Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 678,771 | G→A | 8.5% | I1612I (ATC→ATT) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 678,771 | 0 | G→A | 8.5% | 40.3 ‑0.2 ‑0.6 | 233 | I1612I (ATC→ATT) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (11/9): ref base (111/102): total (122/111) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.20e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.49e-01 |
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
CGCGGATCTGCGCCGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCG > NC_014034/678671‑678871
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gcgGATCTGCGCCGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGa > 1:67518/1‑101 (MQ=255)
ggATCTGCGCCGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATc < 1:4266390/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGCCGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCt > 2:535449/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGCCGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCt > 1:1515712/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGCCGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCt < 1:3207642/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGCCGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCt > 1:1879346/1‑101 (MQ=255)
tCTGCGCCGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTgc < 2:2359722/101‑1 (MQ=255)
tCTGCGCCGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTgc < 2:480570/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTgcgc > 2:1187694/1‑101 (MQ=255)
tGCGCCGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTgcgc > 1:2198117/1‑101 (MQ=255)
tGCGCCGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTgcgc > 1:1700419/1‑101 (MQ=255)
cgcCGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCg > 2:519064/1‑101 (MQ=255)
cgcCGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCg < 2:135624/101‑1 (MQ=255)
gcCGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGt > 1:1370575/1‑101 (MQ=255)
ccGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCAGCGATCTGCGCCGTg < 1:3635520/101‑1 (MQ=255)
gCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCa < 2:2406785/101‑1 (MQ=255)
gCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCa < 2:1771301/101‑1 (MQ=255)
gCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCa < 1:4539934/101‑1 (MQ=255)
cTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGGCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAg < 1:3510550/101‑1 (MQ=255)
tCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAgc < 1:3102086/101‑1 (MQ=255)
aGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAgcgc > 1:2683086/1‑101 (MQ=255)
ggCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGcgcc < 1:1759855/101‑1 (MQ=255)
gCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGcgccg > 2:1097078/1‑101 (MQ=255)
cTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGcgccgc < 2:3337095/101‑1 (MQ=255)
cTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGcgccgc > 2:2140305/1‑101 (MQ=255)
ggCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGAt > 1:879537/1‑101 (MQ=255)
ggCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGAt < 2:869383/101‑1 (MQ=255)
aTCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTg < 1:899555/101‑1 (MQ=255)
aTCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTg < 1:1147247/101‑1 (MQ=255)
tCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGc > 2:458744/1‑101 (MQ=255)
gcgcCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTc < 1:235137/101‑1 (MQ=255)
gcCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTcgc > 1:1067975/1‑101 (MQ=255)
cccGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCa < 1:3466893/101‑1 (MQ=255)
cccGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCa > 1:933827/1‑101 (MQ=255)
cccGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCa > 2:3742495/1‑101 (MQ=255)
cccGACCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCa < 1:519112/101‑1 (MQ=255)
ccGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAg < 2:2197967/101‑1 (MQ=255)
ccGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAg > 2:3829685/1‑101 (MQ=255)
gATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGcc > 1:355940/1‑101 (MQ=255)
gtCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCg < 1:2388166/100‑1 (MQ=255)
tCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGt > 2:2821398/1‑101 (MQ=255)
tCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGt > 2:3252072/1‑101 (MQ=255)
tCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGt < 1:1568126/101‑1 (MQ=255)
ccGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTgcc > 1:3997205/1‑101 (MQ=255)
cGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTgccg < 2:1879220/101‑1 (MQ=255)
cGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTgccg > 2:3988100/1‑101 (MQ=255)
cGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTgccg < 2:158425/101‑1 (MQ=255)
cGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTgccg < 1:2892154/101‑1 (MQ=255)
gCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTgccgc > 2:3674400/1‑101 (MQ=255)
ccATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTgccgcc > 2:1954315/1‑101 (MQ=255)
tGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTgc < 2:2075514/101‑1 (MQ=255)
tGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTgc < 1:292847/101‑1 (MQ=255)
tGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTgc > 2:3041345/1‑101 (MQ=255)
tGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTgc < 2:3010976/101‑1 (MQ=255)
tGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTAGCGCTCAGCCGTGCCGCCTgc > 2:229863/1‑101 (MQ=255)
ggCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTgcg > 2:4064849/1‑101 (MQ=255)
ccGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGcc < 2:3633053/101‑1 (MQ=255)
cGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCg > 1:1976969/1‑101 (MQ=255)
gagaCCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGt < 1:2768329/101‑1 (MQ=255)
agaCCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTg < 1:3233292/101‑1 (MQ=255)
aCCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGt < 1:1201677/101‑1 (MQ=255)
cGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCa > 1:2428800/1‑101 (MQ=255)
cGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCa < 1:4650698/101‑1 (MQ=255)
cGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCa < 1:3857900/101‑1 (MQ=255)
aGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGACAgcgc > 2:618886/1‑101 (MQ=255)
gCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGcc > 1:2081092/1‑101 (MQ=255)
cTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCa > 2:2710580/1‑101 (MQ=255)
cTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCACCa > 1:333341/1‑101 (MQ=255)
gCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGAt < 1:458781/101‑1 (MQ=255)
cGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATg > 2:678698/1‑101 (MQ=255)
gATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGAGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGt > 1:4152820/1‑101 (MQ=255)
gATATCCGCGGTGTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTTCGTCGCGCGCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGt < 2:795478/101‑1 (MQ=255)
cagatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGt > 1:329604/4‑101 (MQ=2)
cagatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGt > 2:3509874/4‑101 (MQ=2)
tatCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCa < 1:2005976/101‑1 (MQ=255)
gatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa < 1:171829/100‑1 (MQ=2)
atCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCAt > 1:848824/1‑101 (MQ=2)
atCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCAt < 1:3501679/101‑1 (MQ=2)
tcggcgGTTTCCAGCGCCGCACCCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCAtc < 1:380566/98‑2 (MQ=2)
tcggcgGTTTCCAGCGCCCCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCTTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCAtc < 1:3312926/98‑2 (MQ=2)
tCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCAtt < 1:2805828/101‑1 (MQ=255)
gcgGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGt > 2:2878734/1‑101 (MQ=255)
ggTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGc > 1:3843862/1‑101 (MQ=255)
gTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGcc < 1:229887/101‑1 (MQ=255)
gTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGcc > 2:2637587/1‑101 (MQ=255)
gTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGGCAGCGCCACGATGTCATTCGTGcc > 1:3027675/1‑101 (MQ=255)
tttCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGccc < 1:4509094/101‑1 (MQ=255)
tttCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGccc > 2:342602/1‑101 (MQ=255)
tttCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGccc > 1:2586946/1‑101 (MQ=255)
ttCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCa > 1:2339620/1‑101 (MQ=255)
ttCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCa > 2:319666/1‑101 (MQ=255)
ccAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGc < 1:42634/101‑1 (MQ=255)
ccAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGc < 1:625575/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGcc < 2:1700308/101‑1 (MQ=255)
aGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGccc > 2:3137656/1‑101 (MQ=255)
gcgcCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGcccc > 2:634970/1‑101 (MQ=255)
cgcgATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCa > 2:3900663/1‑101 (MQ=255)
cgATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAgc > 2:200611/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAgcg > 2:2581959/1‑101 (MQ=255)
|
CGCGGATCTGCGCCGTGCTCAGGCTTGGCATCAGCGCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCG > NC_014034/678671‑678871
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|