BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,051	G→C	1.4%	T202T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,051	0	G→C	1.4%	23.5 ‑1.3 ‑0.5	1279	T202T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (6/14): ref base (545/711): total (552/727)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.63e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.23e-01

Only 100 of 1924 total aligned reads displayed.


CGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGC  >  NC_014034/221951‑222151


 cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGAtcgg                                                                                                     >  2:198955/5‑101 (MQ=11)


 cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                                     <  1:3649362‑M1/97‑1 (MQ=255)


  gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                                    >  2:1418832/4‑101 (MQ=14)


   tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   >  1:441898‑M1/3‑101 (MQ=255)


    gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggtcg                                                                                                  >  2:4073333/2‑101 (MQ=11)


    gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                  <  1:1177001‑M1/100‑1 (MQ=255)


    gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                  >  2:3762018‑M1/2‑101 (MQ=255)


     ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtcggacgg                                                                                                 >  2:3393771/1‑101 (MQ=14)


     ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg                                                                                                 <  2:2690769/101‑1 (MQ=11)


     ggaacgggcgggtgcgtggggacggtaggatccgggGGGTCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                 <  1:2089415/101‑1 (MQ=2)


      ggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCggg                                                                                                <  1:1599715/99‑1 (MQ=14)


       atcggtcggagccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                                                               <  1:3906785/101‑3 (MQ=14)


        tccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                              >  2:533930/4‑101 (MQ=14)


         ccgtccgccccgtgcgatcggtcgggtccgtggcatcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                             <  1:4026774/92‑1 (MQ=11)


          ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                            <  1:3095396/101‑1 (MQ=14)


            tcggatccgtgggatcggtcgggtcggtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                                                          <  2:2064051/101‑2 (MQ=11)


            tcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTg                                                                                          <  1:259414‑M2/101‑2 (MQ=255)


             cgggtccgtgggctcggtctggcgcgtcggctcggtCGGGTCCGTGTGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                                                         <  2:4148905/101‑3 (MQ=11)


             cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                         >  1:3955710‑M2/1‑99 (MQ=255)


              gggttcgttggaatggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                                        <  2:1595632/101‑1 (MQ=11)


               ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                                                                       <  1:763490‑M2/101‑5 (MQ=255)


               ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtggGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                                                                       >  2:2452348‑M2/1‑97 (MQ=255)


                atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggt                                                                                      >  1:4160709/2‑99 (MQ=11)


                atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTcccggggat                                                                                      >  1:93907/2‑94 (MQ=11)


                 tccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                                                     >  2:130470‑M2/1‑95 (MQ=255)


                 tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                                                     >  2:1230328‑M2/1‑95 (MQ=255)


                 tccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                     <  2:836456/101‑1 (MQ=11)


                  ccgtggggtgcgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                    <  1:1771018/101‑1 (MQ=11)


                  ccgtgggatcggtcgggtccgtgggctccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                                                                    >  2:3660328‑M2/1‑94 (MQ=255)


                  ccgggggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                    <  2:4308974/101‑1 (MQ=11)


                   cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtccg                                                                                   <  2:2827918‑M2/101‑9 (MQ=255)


                     ttgggtcggtcggagccgtgggatcggtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtc                                                                                 <  2:4574783/96‑1 (MQ=11)


                     tgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc                                                                                 <  1:1317153‑M2/101‑11 (MQ=255)


                     tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                 >  1:2667794/1‑101 (MQ=14)


                     tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGGGGGAtgcggg                                                                                 >  2:2982680/1‑96 (MQ=11)


                      gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCGGTGGGAtcggtcg                                                                                >  2:2149933/1‑101 (MQ=11)


                      gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                                                                <  1:4097315‑M2/101‑12 (MQ=255)


                      gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                                                                <  1:3816678‑M2/101‑12 (MQ=255)


                       ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGAGGGATCGGACGGATCCGTTGGCtcggtggg                                                                               >  1:49218/1‑101 (MQ=11)


                             gtcgggtccgtgggttctgttgaATCCGTGGGATCCGTCAGATCCGTGCGATCGTTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt                                                                         <  2:3043192/101‑1 (MQ=11)


                              tcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtg                                                                        <  1:2243103‑M2/101‑20 (MQ=255)


                              gcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtg                                                                        <  1:2418842/100‑2 (MQ=11)


                               cgggtccgtgggatcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcg                                                                       <  1:3283602/101‑1 (MQ=11)


                               cgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGggcgggtccgtcg                                                                       >  2:2539762/1‑101 (MQ=11)


                                gggtccgtgggatcggtcggGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg                                                                      >  1:3202987‑M2/1‑80 (MQ=255)


                                ggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg                                                                      >  1:2346802/4‑101 (MQ=11)


                                ggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtggggtccggcgg                                                                      >  2:152768/4‑101 (MQ=1)


                                 ggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggg                                                                     <  2:4212928‑M2/101‑23 (MQ=255)


                                 gatccgtaggatgggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg                                                                     <  1:1003866/99‑1 (MQ=11)


                                    ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgacgggtccgtaggatcg                                                                  >  2:2364124/1‑100 (MQ=11)


                                        gggctcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTgg                                                              <  1:201320/101‑1 (MQ=11)


                                         gggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTggg                                                             >  1:3554725/7‑101 (MQ=14)


                                          ggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGa                                                            <  2:2896088/93‑1 (MQ=14)


                                          ggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGCGGGa                                                            >  1:2499852/6‑101 (MQ=11)


                                             cggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                         >  1:688268‑M2/1‑67 (MQ=255)


                                             cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtcc                                                         <  2:3133904/101‑2 (MQ=11)


                                              ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccg                                                        >  1:2860732/1‑99 (MQ=11)


                                               gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggcatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt                                                       <  1:2796018‑M2/101‑37 (MQ=255)


                                               gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgt                                                       <  1:124666‑M2/101‑37 (MQ=255)


                                                 cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggacggggccgtgg                                                     <  2:1032007‑M2/101‑39 (MQ=255)


                                                 cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtgg                                                     >  1:2933759/1‑99 (MQ=11)


                                                  ggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGGtcggccgg                                                    >  2:4001580/1‑101 (MQ=14)


                                                  ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggg                                                    <  2:3203192‑M2/101‑40 (MQ=255)


                                                   ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcggg                                                   >  1:553197/3‑100 (MQ=11)


                                                   gctccGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                                   >  2:3304456‑M2/3‑61 (MQ=255)


                                                     tCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATc                                                 <  1:1704658/101‑1 (MQ=11)


                                                        gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                                              <  1:4277303‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                         tcggATCCGTGGGGTCCGTGTGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                             <  2:2755818/99‑1 (MQ=18)


                                                             aTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                         <  1:1929982/101‑1 (MQ=14)


                                                              gcggtcggGTCCGGCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                        <  2:1910660/100‑1 (MQ=14)


                                                               cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                       >  1:217958‑M2/1‑49 (MQ=255)


                                                                ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGGGGGGTCGGTGCGGTCCGTCGGAgcgg                                      >  2:1674568/1‑101 (MQ=14)


                                                                ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                      <  1:2725954‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                                cgtcggGTCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                      <  2:39269/100‑1 (MQ=17)


                                                                  tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                    >  1:85166/1‑101 (MQ=17)


                                                                  tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                    >  1:3364341/1‑101 (MQ=17)


                                                                    gggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGCCGGAtcggtccg                                  >  1:1075131/1‑99 (MQ=14)


                                                                    ggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggg                                  <  2:73771‑M2/101‑58 (MQ=255)


                                                                      atcCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatccgtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                >  2:2621567‑M2/2‑42 (MQ=255)


                                                                       tCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTc                               <  1:4356118/101‑1 (MQ=17)


                                                                       tCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                               >  1:3468240‑M2/1‑41 (MQ=255)


                                                                         cGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCg                             <  1:1428376/101‑1 (MQ=17)


                                                                         cGGGGGTTCGGTCGGATCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                             >  2:613623‑M2/1‑39 (MQ=255)


                                                                          gtcggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCCGGTCCGGGGGATGCGTCGGGGCGGTCGGGTCGGTCGGGTcctg                            >  2:3860010/4‑99 (MQ=9)


                                                                           tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtg                           <  1:4522559‑M2/101‑65 (MQ=255)


                                                                             ggATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                         >  2:4396997‑M2/1‑35 (MQ=255)


                                                                               aTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggat                       >  1:1525413/1‑99 (MQ=17)


                                                                                tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGGGGCGGgggggc                      >  2:3472029/1‑99 (MQ=11)


                                                                                 tggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtcc                     >  2:2215950‑M2/2‑31 (MQ=255)


                                                                                       gggccGTGGGGTCGGGCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGa               <  1:4595249/98‑1 (MQ=18)


                                                                                        gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggat              >  2:3576817‑M2/2‑24 (MQ=255)


                                                                                           cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgg           <  2:476560‑M2/101‑81 (MQ=255)


                                                                                           cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcgg           <  2:2307456/101‑1 (MQ=255)


                                                                                              gggGTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtcg        <  1:3010780/101‑1 (MQ=255)


                                                                                               ggatcggtcgtgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgg       >  2:924451‑M2/1‑17 (MQ=255)


                                                                                               ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtcgg       <  1:3722096/101‑1 (MQ=255)


                                                                                                 atcgggtgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggt     >  2:4483297‑M2/1‑15 (MQ=255)


                                                                                                  tcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtc    >  2:1775029‑M2/1‑14 (MQ=255)


                                                                                                   cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggatccgtgggatcgggcgggtcc   <  2:1142765‑M2/101‑89 (MQ=255)


                                                                                                    ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg  <  1:610824‑M2/101‑90 (MQ=255)


CGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGC  >  NC_014034/221951‑222151

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG