BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,991	G→C	5.6%	P222P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	221,991	0	G→C	5.6%	55.1 0.0 0.0	611	P222P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (18/17): ref base (303/272): total (321/290)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1744 total aligned reads displayed.


TGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221891‑222091


tgtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtg                                                                                                      >  2:833769/1‑101 (MQ=255)


tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtg                                                                                                      >  1:2774985‑M1/66‑101 (MQ=255)


 cgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                                                                                     <  1:686325‑M1/37‑1 (MQ=255)


      ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg                                                                                                >  1:53814‑M1/60‑101 (MQ=255)


         ttaGCGGCGCCGGATCTCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                             <  2:910496/99‑1 (MQ=255)


         tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtg                                                                                             <  1:4522559‑M1/45‑2 (MQ=255)


            gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgca                                                                                          <  1:1239578‑M1/48‑3 (MQ=255)


                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaacggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                  <  1:3936208‑M1/56‑1 (MQ=255)


                      aTCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                >  1:3138158/1‑101 (MQ=255)


                         cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGCtcgg                                                                             <  1:2584018‑M1/61‑1 (MQ=255)


                         cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcggatccgtagatcgga                                                                             <  2:1590721‑M1/61‑9 (MQ=255)


                         cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtccgtggggtccg                                                                             <  2:3109727‑M1/61‑6 (MQ=255)


                            cTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                          <  1:1705916/101‑1 (MQ=255)


                             ggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                         >  2:1737545‑M1/37‑101 (MQ=255)


                                tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGggatcggtcggatc                                                                      >  2:2583844‑M1/34‑98 (MQ=255)


                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     >  1:2465749‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTAGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     >  1:106056‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                 cgggcggggccgtgggaccggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     >  2:3572143‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                   gtcgggtccgtcggatcggtcgggcccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                   >  2:2655668‑M1/31‑101 (MQ=255)


                                   ggcggggcggtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                   >  1:3472287‑M1/31‑101 (MQ=255)


                                     gggggggggcGGATGCGGGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                 <  1:4430270/92‑1 (MQ=17)


                                     cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                 >  2:1881236‑M1/29‑101 (MQ=255)


                                       ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                               >  1:164999‑M1/27‑101 (MQ=255)


                                       gatgcgggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                               >  1:2230926‑M1/27‑101 (MQ=255)


                                         gccgtgggagcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                             >  1:596901‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                           cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcgg                                                           <  2:3969873‑M1/79‑1 (MQ=255)


                                            gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggg                                                          <  2:3025502‑M1/80‑2 (MQ=255)


                                            gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGCGGGAtcggt                                                          <  2:2215305‑M1/80‑1 (MQ=255)


                                            gTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGGCCggcggggccgg                                                          >  2:4301662/1‑91 (MQ=11)


                                             gcgggtccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtccgtg                                                         <  1:4261977/94‑2 (MQ=11)


                                               ggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                       >  2:2143791‑M1/19‑101 (MQ=255)


                                                gATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcggtcggc                                                      >  2:1134961/1‑100 (MQ=255)


                                                  tGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                    <  1:489648/101‑1 (MQ=255)


                                                   cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                   >  1:1553673‑M1/15‑101 (MQ=255)


                                                    ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                  <  1:1436635‑M1/88‑1 (MQ=255)


                                                      tGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGGACCGTCGGAgcgggcgggggcgtg                                                >  2:2954173/1‑94 (MQ=2)


                                                      tGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc                                                >  2:1665334/1‑100 (MQ=11)


                                                       gggGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcg                                               <  1:3662204/101‑3 (MQ=17)


                                                       cgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTgg                                               <  1:2315‑M1/91‑1 (MQ=255)


                                                         ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGAGCGGTCCGGCGGAGCCGTGGGa                                             >  2:4640263/9‑101 (MQ=1)


                                                            ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                          <  2:1415952‑M1/96‑1 (MQ=255)


                                                            ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                          <  1:779715‑M1/96‑1 (MQ=255)


                                                             cgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGAtcgg                                         >  2:1994833/11‑101 (MQ=11)


                                                             cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                         >  2:1284320‑M1/5‑101 (MQ=255)


                                                             cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                         <  1:3733219‑M1/97‑1 (MQ=255)


                                                             cgggggatcggtcggctccgggggagccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                         <  2:2065589/97‑1 (MQ=14)


                                                               tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                       >  2:389867‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                                gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                      >  2:2843590‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                                                gGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                      >  2:4451228‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                                                 ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtcggacgg                                     >  2:3393771/1‑101 (MQ=14)


                                                                 ggaacgggcgggtgcgtggggacggtaggatccgggGGGTCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                     <  1:2089415/101‑1 (MQ=2)


                                                                   ttcggccggttcagggggtgcgttcggggcggtggggTCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                   <  2:3661219/100‑1 (MQ=2)


                                                                     gggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                 <  1:462467/100‑1 (MQ=11)


                                                                     cggtcgggtccgtgggctccgtgggttccgttggatCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                 <  2:753660/101‑1 (MQ=11)


                                                                      ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCGGTCGGATCCGGGGGAgtggtcggatacg                                >  2:4209191/1‑96 (MQ=14)


                                                                      gggcgggtccgtgggctcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                <  1:2714668/98‑1 (MQ=11)


                                                                       gtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGGCGGGTCCgg                               >  2:3469875/7‑100 (MQ=11)


                                                                       gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                               >  1:1910795/1‑101 (MQ=11)


                                                                       gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                               >  2:585364/1‑101 (MQ=11)


                                                                        tcgggttcgtgggatcggtcgtgtccgttggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                              <  1:4087742/101‑2 (MQ=11)


                                                                        gcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                              >  1:4371261‑M2/2‑100 (MQ=255)


                                                                         cgggtcggtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtCCGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                             <  1:3990770/101‑3 (MQ=11)


                                                                         cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCgcgg                             >  1:4149193/1‑98 (MQ=11)


                                                                          gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTCgg                            <  1:2657229/101‑1 (MQ=11)


                                                                          gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGCTCCCTGGGCTCGGTCGGATCCGTGgg                            >  1:3319808/1‑101 (MQ=11)


                                                                          gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGACCGGGGGATCGGTCGGGTACGTGgg                            >  2:4110445/1‑101 (MQ=11)


                                                                          gggtccgtgggatcggtcgggcccgctgggtccgtcGGCGCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCCGTGCGGTGGGGTGGGCCGGGTGCGTGgg                            >  2:2372894/1‑101 (MQ=2)


                                                                          ggggccgtggggtctgtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                            <  2:674824/101‑1 (MQ=11)


                                                                           ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGATCAGTGGGGTCGGTCGGGTCCgggggg                           >  2:2776408/1‑96 (MQ=14)


                                                                           ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtggGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGACCGTGggg                           >  2:1501969/1‑100 (MQ=11)


                                                                           gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGATCGGTCGGGACCgcggga                           >  2:1228553/3‑96 (MQ=11)


                                                                            gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                          >  1:2165541‑M2/1‑96 (MQ=255)


                                                                            atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTcccggggat                          >  1:93907/2‑94 (MQ=11)


                                                                            atccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                          <  2:456129/100‑1 (MQ=11)


                                                                             tccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                         <  1:858382/101‑1 (MQ=11)


                                                                             gccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                         >  2:3300213‑M2/2‑95 (MQ=255)


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                                                                              ccgtgggatttgtccgctccctgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                        <  2:3726582/101‑1 (MQ=11)


                                                                              ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                        >  1:11739‑M2/1‑94 (MQ=255)


                                                                              ccgtgggagcggtcgggtccttgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                        >  2:4057071‑M2/1‑94 (MQ=255)


                                                                               cgtgggatgggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGAATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAtcgg                       >  1:3407624/1‑101 (MQ=11)


                                                                               cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgg                       <  1:2984970‑M2/101‑9 (MQ=255)


                                                                               cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                       >  2:1020381/1‑101 (MQ=11)


                                                                                gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGCGGGAtcggg                      >  1:3042962/1‑100 (MQ=11)


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                                                                                 tgggatcggtcgggtccgtcgggtcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                     <  1:2889614/101‑1 (MQ=11)


                                                                                 tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc                     <  2:2456202‑M2/101‑11 (MQ=255)


                                                                                  gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                    <  1:3816678‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                                                      tcggtggggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtc                >  1:3223437‑M2/1‑86 (MQ=255)


                                                                                      tccgtggggtcggtggggtccgtcggATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                <  2:2707158/95‑1 (MQ=11)


                                                                                      accgtcgggtacgtggggtcgggcggATCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                <  1:2373056/98‑1 (MQ=11)


                                                                                       cggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGTTCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtcc               >  1:3867011/1‑101 (MQ=14)


                                                                                        ggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtgggggccg              >  1:3559375/1‑101 (MQ=11)


                                                                                           cggctccgtcggttcggagggGGCCGTGGGGTCGGTCGAGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCCgtggggtccgtcg           <  2:4382536/101‑1 (MQ=11)


                                                                                             gatccgtaggatgggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg         <  1:1003866/99‑1 (MQ=11)


                                                                                              atccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTTGGATCGgtcggttccgctgtac        >  2:230767/2‑95 (MQ=11)


                                                                                                 cgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtccg     <  2:518522‑M2/101‑27 (MQ=255)


                                                                                                  gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggt    <  2:3821984/101‑1 (MQ=11)


                                                                                                    gggctcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTgg  <  1:201320/101‑1 (MQ=11)


TGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221891‑222091

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 12 ≤


ATCG

< 20 ≤


ATCG

< 30 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG