttattggtctggtccgtgcgATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                <  2:1217993/93‑1 (MQ=11)


                                                                                      tcggtcggGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                <  2:3255531/101‑1 (MQ=255)


                                                                                      tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                >  2:3971234/1‑101 (MQ=255)


                                                                                      tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                <  2:630124/101‑1 (MQ=255)


                                                                                      tccgtgGGATGGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                >  2:2031663‑M1/7‑101 (MQ=255)


                                                                                      tccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                <  2:104105/98‑1 (MQ=11)


                                                                                      gccgtcggGTCGGCGGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                <  1:2150083/98‑1 (MQ=11)


                                                                                       cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg               <  1:1715433/101‑1 (MQ=14)


                                                                                       ccgtgGGATCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg               >  2:1688214‑M1/6‑101 (MQ=255)


                                                                                       ccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg               <  2:142047/96‑1 (MQ=11)


                                                                                        cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg              <  1:3649362‑M1/97‑1 (MQ=255)


                                                                                        cgtgGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg              >  2:4397286‑M1/5‑101 (MQ=255)


                                                                                         gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt             <  2:3422523‑M1/98‑1 (MQ=255)


                                                                                          tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATAGGTGGGGTCTGTGGGAtaggag            >  2:4266455/3‑99 (MQ=11)


                                                                                          tgGGATCGGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGgatccgtggggtccgtg            >  2:750522‑M1/3‑94 (MQ=255)


                                                                                          tgGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc            >  2:3808875‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                                                           gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg           <  1:2480023‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                                                           gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg           >  2:551473‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                                                                           gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg           >  1:2066170‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                                                                           gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg           <  1:2213678‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                                                            ggctccgtcgggtccgtcggatccgtcgggtccgtgggttcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg          <  2:3329374/95‑1 (MQ=11)


                                                                                            ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg          <  2:3919485/101‑1 (MQ=11)


                                                                                             gatcggtcgggtccggggggtccgtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg         <  1:335744/101‑1 (MQ=11)


                                                                                             gatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtagGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg         <  2:1944498/101‑1 (MQ=11)


                                                                                              atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCTGTGGGGTCGGCGGGTGCGGTGgggg        >  2:2230764/1‑100 (MQ=11)


                                                                                                cgggcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc      <  2:4075113/101‑1 (MQ=11)


                                                                                                 ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGTTGGGTCGGGTcct     >  2:1111961/1‑100 (MQ=11)


                                                                                                 ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcTGTCGGATCCGTGGGATCTGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCTGGTCCGTGGGATCAGGCGGGTctg     >  1:2266056/1‑99 (MQ=11)


                                                                                                 ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg     >  1:1799815/1‑101 (MQ=11)


                                                                                                  gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGT.GGGACCGtc   >  2:2836057/1‑100 (MQ=11)


                                                                                                   tcgggttcgtgggatcggtcgtgtccgttggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg   <  1:4087742/101‑2 (MQ=11)


                                                                                                   tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg   <  1:3726857‑M2/101‑2 (MQ=255)


                                                                                                   tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCggg   >  1:602356/1‑99 (MQ=11)


                                                                                                   tcgggtccgtgggagcggtcgggtccgtggggtccgCCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg   <  2:2749553/101‑2 (MQ=11)


                                                                                                   gcgggtcgnggggatcnnncgggtccngngnatcggtCGGGTCCGTGGGGTCNGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg   <  1:1932211/100‑2 (MQ=11)


                                                                                                   gcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg   >  1:3305779‑M2/2‑100 (MQ=255)


                                                                                                    cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGtgg  >  1:1092423/1‑99 (MQ=14)


                                                                                                    cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGTCCGGGTCCGCGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcggaaccgcgg  >  1:3858599/1‑93 (MQ=11)


                                                                                                    cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTTGGTCGGGTGCGtgg  >  2:2493096/1‑99 (MQ=11)


                                                                                                    cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCgcgg  >  1:4149193/1‑98 (MQ=11)


                                                                                                    cggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGGTcccggg  >  2:2418678/1‑97 (MQ=11)


TGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAG  >  NC_014034/221864‑222064

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG