BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,021	G→A	27.6%	D212D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,021	0	G→A	27.6%	0.0 ‑0.8 0.0	1609	D212D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (211/234): ref base (575/588): total (787/822)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.69e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1945 total aligned reads displayed.


CATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGT  >  NC_014034/221921‑222121


  tcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                                    >  2:1775029‑M1/34‑101 (MQ=255)


  tcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                                    >  1:1175066‑M1/34‑101 (MQ=255)


   cggtcggttccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                   >  2:3797830‑M1/33‑101 (MQ=255)


     gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                                 >  1:216568‑M1/31‑101 (MQ=255)


      tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                                                >  1:3394024‑M1/30‑101 (MQ=255)


      tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                                <  1:1643044‑M1/72‑1 (MQ=255)


        gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                              >  1:4625878‑M1/28‑101 (MQ=255)


         ggggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                             <  2:4357590/100‑1 (MQ=255)


         gatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                                             <  1:3708043‑M1/75‑1 (MQ=255)


           tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                           >  1:3545069‑M1/25‑101 (MQ=255)


              gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                        >  1:3215785‑M1/22‑101 (MQ=255)


                ggtattggtcgggtccgtgGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                      >  2:259390‑M1/20‑101 (MQ=255)


                 ggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                     >  1:3470133‑M1/19‑101 (MQ=255)


                    tccGTGGGGTCCGGCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATc                                                                                  <  2:825592/99‑1 (MQ=14)


                     cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                                                 >  1:1553673‑M1/15‑101 (MQ=255)


                      ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                <  1:1436635‑M1/88‑1 (MQ=255)


                      ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGatcgg                                                                                <  2:4538368‑M1/88‑3 (MQ=255)


                       gtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                               <  1:1923911‑M1/89‑1 (MQ=255)


                         cgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGACGGGGCCGTgg                                                                             <  2:2225352‑M1/91‑1 (MQ=255)


                           gatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                           >  2:2479857‑M1/9‑101 (MQ=255)


                            gtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                          <  1:2605548‑M1/94‑1 (MQ=255)


                             tcggacggATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                         >  2:152885/1‑101 (MQ=255)


                              ccgtgTGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATccgtggggtcc                                                                        >  2:3511286‑M1/6‑97 (MQ=255)


                                gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGatcggc                                                                      <  1:2004004‑M1/98‑2 (MQ=255)


                                 tgggatcggtcgtgtccttgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGAGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                     <  2:4101904/99‑1 (MQ=14)


                                 tgggatcggtcgggtcggtgggatcggtcgggtccctgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtg                                                                     <  2:2667609/99‑2 (MQ=11)


                                 tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                     >  1:441898‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                 tcggAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                     <  2:2396674/101‑1 (MQ=11)


                                  tggatgggtcgggtccgttggattggtcgggtccgtgGGATCGGTCTGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                    <  2:2094260/100‑1 (MQ=14)


                                  cgattcggttggtgccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                    <  2:328172/97‑1 (MQ=11)


                                   gggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggTCCGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                   <  1:851778/98‑1 (MQ=11)


                                     atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                                 >  1:3798115/1‑99 (MQ=11)


                                      tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                <  2:580899/101‑1 (MQ=11)


                                      tccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCgggac                                                                >  2:4634602/4‑99 (MQ=11)


                                       cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc                                                               >  1:2230429/1‑101 (MQ=11)


                                        ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggacCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCAGTCGGGACCg                                                              >  2:2015366/1‑101 (MQ=14)


                                        gggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                              <  1:3860295/98‑1 (MQ=11)


                                         gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTGGGATCCgg                                                             >  2:904073/1‑100 (MQ=11)


                                         gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTcggg                                                             >  2:441861/1‑98 (MQ=11)


                                         gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                             >  1:2729808/1‑101 (MQ=11)


                                          tggggtccgcgggctcggtcgggtctgtgggttcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                            <  2:1419354/99‑2 (MQ=14)


                                          tcgggttcgtgggatcggtcgtgtccgttggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                            <  1:4087742/101‑2 (MQ=11)


                                            ggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCGGGGGGGTCCGTGgg                                                          >  2:3693210/4‑101 (MQ=11)


                                             ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                                         <  1:763490‑M2/101‑5 (MQ=255)


                                              gtccctgggctcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAt                                                        <  2:1036155/101‑1 (MQ=11)


                                              atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggat                                                        <  1:4367514‑M2/100‑6 (MQ=255)


                                              atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTcccggggat                                                        >  1:93907/2‑94 (MQ=11)


                                               tccgttgcatcggtccggtgcgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                       <  2:1148564/101‑1 (MQ=11)


                                               tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                       <  2:3895072/101‑1 (MQ=11)


                                               tccgggggatgggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                       >  1:2872566‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                                ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGtcg                                                      >  2:2872350/1‑101 (MQ=14)


                                                ccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcc                                                      <  2:2716138/101‑2 (MQ=11)


                                                  gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                                    >  1:3643432‑M2/1‑92 (MQ=255)


                                                  gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGGTCGGTCGGGTCGGTGGGAtgggg                                                    >  1:4157606/1‑100 (MQ=11)


                                                  gtgggagccgtcggatccgtggggtccgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggt                                                    <  2:1699633/101‑1 (MQ=11)


                                                   tgggatcggtcgggtccgtggggtcgggcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc                                                   >  2:3191617‑M2/1‑91 (MQ=255)


                                                   tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                   <  1:3126978/101‑1 (MQ=14)


                                                    gggagcgggcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtcg                                                  <  2:4281778/101‑1 (MQ=11)


                                                     ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGAGGGATCGGACGGATCCGTTGGCtcggtggg                                                 >  1:49218/1‑101 (MQ=11)


                                                     ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGGCCGTGGGAtcgggggg                                                 >  2:4031461/1‑97 (MQ=11)


                                                       atcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggt                                               <  2:1599610‑M2/101‑15 (MQ=255)


                                                       atcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtggggc                                               <  1:553027‑M2/101‑15 (MQ=255)


                                                         cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTACGTGGGATCGGGCGGGTCAGTGGGATGGgtcgggaca                                             >  2:3115193/1‑98 (MQ=11)


                                                         ccgtcggctccgtgggacccttcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                                             <  2:4187639/99‑1 (MQ=11)


                                                          ggtcgggtccggggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg                                            <  2:508337/101‑1 (MQ=11)


                                                            gcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtg                                          <  1:2418842/100‑2 (MQ=11)


                                                              gggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtgggatccgtggg                                        >  2:3342603/1‑101 (MQ=11)


                                                               gatccgtaggatgggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg                                       <  1:1003866/99‑1 (MQ=11)


                                                                     tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtc                                 >  1:2104185/1‑100 (MQ=11)


                                                                       gggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTggg                               <  2:3026582/92‑1 (MQ=14)


                                                                       ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatgggtcggatccgtgggatcggtcgg                               <  2:3426635‑M2/101‑31 (MQ=255)


                                                                       ggacccctgcgATCCTTGGGATTGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgg                               <  2:654023/91‑1 (MQ=1)


                                                                          tcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGtc                            <  2:2953086/101‑1 (MQ=11)


                                                                           cggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                           >  1:688268‑M2/1‑67 (MQ=255)


                                                                           cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtag                           <  2:2326024‑M2/101‑35 (MQ=255)


                                                                           cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggagat                           <  2:395350‑M2/101‑35 (MQ=255)


                                                                           cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                           <  1:1324423‑M2/101‑35 (MQ=255)


                                                                           cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcc                           >  1:3991386‑M2/1‑67 (MQ=255)


                                                                           ccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGAGGGGTCCGTCGGAtcc                           >  1:609971/3‑100 (MQ=11)


                                                                             gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggcatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt                         <  1:2796018‑M2/101‑37 (MQ=255)


                                                                             gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgt                         <  1:124666‑M2/101‑37 (MQ=255)


                                                                             gccggGTCCGTGGGAGCTGTCGGCTCCGTGCGTTCGCGCGGCTCCGTCGAATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggt                         <  2:1933650/99‑1 (MQ=9)


                                                                              tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc                        <  1:2497332/101‑1 (MQ=11)


                                                                               tggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgg                       >  2:1317060‑M2/2‑63 (MQ=255)


                                                                               gggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                       >  1:3931124/2‑101 (MQ=17)


                                                                                ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGCGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGGCGGGtctgtcgg                      >  1:295513/1‑101 (MQ=11)


                                                                                 ggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggg                     <  2:2793754/99‑2 (MQ=14)


                                                                                  aTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt                    >  1:1705289/1‑101 (MQ=11)


                                                                                    ccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcg                  <  1:1772856‑M2/101‑44 (MQ=255)


                                                                                      gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgt                <  2:2165391‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                                                      gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                <  1:4277303‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                                                          gATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa            >  1:3026811/1‑101 (MQ=17)


                                                                                             cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc         >  1:2322777‑M2/1‑49 (MQ=255)


                                                                                              ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccggggggtcggtcgggtccg        <  1:3304701‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                                                              ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccg        <  1:4506426‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                                                                tggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc      <  2:1239485/99‑1 (MQ=255)


                                                                                                  gggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGCCGGAtcggtccg    >  1:1075131/1‑99 (MQ=14)


                                                                                                  ggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggg    <  2:73771‑M2/101‑58 (MQ=255)


                                                                                                   ggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCggg   >  1:2678047/1‑101 (MQ=17)


                                                                                                    gTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggat  <  2:3629389‑M2/101‑60 (MQ=255)


CATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGT  >  NC_014034/221921‑222121

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG