BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,015	G→C	7.7%	T214T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,015	0	G→C	7.7%	229.7 ‑0.6 ‑0.0	1540	T214T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (67/57): ref base (720/693): total (787/753)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.74e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.63e-01

Only 100 of 1934 total aligned reads displayed.


CGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221915‑222115


    gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                  <  1:2065729‑M1/64‑1 (MQ=255)


       atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGgatcggtcggat                                                                                               <  1:3191860‑M1/67‑3 (MQ=255)


       atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGggtccgtcggat                                                                                               <  1:1070100‑M1/67‑3 (MQ=255)


        tcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                              >  1:1175066‑M1/34‑101 (MQ=255)


        tcgggcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                              >  1:3352080‑M1/34‑101 (MQ=255)


           gtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                           >  2:3424904‑M1/31‑101 (MQ=255)


           gtcgggtccgtcggatcggtcgggcccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                           >  2:2655668‑M1/31‑101 (MQ=255)


             ggTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                         >  2:2336227/1‑101 (MQ=255)


              gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtggt                                                                                        <  1:3088124‑M1/74‑2 (MQ=255)


               ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                                       >  1:1691110‑M1/27‑101 (MQ=255)


                  gCGTCGGAGGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                    <  1:859486/101‑1 (MQ=255)


                     tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                 <  1:3809160‑M1/81‑1 (MQ=255)


                       ggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                               >  1:4625681‑M1/19‑101 (MQ=255)


                        gatagggtggCTCTGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggg                                                                              <  2:731905/93‑2 (MQ=14)


                         atcggtcggatccgtgGTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGgatcggtcgggc                                                                             <  1:4418626‑M1/85‑3 (MQ=255)


                           ccGTGGGTTCGGTCTGATCCGTAGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATcg                                                                           <  2:571950/100‑2 (MQ=14)


                            ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                          <  2:11734‑M1/88‑1 (MQ=255)


                            ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGatcgg                                                                          <  2:4538368‑M1/88‑3 (MQ=255)


                                 gatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                     >  2:2479857‑M1/9‑101 (MQ=255)


                                 gatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                     >  1:3018175‑M1/9‑101 (MQ=255)


                                 gCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTcggg                                                                     <  2:821425/101‑2 (MQ=11)


                                  cTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                    >  2:4186199/1‑101 (MQ=255)


                                   tcggtcggGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                   <  2:3255531/101‑1 (MQ=255)


                                   tcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                                                   <  2:506298/101‑1 (MQ=11)


                                   tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                   <  2:1948366/101‑1 (MQ=255)


                                   tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                   <  2:630124/101‑1 (MQ=255)


                                   tccgtgggctcggtcgggccggtcggaccggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtc                                                                   <  2:1642939/92‑1 (MQ=11)


                                   gcggtgggATCGGTCGGGTCGGTTGGATCCGTCGGCTCCCTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                   <  2:2175034/100‑1 (MQ=11)


                                     cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                 <  1:3649362‑M1/97‑1 (MQ=255)


                                       cgagctcggtcggctccgttcgatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                               <  2:4418090/96‑1 (MQ=11)


                                        gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                              >  2:2843590‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                        gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                              <  1:2213678‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                           ctcggttgggtgcgtgggttcggtgtggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                           <  2:2410723/100‑1 (MQ=11)


                                           atcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                           >  1:1320961/1‑99 (MQ=11)


                                           agcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGt                                                           <  2:3178581/99‑1 (MQ=11)


                                             gggtcggggccgagggatcggtcgggtcggtggggtcGGTCGGGCCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                         <  1:175895/100‑1 (MQ=14)


                                             cggtggggtccgtgggagtggtcggatccgtaggatCGGTGGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                         <  2:1574449/101‑1 (MQ=11)


                                             ccgtcgcatccgtgggatgggtcggagccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                         <  1:386609/93‑1 (MQ=14)


                                              ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccggggggtcCGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGAGCCGGGGGATCGGTCGGGACCg                                                        >  2:2921957/1‑101 (MQ=14)


                                              ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                        <  2:1812326/101‑1 (MQ=11)


                                               gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgg                                                       >  1:2920647/1‑100 (MQ=11)


                                               gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                       >  2:1048495/1‑101 (MQ=14)


                                               ctggggcccgtgggatccgccgggtccgtgggatcggtcGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                       <  2:4352146/98‑1 (MQ=11)


                                                tcgggttcgtgggatcggtcgtgtccgttggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                      <  1:4087742/101‑2 (MQ=11)


                                                tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCggg                                                      >  1:602356/1‑99 (MQ=11)


                                                 tggctccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                     <  2:4024673/97‑3 (MQ=11)


                                                 cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                     >  1:4502417‑M2/1‑99 (MQ=255)


                                                  ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                                    >  2:2783264/4‑101 (MQ=11)


                                                   ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGAGGGGTGCGTGggg                                                   >  2:462430/1‑100 (MQ=11)


                                                   gatccgtgggatctgtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGa                                                   <  2:2108706/99‑1 (MQ=11)


                                                    gtccgtgggatcgggcgggtccgggggatcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                  <  1:198979/101‑1 (MQ=11)


                                                    atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggat                                                  <  1:4367514‑M2/100‑6 (MQ=255)


                                                     tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                 >  1:958256‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                                     tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                 >  2:3692165‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                                     tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                 >  1:3714240‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                                     ggggggggatcggtcgtgtccgtgggttagggcggGTCGGTGGGAGGGGTCGGGTCCGAGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                 <  1:1607016/96‑1 (MQ=2)


                                                      tcgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcc                                                <  2:1331365/100‑2 (MQ=11)


                                                      ccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGAtcg                                                >  1:674886/1‑101 (MQ=11)


                                                      ccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCTGGGCCGTGGGAgcg                                                >  2:377632/1‑101 (MQ=11)


                                                       cgtggtgtctgttgggtttgtgggttcggtcggGTCCGTGGGATCGGTTGGGTTCTTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccg                                               <  1:1860173/101‑3 (MQ=2)


                                                       cggaggttcggtcgggtcggtcgggtcggtcggGTCCGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                               <  2:3620138/94‑1 (MQ=11)


                                                         tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTgggatcggtg                                             <  1:2578626‑M2/101‑11 (MQ=255)


                                                          gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                            <  2:3337218‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                          gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                            >  1:3276914/1‑101 (MQ=14)


                                                          gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                            <  1:3465335‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                          gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtgg                                            >  2:3502910/1‑99 (MQ=11)


                                                           ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGAGGGATCGGACGGATCCGTTGGCtcggtggg                                           >  1:49218/1‑101 (MQ=11)


                                                            gatcggtcggatccgggggatcggacggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtccggccgg                                          >  2:3087978/1‑94 (MQ=11)


                                                             atcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTTCGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggat                                         >  1:4150929‑M2/1‑87 (MQ=255)


                                                               cggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGggcgggtcc                                       >  2:1440840/1‑101 (MQ=11)


                                                                ggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccg                                      >  2:2026486/1‑101 (MQ=11)


                                                                ggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGCTCGgtcgggtcgg                                      >  2:908137/1‑99 (MQ=11)


                                                                cgtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccg                                      >  1:230791‑M2/2‑84 (MQ=255)


                                                                 gtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGCCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt                                     <  1:3936528/101‑1 (MQ=14)


                                                                   cgagtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTCGGCTCGGCCGGGTCCGTGGGCTCGgtcgggtccgtgg                                   >  1:2655853/4‑99 (MQ=11)


                                                                    gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGGCGGTGGGGTCGgtcgggtccgggtg                                  >  2:2714472/1‑97 (MQ=11)


                                                                    gggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgggcgggtccggggg                                  <  2:1257511‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                                     ggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccgtcgga                                 <  2:3950916/101‑2 (MQ=11)


                                                                     gatccgtaggatgggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg                                 <  1:1003866/99‑1 (MQ=11)


                                                                      gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtggggt                                >  1:1544131‑M2/1‑78 (MQ=255)


                                                                          gtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCCGtggggtccgccgggtccgg                            >  2:4098854/4‑100 (MQ=11)


                                                                           tggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTg                           >  2:2242310/1‑101 (MQ=11)


                                                                           tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtc                           <  1:237280‑M2/101‑29 (MQ=255)


                                                                            gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg                          >  1:770790/1‑99 (MQ=11)


                                                                            gggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTgg                          >  1:270822/1‑101 (MQ=11)


                                                                                 cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcc                     >  1:3991386‑M2/1‑67 (MQ=255)


                                                                                  ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                    <  1:551521‑M2/101‑36 (MQ=255)


                                                                                  ggtcggATGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                    >  1:2145363‑M2/1‑66 (MQ=255)


                                                                                    tgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                  >  2:1730526/3‑101 (MQ=14)


                                                                                     gggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGAAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGAtcggagg                 >  1:2837668/2‑98 (MQ=14)


                                                                                     cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtgg                 >  1:1234025/1‑99 (MQ=11)


                                                                                     cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtgg                 >  1:2764728/1‑99 (MQ=11)


                                                                                          ccggaggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc            <  2:3018579/96‑1 (MQ=14)


                                                                                           ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg           <  1:354585/97‑1 (MQ=18)


                                                                                            gTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt          <  2:2592702/101‑1 (MQ=14)


                                                                                              cggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg        <  1:142061‑M2/100‑48 (MQ=255)


                                                                                               ggGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg       >  1:4275274‑M2/1‑53 (MQ=255)


                                                                                                gATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgga      >  2:427392‑M2/1‑52 (MQ=255)


                                                                                                gATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa      <  2:3886071/101‑1 (MQ=17)


                                                                                                   cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatcc   >  1:2468478‑M2/1‑49 (MQ=255)


CGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221915‑222115

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG