BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,000	C→G	5.2%	P219P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,000	0	C→G	5.2%	75.9 ‑1.0 ‑0.0	842	P219P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (21/24): ref base (436/361): total (457/385)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.56e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.63e-01

Only 100 of 1809 total aligned reads displayed.


TCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221900‑222100


ttaGCGGCGCCGGATCTCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                                      <  2:910496/99‑1 (MQ=255)


tcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtc                                                                                                      <  2:1909496‑M1/45‑1 (MQ=255)


tCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                                      <  1:3347697/101‑1 (MQ=255)


   gatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggg                                                                                                   <  2:3789472‑M1/48‑2 (MQ=255)


     tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                                                                 <  2:824487‑M1/50‑4 (MQ=255)


      tggtcggatccgtggggtcggtcgggtccgtgggatgggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                                >  2:748541‑M1/51‑101 (MQ=255)


      tggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                >  2:2215950‑M1/51‑101 (MQ=255)


               ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                       >  2:2313‑M1/42‑101 (MQ=255)


                cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                      <  2:4549816‑M1/61‑1 (MQ=255)


                 gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                     <  1:4483592‑M1/62‑1 (MQ=255)


                 gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                     <  1:2923210‑M1/62‑1 (MQ=255)


                  ggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                    >  1:4138654‑M1/39‑101 (MQ=255)


                      gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                                >  1:1382864‑M1/35‑101 (MQ=255)


                      atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGgatcggtcggat                                                                                >  1:538925‑M1/35‑99 (MQ=255)


                       tcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                               >  1:1175066‑M1/34‑101 (MQ=255)


                       tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGggatcggtcggatc                                                                               >  1:663832‑M1/34‑98 (MQ=255)


                         ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCg                                                                             <  2:4290350‑M1/70‑1 (MQ=255)


                         ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                             >  1:488019‑M1/32‑101 (MQ=255)


                           tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                           >  1:2364286‑M1/30‑101 (MQ=255)


                            ggTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                          >  1:4220725/1‑101 (MQ=255)


                              gatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                        <  1:4418382‑M1/75‑1 (MQ=255)


                              gatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                        <  1:3708043‑M1/75‑1 (MQ=255)


                               gtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                       >  1:3794954‑M1/26‑101 (MQ=255)


                               gggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                       >  1:328204/1‑101 (MQ=255)


                                gccgtgggagcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                      >  1:596901‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                 gCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                     <  2:2157761/101‑1 (MQ=255)


                                 gCGTCGGAGGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                     <  1:859486/101‑1 (MQ=255)


                                 ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                     >  2:2470352‑M1/24‑101 (MQ=255)


                                     ggtattggtcgggtccgtgGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                 >  2:259390‑M1/20‑101 (MQ=255)


                                     ggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                 >  1:4354485‑M1/20‑101 (MQ=255)


                                      ggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                >  1:1670108‑M1/19‑101 (MQ=255)


                                       gatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGa                                                               <  1:1848199‑M1/84‑1 (MQ=255)


                                        aTGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                              >  1:3022066/1‑101 (MQ=255)


                                           gggcgggtccgtgGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                           >  1:953182‑M1/14‑101 (MQ=255)


                                            gtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                          <  1:2294214‑M1/89‑1 (MQ=255)


                                             gcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                         >  1:4609309‑M1/12‑101 (MQ=255)


                                               ggttctgtcggGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg                                                       <  2:3354189/95‑1 (MQ=11)


                                               ggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTggg                                                       <  1:199100/92‑1 (MQ=11)


                                               ggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                       <  1:3852036‑M1/92‑1 (MQ=255)


                                                tccgatctggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                      <  1:2654211/93‑1 (MQ=11)


                                                  tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggaccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGGTCCGTCGGACCCTTGGGAtg                                                    >  2:1765501/7‑100 (MQ=11)


                                                  gcggtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc                                                    <  1:3088222/100‑1 (MQ=14)


                                                   ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                   <  1:779715‑M1/96‑1 (MQ=255)


                                                   ccgtgGGATCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                   >  2:1688214‑M1/6‑101 (MQ=255)


                                                    cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                  <  1:3649362‑M1/97‑1 (MQ=255)


                                                     gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGATCCGTGGGAtcggt                                                 >  2:1418832/4‑101 (MQ=14)


                                                      ggGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                >  1:2456765‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                       gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAccggtcg                                               >  1:2127287/2‑101 (MQ=11)


                                                       gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTAGGATCGGGCGGGTCGCGGGTAtcggtag                                               >  2:208437/2‑99 (MQ=14)


                                                       gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                               <  1:2213678‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                       cggATCCGGGGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtccgtgg                                               <  2:2858463/101‑3 (MQ=18)


                                                        ggatcggtagggtcggtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                              <  2:3550932/101‑1 (MQ=11)


                                                         ggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCggg                                             <  1:1599715/99‑1 (MQ=14)


                                                         ggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGACCGTGGGATCGGTCcgg                                             >  2:1141766/6‑101 (MQ=11)


                                                           tccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCgggac                                           >  2:4634602/4‑99 (MQ=11)


                                                            cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCTTGGGAACGGCCGGGTcg                                          >  2:1036319/1‑100 (MQ=11)


                                                            cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                          <  1:1286301/101‑1 (MQ=11)


                                                             ggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTGCg                                         >  2:43770/1‑101 (MQ=11)


                                                             ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGGTCCGTCGGATCCg                                         >  1:4057357/1‑101 (MQ=11)


                                                              gtcgtgtccgtgggttcggtcgggtcggtcggatcgGTGGGATCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGt                                        <  2:2709436/101‑1 (MQ=11)


                                                                cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                                      >  1:3969370/1‑99 (MQ=11)


                                                                cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGTGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                                      >  1:2572288/1‑99 (MQ=11)


                                                                 gggttcgttggaatggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                     <  2:1595632/101‑1 (MQ=11)


                                                                 gggtccgtgggatcggtcgggcccgctgggtccgtcGGCGCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCCGTGCGGTGGGGTGGGCCGGGTGCGTGgg                                     >  2:2372894/1‑101 (MQ=2)


                                                                 ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                     >  1:2761660/4‑101 (MQ=11)


                                                                 ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                     <  2:2003864/98‑1 (MQ=11)


                                                                 ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                     >  2:2783264/4‑101 (MQ=11)


                                                                  ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGCTCGGCCGGGGCCGTGggg                                    >  1:3915400/1‑100 (MQ=11)


                                                                  gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                    <  1:2050268‑M2/99‑5 (MQ=255)


                                                                    tccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                  >  2:130470‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                                                    tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                  >  2:1230328‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                                                    tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                  <  2:3895072/101‑1 (MQ=11)


                                                                     tcgtgggatcggtctggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                 <  2:2657142/100‑1 (MQ=11)


                                                                      cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTgggatcgg                                <  2:302227‑M2/101‑9 (MQ=255)


                                                                       gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAtcggg                               >  2:583252/1‑100 (MQ=14)


                                                                       gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGACCGGTCGGCTCCGTGGCAtccgt                               >  1:3450751/1‑101 (MQ=11)


                                                                        gggggttgggcggggccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                              <  2:2939002/91‑1 (MQ=11)


                                                                          gtgtcggtcgggtccgtgggttcggtcggatcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg                            >  2:3707768‑M2/4‑89 (MQ=255)


                                                                                  gggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcg                    <  2:4435885/97‑1 (MQ=11)


                                                                                  cgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggccgggtccgtgg                    <  2:3460611‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                                                                   ggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg                   <  2:3283357‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                                                   ggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtggggtccggcgg                   >  2:152768/4‑101 (MQ=1)


                                                                                    gatccgtaggatgggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg                  <  1:1003866/99‑1 (MQ=11)


                                                                                     atccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggat                 >  2:3105685‑M2/2‑78 (MQ=255)


                                                                                        cgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtccg              <  2:518522‑M2/101‑27 (MQ=255)


                                                                                        cgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcgg              <  1:3539317‑M2/101‑27 (MQ=255)


                                                                                         gtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggt             <  2:659511‑M2/101‑28 (MQ=255)


                                                                                         gtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTcgggtccgtcggatccgt             >  1:3194434/1‑101 (MQ=11)


                                                                                          tggggtccttcggAGCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtgggatcggtc            <  2:3649094/92‑2 (MQ=11)


                                                                                          tggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtc            <  1:1509584/101‑2 (MQ=11)


                                                                                          taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTg            >  1:1737664/3‑101 (MQ=14)


                                                                                           gggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTgg           >  1:270822/1‑101 (MQ=11)


                                                                                           cggatctgtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg           >  2:3196082‑M2/2‑72 (MQ=255)


                                                                                            ggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg          <  1:1230420‑M2/101‑31 (MQ=255)


                                                                                             ggtccgtcggatCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggg         <  1:1084193‑M2/99‑32 (MQ=255)


                                                                                             ggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGa         <  2:4103016/96‑1 (MQ=11)


                                                                                              atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAt        >  2:4041780/1‑101 (MQ=11)


                                                                                              atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAt        <  1:2839446/101‑1 (MQ=11)


                                                                                                cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggagat      <  2:395350‑M2/101‑35 (MQ=255)


                                                                                                  ggcggGTCCGTAGGATCAGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt    <  2:4189315/99‑1 (MQ=14)


TCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221900‑222100

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG