BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,985	G→A	13.5%	D224D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	221,985	0	G→A	13.5%	192.0 ‑1.1 0.0	613	D224D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (40/43): ref base (286/242): total (327/286)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.44e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1676 total aligned reads displayed.


TTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGG  >  NC_014034/221886‑222084


 tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggttaggtcgggtc                                                                                                   <  1:1419449‑M1/32‑1 (MQ=255)


     tgtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtg                                                                                               >  2:833769/1‑101 (MQ=255)


         gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                                                           >  2:1009617‑M1/62‑101 (MQ=255)


           ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                         >  1:3041360‑M1/60‑101 (MQ=255)


            cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggattgg                                                                                        <  2:3202744‑M1/43‑4 (MQ=255)


                 gCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGa                                                                                   >  1:1699744/1‑101 (MQ=255)


                   tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                                                 <  2:2451351‑M1/50‑4 (MQ=255)


                    cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                <  1:1644807‑M1/51‑1 (MQ=255)


                      gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCcgg                                                                              <  2:1509475‑M1/53‑2 (MQ=255)


                        cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTgg                                                                            <  1:338625‑M1/55‑1 (MQ=255)


                          gATCGCGCTCAGCGACGGTGGGCGGCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                          <  2:3883950/101‑1 (MQ=255)


                           atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                         >  1:3307371‑M1/44‑101 (MQ=255)


                             ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTgggaccg                                                                       <  1:2231326‑M1/60‑4 (MQ=255)


                                tgggagcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                    >  1:2308134‑M1/39‑101 (MQ=255)


                                 gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                   <  2:1871703‑M1/64‑1 (MQ=255)


                                  ggatcggtcgtgtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                  >  2:924451‑M1/37‑101 (MQ=255)


                                   cATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg                                                                 >  2:3711007/1‑101 (MQ=255)


                                    aTCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                >  1:4320674/1‑101 (MQ=255)


                                     tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                               <  1:1239786‑M1/68‑1 (MQ=255)


                                     tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGggatcggtcggatc                                                               >  2:3641162‑M1/34‑98 (MQ=255)


                                      cggtcggttccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                              >  2:3797830‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                      cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                              >  2:4427076‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                       ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                             <  1:3726309‑M1/70‑1 (MQ=255)


                                       ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCg                                                             <  2:4290350‑M1/70‑1 (MQ=255)


                                             gtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                       <  2:3375044‑M1/76‑1 (MQ=255)


                                             gtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                       <  1:2755861‑M1/76‑1 (MQ=255)


                                                 gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGCatcggc                                                   <  1:748616‑M1/80‑2 (MQ=255)


                                                   gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                 <  1:1009700‑M1/82‑1 (MQ=255)


                                                      atcggtcgggtccggtGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGgatcggtcgggt                                              >  1:3853090‑M1/17‑99 (MQ=255)


                                                        cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                            >  1:1553673‑M1/15‑101 (MQ=255)


                                                         ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGatcgg                                           <  2:4538368‑M1/88‑3 (MQ=255)


                                                         cGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCg                                           <  2:3087880/101‑1 (MQ=11)


                                                               tgccgtgggttcggtccggggcggggggtcggtcgggtccgtggggTCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt                                     <  2:1111170/91‑1 (MQ=2)


                                                               gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                     >  2:3013876‑M1/8‑101 (MQ=255)


                                                                tcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                    <  2:506298/101‑1 (MQ=11)


                                                                 ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                   <  2:1415952‑M1/96‑1 (MQ=255)


                                                                 ccgtgGGATCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                   >  2:1688214‑M1/6‑101 (MQ=255)


                                                                  cgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGAtcgg                                  >  2:1994833/11‑101 (MQ=11)


                                                                  cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGCGGGATCCGTGGGGtccg                                  >  2:673903/5‑99 (MQ=11)


                                                                  cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                  <  1:4067389‑M1/97‑1 (MQ=255)


                                                                  cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                  <  1:3649362‑M1/97‑1 (MQ=255)


                                                                  cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                  >  1:3131965‑M1/5‑101 (MQ=255)


                                                                   gtgggggcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgt                                 <  1:531463/94‑1 (MQ=11)


                                                                   gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                 >  2:2689387‑M1/4‑101 (MQ=255)


                                                                    tgggatcggtcgtgtccttgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGAGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                <  2:4101904/99‑1 (MQ=14)


                                                                    tgGGATCGGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGgatccgtggggtccgtg                                >  2:750522‑M1/3‑94 (MQ=255)


                                                                    tcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                >  1:4575082/1‑101 (MQ=255)


                                                                    ggggaccgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                <  1:4402355/99‑1 (MQ=14)


                                                                    ggGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                >  1:2456765‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                                     tggctcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                               <  2:2636145/97‑1 (MQ=14)


                                                                     gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                               >  2:395109/2‑101 (MQ=11)


                                                                     gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                               <  1:1177001‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                                     gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                               >  1:2366659‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                                                     gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                               >  1:2874267‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                                                     gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                               >  1:61845‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                                                      ggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGGtcggatgg                              >  2:1196290/1‑97 (MQ=11)


                                                                      ggatcggtagggtcggtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                              <  2:3550932/101‑1 (MQ=11)


                                                                      ggaacgggcgggtgcgtggggacggtaggatccgggGGGTCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                              <  1:2089415/101‑1 (MQ=2)


                                                                       ggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGTCggg                             >  1:3531325/6‑101 (MQ=11)


                                                                        gtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGGCGGGGCCGTGGGATCGGCCGGGCCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCgggc                            >  1:2691363/5‑100 (MQ=11)


                                                                        atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                            >  1:3798115/1‑99 (MQ=11)


                                                                        atcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                            >  1:1320961/1‑99 (MQ=11)


                                                                         tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                           <  2:580899/101‑1 (MQ=11)


                                                                           ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccggggggtcCGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGAGCCGGGGGATCGGTCGGGACCg                         >  2:2921957/1‑101 (MQ=14)


                                                                           gggcggatccgtgggatccgtggggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                         <  2:2050128/98‑1 (MQ=11)


                                                                            gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAGCCGTGGGATCCGAGGGATCGGTCGGGTGCgg                        >  2:4371852/1‑100 (MQ=14)


                                                                            gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                        <  2:4622060/101‑1 (MQ=11)


                                                                            gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                        >  1:1910795/1‑101 (MQ=11)


                                                                             ttgggtccgtctgatcggtcgggtccgtgggatccgtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                       <  2:2562147/99‑2 (MQ=11)


                                                                             tcgggtccgtgggagcggtcgggtccgtggggtccgCCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                       <  2:2749553/101‑2 (MQ=11)


                                                                              tggctccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                      <  2:4024673/97‑3 (MQ=11)


                                                                              cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                      >  1:3969370/1‑99 (MQ=11)


                                                                              cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGTGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                      >  1:2572288/1‑99 (MQ=11)


                                                                              cggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                      >  1:2636330/1‑99 (MQ=11)


                                                                               gggtccgtgggatcggtcgggtcggtgggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                     >  1:2954402‑M2/1‑98 (MQ=255)


                                                                               gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                     <  1:580960‑M2/101‑4 (MQ=255)


                                                                               gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGGCCGGGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGGGGGGTCGGTCGGATCCgcgtg                     >  1:4461037/1‑97 (MQ=14)


                                                                               gggtccgtgggatcggtcgggcccgctgggtccgtcGGCGCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCCGTGCGGTGGGGTGGGCCGGGTGCGTGgg                     >  2:2372894/1‑101 (MQ=2)


                                                                               gggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAACGGGCGGGGCCGTGGGAACGGGCggggacgttgg                     >  2:1594157/1‑93 (MQ=11)


                                                                               gggaccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccggcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCCGGTCCGTGgg                     >  2:128019/1‑101 (MQ=14)


                                                                                ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                    >  1:476608‑M2/1‑97 (MQ=255)


                                                                                gatgcgtgggagcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                    <  1:2016298/97‑1 (MQ=11)


                                                                                 gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                   >  1:2165541‑M2/1‑96 (MQ=255)


                                                                                 gtccgtgggagcggtcgggtccgtgggagcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                   >  1:1765620‑M2/1‑96 (MQ=255)


                                                                                 atccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGgggg                   >  2:2120937/2‑99 (MQ=11)


                                                                                  tccgtggggtcgggcgggtccgtggggtcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                  <  1:4110731/101‑1 (MQ=11)


                                                                                  tccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                  >  1:3468339‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                                                                  tccgggggatcgggcgggtccgggggatcggtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                  <  1:4209479/101‑1 (MQ=14)


                                                                                  gccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                  >  2:3300213‑M2/2‑95 (MQ=255)


                                                                                   cgttgggatgggaggggggcgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                 <  1:824716/98‑1 (MQ=11)


                                                                                    cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtccg                <  2:2827918‑M2/101‑9 (MQ=255)


                                                                                       gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGTGGGGTCGGTCGGATGCATGGGATCGGCCGGGTCCCCGGGAtcggtcg             >  1:3219/1‑101 (MQ=14)


                                                                                       gggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtgg             >  2:2288897/1‑99 (MQ=11)


                                                                                        gggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgggggg            >  1:925261/7‑97 (MQ=11)


                                                                                         gatcggtcgggaccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCAGCCGGGTCCGTTGGGtcgggctcg           >  2:175871/1‑96 (MQ=11)


                                                                                           tcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATGGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtc         >  1:3919770/1‑101 (MQ=14)


                                                                                            ccgtcggctccgtgggacccttcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc        <  2:4187639/99‑1 (MQ=11)


                                                                                             ggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg       <  1:1084279‑M2/101‑18 (MQ=255)


                                                                                                cgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgggg    >  2:3468085/1‑98 (MQ=11)


                                                                                                  ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggg  <  2:2205976‑M2/101‑23 (MQ=255)


TTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGG  >  NC_014034/221886‑222084

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG