BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,009	G→A	6.8%	P216P (CCC→CCT)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,009	0	G→A	6.8%	230.8 ‑0.5 ‑0.8	1562	P216P (CCC→CCT)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (56/47): ref base (711/667): total (819/743)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.10e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.55e-01

Only 100 of 1882 total aligned reads displayed.


CCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTC.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGG  >  NC_014034/221909‑222109


  ggATCGCGCTCATCGACGGTGGTCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                                     <  2:2223724/101‑1 (MQ=255)


  ggATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                                     >  2:511185/1‑101 (MQ=255)


     tCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                                  <  2:1135992/101‑1 (MQ=255)


      ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                 <  1:1390596‑M1/60‑1 (MQ=255)


      ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                 <  2:2842967‑M1/60‑1 (MQ=255)


       gcgcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGGCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                                >  1:4075334/1‑101 (MQ=255)


         ggggatcggtcgggtccgtcggagcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                              >  1:2289059‑M1/39‑101 (MQ=255)


          cTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                             >  2:1026880/1‑101 (MQ=255)


           ggatcggtcgtgtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                            >  2:924451‑M1/37‑101 (MQ=255)


             atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGggtccgtcggat                                                                                          <  1:1070100‑M1/67‑3 (MQ=255)


              tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                         >  1:1522401‑M1/34‑101 (MQ=255)


              tcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                         >  1:1175066‑M1/34‑101 (MQ=255)


               cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                        >  2:4427076‑M1/33‑101 (MQ=255)


               cGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                        >  1:4487978/1‑101 (MQ=255)


                ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                       >  1:660589‑M1/32‑101 (MQ=255)


                  tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                                     >  2:3075086‑M1/30‑101 (MQ=255)


                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                   >  1:1755168‑M1/28‑101 (MQ=255)


                     ggggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                  <  2:4357590/100‑1 (MQ=255)


                     gatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                                  <  1:3708043‑M1/75‑1 (MQ=255)


                        gCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                               <  2:2157761/101‑1 (MQ=255)


                        ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                               >  1:59160‑M1/24‑101 (MQ=255)


                         cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                              >  2:1768936‑M1/23‑101 (MQ=255)


                           tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                            <  1:130484‑M1/81‑1 (MQ=255)


                            ggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                           >  1:4354485‑M1/20‑101 (MQ=255)


                              gatagggtggCTCTGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggg                                                                         <  2:731905/93‑2 (MQ=14)


                               atcggtcggatccgtgGTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGgatcggtcgggc                                                                        <  1:4418626‑M1/85‑3 (MQ=255)


                                tGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                       <  1:489648/101‑1 (MQ=255)


                                 ccGTGGGTTCGGTCTGATCCGTAGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATcg                                                                      <  2:571950/100‑2 (MQ=14)


                                  cGTGGGTTCCGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                     <  1:756050/101‑1 (MQ=11)


                                      tggggctggggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                 <  1:3796938/92‑1 (MQ=11)


                                      ggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTggg                                                                 <  1:199100/92‑1 (MQ=11)


                                       gatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                >  1:3018175‑M1/9‑101 (MQ=255)


                                        gggcgtgggatcggtcgggaccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                               <  2:237256/94‑1 (MQ=11)


                                         tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                              <  2:630124/101‑1 (MQ=255)


                                          tcgggGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATccgtggggtcc                                                             >  2:3244413‑M1/6‑97 (MQ=255)


                                          ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                             >  2:3012361‑M1/6‑101 (MQ=255)


                                           cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                            >  2:1284320‑M1/5‑101 (MQ=255)


                                            gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGATCCGTGGGAtcggt                                                           >  2:1418832/4‑101 (MQ=14)


                                             tgggatcggtcgtgtccttgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGAGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                          <  2:4101904/99‑1 (MQ=14)


                                             gggggttggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgggggctcGGTCGGGTCTGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                          <  1:1690243/94‑1 (MQ=14)


                                             ggGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                          >  1:2456765‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                              gggatcgttcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                         <  2:4547174/100‑1 (MQ=11)


                                              gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAccggtcg                                                         >  1:2127287/2‑101 (MQ=11)


                                              gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTAGGATCGGGCGGGTCGCGGGTAtcggtag                                                         >  2:208437/2‑99 (MQ=14)


                                              gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                         >  1:2366659‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                              gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                         <  1:2213678‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                              gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggatccgtggggtccgtgg                                                         <  1:537301‑M1/100‑9 (MQ=255)


                                                gatcggtcgggtccggggggtccgtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg                                                       <  1:335744/101‑1 (MQ=11)


                                                   tggtccggtgcttcggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGCGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                    <  2:818699/100‑1 (MQ=11)


                                                   gggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                    <  1:462467/100‑1 (MQ=11)


                                                   cgttggggttcgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                    <  1:3460865/96‑1 (MQ=11)


                                                   cggtggggtccgtgggagcggtcgggtccgtggggtCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                    <  1:2913988/101‑1 (MQ=14)


                                                    ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggacCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCAGTCGGGACCg                                                   >  2:2015366/1‑101 (MQ=14)


                                                    gggcgggtccgtgggctcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                   <  1:2714668/98‑1 (MQ=11)


                                                    gggcggggccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                   <  1:184837/98‑1 (MQ=11)


                                                       cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCgcgg                                                >  1:4149193/1‑98 (MQ=11)


                                                         ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggacgGATCCGTGGTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggga                                              >  1:1604767‑M2/1‑97 (MQ=255)


                                                         gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGATCGGTCGGGACCgcggga                                              >  2:1228553/3‑96 (MQ=11)


                                                         gatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGtggca                                              >  2:4625577/3‑97 (MQ=11)


                                                          gtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGACGGGGCCGTGGGAt                                             >  2:3879893/1‑101 (MQ=14)


                                                          atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTcccggggat                                             >  1:93907/2‑94 (MQ=11)


                                                           tccgggggatcgggcggatccgtgggagcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc                                            <  1:848557/101‑1 (MQ=11)


                                                            ccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCTGGGCCGTGGGAgcg                                           >  2:377632/1‑101 (MQ=11)


                                                             cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGACCGGTCGGGTCGGTGgggccgg                                          >  2:2572915/1‑96 (MQ=11)


                                                             cggaggttcggtcgggtcggtcgggtcggtcggGTCCGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                          <  2:3620138/94‑1 (MQ=11)


                                                               tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTgggatcggtg                                        <  1:2578626‑M2/101‑11 (MQ=255)


                                                               tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc                                        <  2:2456202‑M2/101‑11 (MQ=255)


                                                                gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGGCGGGTCGGCGGGAtctgtcg                                       >  2:1925635/1‑101 (MQ=11)


                                                                gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtgg                                       >  2:3502910/1‑99 (MQ=11)


                                                                gggagcgggcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtcg                                       <  2:4281778/101‑1 (MQ=11)


                                                                 ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGGCCGTGGGAtcgggggg                                      >  2:4031461/1‑97 (MQ=11)


                                                                   atcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGCGGGATCGGTCGGATCCGTGGGACCGCGCGGGACGGGGGGAtcgggccggc                                    >  2:1690132/1‑95 (MQ=2)


                                                                   atcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggt                                    <  2:1599610‑M2/101‑15 (MQ=255)


                                                                    tccgtggggtcggtggggtccgtcggATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                                   <  2:2707158/95‑1 (MQ=11)


                                                                     cggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGGTCGGTGGGAtcggtggcggcg                                  >  1:3926391/1‑94 (MQ=11)


                                                                      ggtcgggtccgtcggatctgtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg                                 <  1:3852508/101‑1 (MQ=11)


                                                                        tcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtc                               <  1:3094350/101‑1 (MQ=11)


                                                                         gggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcg                              <  1:2768350/97‑1 (MQ=255)


                                                                         cgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGgtcggggccgtgg                              >  2:3422139/1‑99 (MQ=11)


                                                                         cgggtccgtgggatcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcg                              <  1:3283602/101‑1 (MQ=11)


                                                                         cgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgg                              <  2:2647590‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                                                         cgagtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTCGGCTCGGCCGGGTCCGTGGGCTCGgtcgggtccgtgg                              >  1:2655853/4‑99 (MQ=11)


                                                                          gtatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                             <  2:3323720/98‑1 (MQ=255)


                                                                          gggtccgtgggatcggtcggGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg                             >  1:3202987‑M2/1‑80 (MQ=255)


                                                                          ggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtggggtccggcgg                             >  2:152768/4‑101 (MQ=1)


                                                                           gatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATGGGTCGGGTCGGGGGGATCGgtcggggccggggga                            >  2:2774787/3‑96 (MQ=11)


                                                                           gatccgtaggatgggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg                            <  1:1003866/99‑1 (MQ=11)


                                                                            atccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTTGGATCGgtcggttccgctgtac                           >  2:230767/2‑95 (MQ=11)


                                                                              ccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcg                         >  2:3692661‑M2/1‑76 (MQ=255)


                                                                               cgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                        <  1:3539317‑M2/101‑27 (MQ=255)


                                                                                gtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTggggtccgtcggggc.cgt                      >  1:2048653/4‑101 (MQ=11)


                                                                                   ggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                    <  1:1230420‑M2/101‑31 (MQ=255)


                                                                                       cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggagat                <  2:395350‑M2/101‑35 (MQ=255)


                                                                                         ggcggGTCCGTAGGATCAGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTC.CGTGGGAtcggt             <  2:4189315/99‑1 (MQ=14)


                                                                                           gggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGAAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGC.CGTGGGAtcggagg           >  1:2837668/2‑98 (MQ=14)


                                                                                           cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTC.CGTGGGAtcggtcg           <  1:3971519/101‑1 (MQ=14)


                                                                                             gATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCCGGGTCGCGTggagacgtcggc          >  2:3174083/1‑91 (MQ=11)


                                                                                                ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGCC.CGTGGGAGCGGCCGGGTcc      >  2:2916046/1‑101 (MQ=11)


                                                                                                   tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc    <  1:4248059‑M2/101‑47 (MQ=255)


                                                                                                    gggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg   <  1:3645860‑M2/101‑48 (MQ=255)


CCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTC.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGG  >  NC_014034/221909‑222109

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 12 ≤


ATCG

< 21 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG