BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,012	A→G	5.9%	D215D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,012	0	A→G	5.9%	167.9 ‑1.5 0.0	1592	D215D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (46/54): ref base (780/708): total (828/764)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.17e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1918 total aligned reads displayed.


GATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAT  >  NC_014034/221912‑222112


   ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                   <  1:1390596‑M1/60‑1 (MQ=255)


   ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                   <  2:2842967‑M1/60‑1 (MQ=255)


     gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                                 >  2:1233933‑M1/40‑101 (MQ=255)


          atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGggtccgtcggat                                                                                            <  1:1070100‑M1/67‑3 (MQ=255)


           tcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                           >  2:1775029‑M1/34‑101 (MQ=255)


              gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                        >  2:726584‑M1/31‑101 (MQ=255)


              gtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                        >  2:3424904‑M1/31‑101 (MQ=255)


                 ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                     >  1:1683106‑M1/28‑101 (MQ=255)


                  ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                    >  2:564986‑M1/27‑101 (MQ=255)


                    tgcgtgggatgggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                  >  1:3343005‑M1/25‑101 (MQ=255)


                    tccgtgggatcggtcggatcggtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                  >  2:40908‑M1/25‑101 (MQ=255)


                    tccgggggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                  >  1:2452675‑M1/25‑101 (MQ=255)


                    gccgtgggagcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                  >  1:596901‑M1/25‑101 (MQ=255)


                     tcgtgggatcggtcgggtccctgAGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                 >  2:4346833‑M1/24‑101 (MQ=255)


                     cggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtcc                                                                                 <  2:1538534/99‑2 (MQ=11)


                     ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                 >  1:1229286‑M1/24‑101 (MQ=255)


                        gcgggtccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtccgtg                                                                              <  1:4261977/94‑2 (MQ=11)


                          ggatcggtcggctccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                            >  2:4407561‑M1/19‑101 (MQ=255)


                            atcggtcggatccgtgGTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGgatcggtcgggc                                                                          <  1:4418626‑M1/85‑3 (MQ=255)


                             tGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                         <  1:489648/101‑1 (MQ=255)


                              cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                                        >  1:3979980‑M1/15‑101 (MQ=255)


                              cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                        <  2:628382‑M1/87‑1 (MQ=255)


                               ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCg                                                                       <  1:538758‑M1/88‑1 (MQ=255)


                               cGTGGGTTCCGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                       <  1:756050/101‑1 (MQ=11)


                               cGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCg                                                                       <  2:3087880/101‑1 (MQ=11)


                                    ggtcggtgggAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                                  <  1:1746439/99‑1 (MQ=14)


                                     gtcggtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCgtggggt                                                                 >  1:3789757‑M1/8‑99 (MQ=255)


                                      tcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                                                <  2:506298/101‑1 (MQ=11)


                                      tccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                                                <  2:104105/98‑1 (MQ=11)


                                      tccgggGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                <  2:3950000‑M1/95‑1 (MQ=255)


                                       ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                               >  2:377459‑M1/6‑101 (MQ=255)


                                        cgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATAGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGTCGGAtcgg                                                              >  2:811005/2‑101 (MQ=14)


                                         gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                             >  1:2039349‑M1/4‑101 (MQ=255)


                                         gtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggg                                                             >  1:3180877/1‑100 (MQ=11)


                                          tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATAGGTGGGGTCTGTGGGAtaggag                                                            >  2:4266455/3‑99 (MQ=11)


                                          ggGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                            >  1:2998140‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                           gggatcggtcgggtccgtgggatcggtggggtcggtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                           <  1:236250/100‑1 (MQ=11)


                                            ggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGaagatcgga                                                          >  2:2654026/1‑93 (MQ=11)


                                            ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtgcgccgg                                                          >  2:2016158/1‑94 (MQ=11)


                                             ggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGTCggg                                                         >  1:3531325/6‑101 (MQ=11)


                                             gatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtagGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg                                                         >  2:1704547/1‑101 (MQ=11)


                                              gtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGGCGGGGCCGTGGGATCGGCCGGGCCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCgggc                                                        >  1:2691363/5‑100 (MQ=11)


                                              atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtgggat                                                        >  1:2637297/1‑99 (MQ=255)


                                              atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGGGGGGTCGGGCgggg                                                        >  2:3333488/1‑100 (MQ=11)


                                              agcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGt                                                        <  2:3178581/99‑1 (MQ=11)


                                               tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                       >  2:2322615/1‑101 (MQ=11)


                                                gggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                      <  1:462467/100‑1 (MQ=11)


                                                cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                      <  1:1286301/101‑1 (MQ=11)


                                                cggtccggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                      >  2:1932076/1‑101 (MQ=11)


                                                 ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcTGTCGGATCCGTGGGATCTGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCTGGTCCGTGGGATCAGGCGGGTctg                                                     >  1:2266056/1‑99 (MQ=11)


                                                  gtcgtgtccgtgggttcggtcgggtcggtcggatcgGTGGGATCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGt                                                    <  2:2709436/101‑1 (MQ=11)


                                                  gtcgggggtgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                    <  1:3637238/92‑1 (MQ=11)


                                                  gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                    <  2:4622060/101‑1 (MQ=11)


                                                   tggggtccgcgggctcggtcgggtctgtgggttcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                   <  2:1419354/99‑2 (MQ=14)


                                                    cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCgcgg                                                  >  1:4149193/1‑98 (MQ=11)


                                                     gggtccggggggtcggtcgggtccgtgggagcggtcGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                 <  1:2906625/101‑1 (MQ=11)


                                                     ggagccgtgggatcggtcggatccgtagggtcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCgg                                                 <  2:2922981/97‑1 (MQ=11)


                                                      ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGCGCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGggc                                                >  2:4168822/1‑100 (MQ=11)


                                                       gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                               >  2:161025‑M2/1‑96 (MQ=255)


                                                       gtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGACGGGGCCGTGGGAt                                               >  2:3879893/1‑101 (MQ=14)


                                                        tccgttgcatcggtccggtgcgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                              <  2:1148564/101‑1 (MQ=11)


                                                        tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                              >  2:3692165‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                                         ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                             >  1:11739‑M2/1‑94 (MQ=255)


                                                          cggaggttcggtcgggtcggtcgggtcggtcggGTCCGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                            <  2:3620138/94‑1 (MQ=11)


                                                           gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggg                                           >  2:2385662/1‑100 (MQ=11)


                                                             cggatccgtcggatctgtggggtcggtgggATCGGTCGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtcg                                         <  2:4532667/100‑1 (MQ=11)


                                                                 tcggtcgggtccgtggaatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtc                                     <  1:4075399‑M2/101‑16 (MQ=255)


                                                                  cggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGGTCGGTGGGAtcggtggcggcg                                    >  1:3926391/1‑94 (MQ=11)


                                                                   ggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGCTCGgtcgggtcgg                                   >  2:908137/1‑99 (MQ=11)


                                                                   ggtcgggtccgtcggatctgtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg                                   <  1:3852508/101‑1 (MQ=11)


                                                                    gtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTGGGATGGGGCGGGTCGGTGGGGTGGgtcggatccgg                                  >  2:4009477/1‑100 (MQ=11)


                                                                      cgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGgtggggtccgcgg                                >  1:3068541/1‑98 (MQ=11)


                                                                       ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                               >  1:855326/4‑101 (MQ=255)


                                                                       ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                               >  1:1830145/4‑101 (MQ=255)


                                                                        gatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATGGGTCGGGTCGGGGGGATCGgtcggggccggggga                              >  2:2774787/3‑96 (MQ=11)


                                                                        gatccgtaggatgggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg                              <  1:1003866/99‑1 (MQ=11)


                                                                        gatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg                              >  2:3017946/3‑101 (MQ=11)


                                                                           cggtgggatcggtcgggtCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcg                           >  1:2121087‑M2/3‑76 (MQ=255)


                                                                           ccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                           >  1:2753295/1‑101 (MQ=14)


                                                                             gtgggttccgtctgATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt                         <  2:2095881/101‑1 (MQ=14)


                                                                                gggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGATCGGTggg                      >  1:2826741/7‑101 (MQ=11)


                                                                                    cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtcc                  <  1:2560108/101‑2 (MQ=11)


                                                                                     ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                 <  1:3692936‑M2/101‑36 (MQ=255)


                                                                                      gtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGGGGGGtcggt                >  2:3245364/1‑101 (MQ=14)


                                                                                      gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGTCCGTCGGAtccgt                >  1:661608/1‑101 (MQ=11)


                                                                                      gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgt                <  1:160441/101‑1 (MQ=11)


                                                                                       tcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtg               <  1:3245609/101‑2 (MQ=11)


                                                                                        tggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgg              >  2:1317060‑M2/2‑63 (MQ=255)


                                                                                            tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatc          <  1:4367381‑M2/101‑43 (MQ=255)


                                                                                            tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatc          >  1:345011‑M2/1‑59 (MQ=255)


                                                                                             cggtaggATCGGTGGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCTGGCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc         <  1:152899/96‑1 (MQ=14)


                                                                                             ccGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg         >  2:2230267‑M2/1‑58 (MQ=255)


                                                                                              ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg        >  2:2587096/5‑101 (MQ=17)


                                                                                               gtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg       >  1:2207289/4‑100 (MQ=17)


                                                                                               gtcggATCCGTGGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt       <  1:4501247/98‑1 (MQ=17)


                                                                                               gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgt       <  2:2165391‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                                                                 gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcg     <  1:945250‑M2/101‑48 (MQ=255)


                                                                                                    aTCCGTGGGGTTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTAGGATCGGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt  <  2:2472939/101‑1 (MQ=18)


                                                                                                    aTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt  >  2:3509535/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                    aTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt  >  1:1967427/1‑101 (MQ=255)


GATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAT  >  NC_014034/221912‑222112

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 14 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG