BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,967	G→A	17.5%	D230D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	221,967	0	G→A	17.5%	257.9 ‑1.8 ‑0.1	578	D230D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (60/42): ref base (243/233): total (303/275)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.58e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 7.14e-01

Only 100 of 1432 total aligned reads displayed.


CCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAT  >  NC_014034/221867‑222067


ccGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGGTGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcggg                                                                                                      >  2:4466059/1‑101 (MQ=255)


   cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                                                   <  1:2082698‑M1/15‑1 (MQ=255)


       cGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgg                                                                                               >  1:3581560/1‑101 (MQ=255)


        ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtggg                                                                                              <  2:3606580‑M1/20‑1 (MQ=255)


           gCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                                           <  2:4072850/101‑1 (MQ=255)


            ccgtggggtcggtcgggtccgtgggatctgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                          >  2:2230267‑M1/78‑101 (MQ=255)


             cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                                         <  1:3289917‑M1/25‑1 (MQ=255)


               tgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                       <  1:266493‑M1/27‑1 (MQ=255)


               tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc                                                                                       <  1:1331458‑M1/27‑1 (MQ=255)


               ggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatctgtc                                                                                       >  2:2595261‑M1/75‑101 (MQ=255)


                  gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggttccgtgggatcgggcggt                                                                                    <  2:4138366‑M1/30‑2 (MQ=255)


                   ttCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggattggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                                                                                   >  1:4389134/1‑101 (MQ=255)


                     cggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggtcgggtcc                                                                                 <  1:1734414‑M1/33‑1 (MQ=255)


                      ggTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                                                <  1:3490558/101‑1 (MQ=255)


                      ggTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                                                >  2:1504134/1‑101 (MQ=255)


                      ggTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccg                                                                                >  1:2152769/1‑101 (MQ=255)


                       gtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt                                                                               <  2:1174974‑M1/35‑1 (MQ=255)


                        tgtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtg                                                                              >  2:833769/1‑101 (MQ=255)


                        tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                                                                              <  1:4054670‑M1/36‑1 (MQ=255)


                         gggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                                                             <  1:4309991‑M1/37‑1 (MQ=255)


                            gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                                          >  2:1009617‑M1/62‑101 (MQ=255)


                            ggtggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                                          <  1:4515745/101‑1 (MQ=255)


                             tccgtaggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                         >  1:795188‑M1/61‑101 (MQ=255)


                              ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggatccgtgggatcg                                                                        <  2:3518640‑M1/42‑1 (MQ=255)


                               cgtgggatctgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                       >  2:1734295‑M1/59‑101 (MQ=255)


                                 tgggctcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                     >  2:266461‑M1/57‑101 (MQ=255)


                                 tCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                     <  1:3347697/101‑1 (MQ=255)


                                   ggatcggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                   >  2:4396997‑M1/55‑101 (MQ=255)


                                    gatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggg                                                                  <  2:3789472‑M1/48‑2 (MQ=255)


                                          tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                            >  1:2019326‑M1/48‑101 (MQ=255)


                                           cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggaccgcgg                                                           <  2:3028581‑M1/55‑9 (MQ=255)


                                             ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                         <  1:1196788‑M1/57‑1 (MQ=255)


                                              gtcggtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt                                                        >  1:2748263‑M1/44‑101 (MQ=255)


                                                 cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                     <  1:3955479‑M1/61‑1 (MQ=255)


                                                    gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGtgggatcagatc                                                  <  1:3737266‑M1/64‑6 (MQ=255)


                                                    gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcg                                                  >  2:2411555‑M1/38‑101 (MQ=255)


                                                    gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGgatcggtag                                                  <  1:3681744‑M1/64‑3 (MQ=255)


                                                     tCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                 >  1:2903669/1‑101 (MQ=255)


                                                       atcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGgatcggtcggat                                               <  2:1803443‑M1/67‑3 (MQ=255)


                                                        tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                              <  2:2171374‑M1/68‑1 (MQ=255)


                                                        tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                              >  1:1522401‑M1/34‑101 (MQ=255)


                                                          ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                            <  1:2814776‑M1/70‑1 (MQ=255)


                                                          ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                            >  1:2611999‑M1/32‑101 (MQ=255)


                                                             gggggggggcGGATGCGGGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                         <  1:4430270/92‑1 (MQ=17)


                                                             ggTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                         >  1:4220725/1‑101 (MQ=255)


                                                             cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                         <  2:4585845‑M1/73‑1 (MQ=255)


                                                              gggtccgtgggatcgttcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                        >  1:1418927‑M1/28‑101 (MQ=255)


                                                                gtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                      >  1:2287150‑M1/26‑101 (MQ=255)


                                                                 tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                     >  1:2441996‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                                                  gCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                    >  1:2225158/1‑101 (MQ=255)


                                                                  ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                    >  2:2470352‑M1/24‑101 (MQ=255)


                                                                   cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                   >  2:4230754‑M1/23‑101 (MQ=255)


                                                                   cgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                   <  2:2727174‑M1/79‑1 (MQ=255)


                                                                     tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGgatcgggc                                 <  2:1390925‑M1/81‑3 (MQ=255)


                                                                     tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                 <  2:3131721‑M1/81‑1 (MQ=255)


                                                                     tCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                 >  1:3822269/1‑101 (MQ=255)


                                                                      gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                <  1:1009700‑M1/82‑1 (MQ=255)


                                                                          tcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                            >  1:4586144‑M1/16‑101 (MQ=255)


                                                                          ccgttccggccggtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                            <  2:3323039/91‑1 (MQ=1)


                                                                          ccggTGGGTTCCGTCGGGTCGGTCTGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                            <  2:2826525/98‑1 (MQ=11)


                                                                           cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                           <  1:3895357‑M1/87‑1 (MQ=255)


                                                                             gTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGt                         <  2:1084104/101‑1 (MQ=14)


                                                                               cgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                       >  2:2952777‑M1/11‑101 (MQ=255)


                                                                                gggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                      <  2:558343‑M1/92‑1 (MQ=255)


                                                                                 ggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgggg                     <  1:3043436‑M1/93‑2 (MQ=255)


                                                                                 gCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                     <  2:1262480/101‑1 (MQ=255)


                                                                                  gtgcgtccgATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCAGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                    <  1:1823649/97‑1 (MQ=11)


                                                                                  gtcggtgggATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                    <  2:3971037/100‑1 (MQ=11)


                                                                                   tcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                   <  1:4099140/101‑1 (MQ=11)


                                                                                   tccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                   >  2:3675182‑M1/7‑101 (MQ=255)


                                                                                   tccgtgGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCcgtggggtc                   >  1:4669116‑M1/7‑98 (MQ=255)


                                                                                    cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                  >  1:1253520/1‑101 (MQ=255)


                                                                                     cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                 <  1:898006‑M1/97‑1 (MQ=255)


                                                                                      gtgggggcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgt                <  1:531463/94‑1 (MQ=11)


                                                                                       tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATTGGTCGGGCCCGAGGGAtcttcc               >  1:3428774/3‑97 (MQ=11)


                                                                                       tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc               >  2:3238669‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                                                       tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc               <  1:2356379‑M1/99‑1 (MQ=255)


                                                                                       tgGGATCGGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGgatccgtggggtccgtg               >  2:750522‑M1/3‑94 (MQ=255)


                                                                                       tcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc               <  1:2992554/101‑1 (MQ=255)


                                                                                       tcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc               <  1:3140330/101‑1 (MQ=255)


                                                                                        gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTAGGATCGGGCGGGTCGCGGGTAtcggtag              >  2:208437/2‑99 (MQ=14)


                                                                                        ggcagctgtcgtgtccgctggttcggtcgagtccgtggggtccGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg              <  2:3896714/94‑1 (MQ=1)


                                                                                        gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg              <  1:2504958‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                                                        gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg              >  1:61845‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                                                                         gggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtcgg             >  1:1939130/7‑101 (MQ=14)


                                                                                         ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtgcgccgg             >  2:2016158/1‑94 (MQ=11)


                                                                                         ggacccgtctggcccgtcgggtcggtcggaccagtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg             <  2:1587640/95‑1 (MQ=11)


                                                                                          ggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCggg            <  1:1599715/99‑1 (MQ=14)


                                                                                             cggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGcc         >  2:1657380/1‑101 (MQ=11)


                                                                                             cggtccggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc         >  2:1932076/1‑101 (MQ=11)


                                                                                             cgctcggatccgtcagatgggtcggattagtgggatcggCCGGGTACGTGGCATCGGTCGTCTCCGTGAGGTCAGTCGGATCCGTGGGATCGGTCAGATcc         <  2:3407370/98‑1 (MQ=2)


                                                                                              ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCg        >  1:731980/1‑101 (MQ=11)


                                                                                               gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTGGGATCCgg       >  2:904073/1‑100 (MQ=11)


                                                                                               gtcgggaccgtgaggtcggtccgatccgtcggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt       <  2:2316954/101‑1 (MQ=11)


                                                                                                tggggtccgtgggatcgggcgggtccgtcggatcggtgGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGtg      <  2:4345865/99‑2 (MQ=11)


                                                                                                tcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg      >  2:660527/1‑100 (MQ=11)


                                                                                                gcgggtgcgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg      <  1:1661349/100‑2 (MQ=11)


                                                                                                 cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg     >  2:493651‑M2/1‑99 (MQ=255)


                                                                                                  gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg    <  1:580960‑M2/101‑4 (MQ=255)


                                                                                                    gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat  >  1:1094269‑M2/1‑96 (MQ=255)


CCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAT  >  NC_014034/221867‑222067

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG