| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 678,831 | G→C | 8.2% | T1592T (ACC→ACG) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 678,831 | 0 | G→C | 8.2% | 36.7 0.0 ‑0.4 | 218 | T1592T (ACC→ACG) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (10/8): ref base (110/90): total (120/98) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.19e-01 | ||||||||||
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
AGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTGCCGCGTCGACA > NC_014034/678731‑678931
|
agaCCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTg < 1:3233292/101‑1 (MQ=255)
gaCCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGAGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGGGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGGCGAGCCGCCTGCGCCGTgg > 1:422044/1‑101 (MQ=38)
aCCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGt < 1:1201677/101‑1 (MQ=255)
cGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCa < 1:3829970/101‑1 (MQ=255)
cGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCa < 1:3857900/101‑1 (MQ=255)
gAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAg > 1:4600027/1‑101 (MQ=255)
aaaGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAgc > 2:3229676/1‑101 (MQ=255)
aGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGACAgcgc > 2:618886/1‑101 (MQ=255)
cTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCa < 2:1581899/101‑1 (MQ=255)
cTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCa > 2:2710580/1‑101 (MQ=255)
cTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCACCa > 1:333341/1‑101 (MQ=255)
tGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCAc < 2:3711649/101‑1 (MQ=255)
gggCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACg > 1:1811023/1‑101 (MQ=255)
gCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGAt > 2:3365931/1‑101 (MQ=255)
gCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGAt > 2:1919795/1‑101 (MQ=255)
cGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATg > 1:3271240/1‑101 (MQ=255)
gATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGAGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGt > 1:4152820/1‑101 (MQ=255)
cagatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGt > 2:3509874/4‑101 (MQ=2)
atatCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTc > 1:1932589/1‑101 (MQ=255)
agatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTc < 2:3016308/99‑1 (MQ=2)
tatCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCa < 1:1731361/101‑1 (MQ=255)
atCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCAt > 1:359249/1‑101 (MQ=255)
atCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCAt < 1:1542886/101‑1 (MQ=255)
atCCGCGGTTTCCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGGCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCAt < 1:2797362/101‑1 (MQ=25)
tcggcgGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCAtc < 1:742343/98‑2 (MQ=2)
tCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCAtt < 1:2805828/101‑1 (MQ=255)
cgcgGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCg > 1:240099/1‑101 (MQ=255)
gcgGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGt < 1:3778355/101‑1 (MQ=255)
ccgGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGt < 2:4598606/100‑1 (MQ=255)
cgGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTg < 1:861133/101‑1 (MQ=255)
ggTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGc > 1:3843862/1‑101 (MQ=255)
ggTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGc > 2:3809353/1‑101 (MQ=255)
ggTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGc < 1:4534707/101‑1 (MQ=255)
gTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGcc > 2:2637587/1‑101 (MQ=255)
gTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGcc < 1:229887/101‑1 (MQ=255)
tttCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGccc > 1:2586946/1‑101 (MQ=255)
ttCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCa > 2:234082/1‑101 (MQ=255)
ttCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCa > 2:319666/1‑101 (MQ=255)
tCCAGCTCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGAGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGGGCCCAg > 2:878795/1‑101 (MQ=255)
tCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAg > 1:3486816/1‑101 (MQ=255)
cAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGcc < 2:1700308/101‑1 (MQ=255)
agcgaggcgATCTGCGCCGTGCGCAGCGGCGAGATCTGCGTCGCGCTCCGCCGCGGCGCCGGCGCCGTGGTCACGGACACGATGTCCCTCGCGACCAGtcc > 2:1855314/7‑101 (MQ=16)
aGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGccc < 2:2843889/101‑1 (MQ=255)
cgccgcGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCt < 1:2311629/101‑1 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCtt > 1:1156926/1‑101 (MQ=255)
cgcgATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCa < 1:3301625/101‑1 (MQ=255)
cgATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAgc > 2:200611/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAgcg < 1:2163121/101‑1 (MQ=255)
aTCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAgcgc < 2:1810897/101‑1 (MQ=255)
tCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGcgcc < 1:935035/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGcgccg < 1:1988874/101‑1 (MQ=255)
cgcCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCgg < 1:1723663/101‑1 (MQ=255)
gcCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGt > 1:533439/1‑101 (MQ=255)
gcCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGt < 2:348398/101‑1 (MQ=255)
gTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCt < 1:480/101‑1 (MQ=255)
tGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTc > 1:3812955/1‑101 (MQ=255)
tGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTc < 2:1001427/101‑1 (MQ=255)
cggcgACCTCCGTCCCGTTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGACCAGCCCCTTTAGCGCCGCGGTGCTTAGCGCGCCg < 2:438971/99‑1 (MQ=37)
ccgcGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCg < 1:635031/101‑1 (MQ=255)
gcgATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGAt < 1:3674087/101‑1 (MQ=255)
gcgATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGAt < 1:2628924/101‑1 (MQ=255)
gcgATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGAt < 1:200635/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATcc > 1:3110010/1‑100 (MQ=255)
tcggCGTGGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGcc < 2:892483/98‑1 (MQ=255)
tCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGcc > 1:3445054/1‑101 (MQ=255)
cTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGccc > 1:4382384/1‑101 (MQ=255)
tGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGcccc > 2:3831729/1‑101 (MQ=255)
tGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGcccc > 1:3154908/1‑101 (MQ=255)
cGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCgg > 2:3606416/1‑101 (MQ=255)
cgcgCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCg < 2:4035769/101‑1 (MQ=255)
cgcgCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCg < 1:2740120/101‑1 (MQ=255)
gcTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACa < 2:2376867/101‑1 (MQ=255)
gcTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACa < 1:4268577/101‑1 (MQ=255)
gtCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAg < 1:1097167/100‑1 (MQ=255)
cTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAg > 1:2095085/1‑101 (MQ=255)
tCAGCTGTGCCGCCTGCGCCGTGCTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGAGCTCAGCGCGCCGAGCGCCCCGGTCGACAgc > 2:755809/1‑101 (MQ=25)
tCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAgc > 1:3536738/1‑101 (MQ=255)
aGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAgcgc > 1:2233394/1‑101 (MQ=255)
aGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAgcgc > 2:1451716/1‑101 (MQ=255)
gCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGcgcc > 1:1666059/1‑101 (MQ=255)
cGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGcgccgc > 1:1607992/1‑101 (MQ=255)
ggccgccTGGGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCa < 1:618947/100‑1 (MQ=255)
gccgccTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCAc > 2:1778964/1‑101 (MQ=255)
gccTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTg > 2:2509563/1‑101 (MQ=255)
gccTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTg > 2:3909475/1‑101 (MQ=255)
cTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCCGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGCCGACAGCGCCGCCACCTGcc > 2:66134/1‑101 (MQ=255)
cTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTGcc > 2:4651493/1‑101 (MQ=255)
cTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTGcc > 1:4478972/1‑101 (MQ=255)
tGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTGCcg < 2:1077481/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTGCcg < 2:2586772/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTGCcgc > 2:1188453/1‑101 (MQ=255)
gcgcCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTGCcgc < 2:2080952/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTGCcgc < 1:30586/101‑1 (MQ=255)
cGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTGCCGCGTCg < 2:4523608/101‑1 (MQ=255)
gTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTGCCGCGTCGa > 1:2921842/1‑101 (MQ=255)
tGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTGCCGCGTCGAc < 2:3109766/101‑1 (MQ=255)
tGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTGCCGCGTCGAc > 2:2835439/1‑101 (MQ=255)
gggTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTGCCGCGTCGAc < 2:309484/100‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTGCCGCGTCGACa < 2:1515603/101‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTGCCGCGTCGACa < 1:392335/101‑1 (MQ=255)
|
AGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCACCTGCCGCGTCGACA > NC_014034/678731‑678931
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|