| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 682,549 | C→G | 10.3% | G353A (GGG→CGG) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 682,549 | 0 | C→G | 10.3% | 54.6 ‑4.0 ‑0.1 | 233 | G353A (GGG→GCG) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (5/19): ref base (97/112): total (102/131) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.75e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.84e-01 | ||||||||||
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
CGCCGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGA > NC_014034/682449‑682649
|
cgcCGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGccc < 2:1457055/101‑1 (MQ=255)
gcCGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGcccc < 2:648103/101‑1 (MQ=255)
gcCGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGcccc > 1:306507/1‑101 (MQ=255)
ccGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCg < 2:3001622/101‑1 (MQ=255)
gAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGt > 2:2917849/1‑101 (MQ=255)
gAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGt > 1:985015/1‑101 (MQ=255)
aaCTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTc < 1:2273316/101‑1 (MQ=255)
aaCTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTc < 2:2079484/101‑1 (MQ=255)
nncNNNGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATGTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAg < 1:1286803/99‑1 (MQ=255)
tCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAgc > 1:394141/1‑101 (MQ=255)
tCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAgc > 2:234512/1‑101 (MQ=255)
cAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAgcg > 2:2941054/1‑101 (MQ=255)
cAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAgcg < 2:4324085/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAgcg > 2:172398/1‑101 (MQ=255)
cgcCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGcgccg > 1:594255/1‑101 (MQ=255)
ccTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCgccgcc > 2:2794850/1‑101 (MQ=255)
cTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCa < 2:1292608/101‑1 (MQ=255)
ggcggcCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGtt < 1:869161/101‑1 (MQ=255)
ggcggcCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGtt < 2:4331708/101‑1 (MQ=255)
gcggcCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTc > 1:1407869/1‑101 (MQ=255)
gcCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGAt < 1:2956879/101‑1 (MQ=255)
ctcctcGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCg < 1:2300877/101‑1 (MQ=255)
cctcGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.Tg < 2:4322675/101‑1 (MQ=255)
ctcGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGc < 2:1156343/101‑1 (MQ=255)
cGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCTGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTc < 2:4035302/101‑1 (MQ=255)
cGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTc > 1:2886689/1‑101 (MQ=255)
cGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTc < 1:3402281/101‑1 (MQ=255)
cGGACAGCG.CGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCCCa > 1:1458332/1‑101 (MQ=255)
ggACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCa > 1:3720385/1‑101 (MQ=255)
aCAGCGCCGCGATCTCCCGCGTGCCCAGACCCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGc < 1:4563548/101‑1 (MQ=255)
cggcgcCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGcc < 1:1873691/99‑1 (MQ=255)
cAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGcc < 2:1112107/101‑1 (MQ=255)
gccgcGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGc > 2:2431900/1‑101 (MQ=255)
cgcgATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCa < 2:696690/101‑1 (MQ=255)
cgATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATg < 2:4447415/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGt > 2:68682/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGt > 1:2032479/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGt > 2:3214659/1‑101 (MQ=255)
cTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCt < 2:1788047/101‑1 (MQ=255)
tGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTc > 2:2569240/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTc > 1:4225942/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTc < 2:3691065/101‑1 (MQ=255)
gCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCg < 2:2682811/101‑1 (MQ=255)
gCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCg > 1:1787036/1‑101 (MQ=255)
gCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCg < 1:88971/101‑1 (MQ=255)
ccGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCgg > 1:1222253/1‑101 (MQ=255)
cgcgTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGt < 1:1086165/101‑1 (MQ=255)
cgcgTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGt < 1:255225/101‑1 (MQ=255)
gcgTGCCCAGACCCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTc < 1:3217071/101‑1 (MQ=255)
cgTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCg < 1:748541/101‑1 (MQ=255)
gTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGa > 1:2893787/1‑101 (MQ=255)
gCCCAGAACCCCCAGCAGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGaaa > 1:4073731/1‑101 (MQ=255)
ccAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGc < 1:493666/101‑1 (MQ=255)
aGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGccc > 2:2339384/1‑101 (MQ=255)
cgccgccAGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCt < 1:1003370/96‑1 (MQ=37)
gccgccAGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCtt < 2:3735809/97‑1 (MQ=37)
gccgccAGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCtt > 1:135916/5‑101 (MQ=37)
cccccAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTc < 2:219557/101‑1 (MQ=255)
cccccAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTc < 2:2050342/101‑1 (MQ=255)
ccccAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCa < 2:3855833/101‑1 (MQ=255)
ccccAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCa > 1:2760362/1‑101 (MQ=255)
gccAGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCTTGAg > 1:2592368/2‑101 (MQ=37)
cccAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAg < 1:2711059/101‑1 (MQ=255)
ccAGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCTTGAgc > 2:2518874/1‑101 (MQ=37)
aGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAgcgc < 2:85535/101‑1 (MQ=255)
aGCTGGGCCGGGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAgcgc < 2:2170620/101‑1 (MQ=255)
tGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCgcggc > 1:4177620/1‑101 (MQ=255)
tGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCgcggc > 1:1594481/1‑101 (MQ=255)
tGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCgcggc > 1:3531961/1‑101 (MQ=255)
tGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCgcggc < 1:266575/101‑1 (MQ=255)
gggCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCgcggcg < 1:4052861/101‑1 (MQ=255)
gggCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCgcggcg > 2:4202297/1‑101 (MQ=255)
gcgCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCTTGAGcgcgcca < 1:1664571/99‑4 (MQ=25)
gCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGcggcggg > 2:1369572/1‑100 (MQ=255)
gCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGt < 1:172422/101‑1 (MQ=255)
cGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGc < 2:775294/101‑1 (MQ=255)
cGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGc < 1:2859391/101‑1 (MQ=255)
cGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCTTGAGcgcgccactgg < 2:2311691/101‑8 (MQ=25)
gTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGcc > 2:1638040/1‑101 (MQ=255)
tGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCg > 1:2099462/1‑101 (MQ=255)
gCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGa < 1:665501/101‑1 (MQ=255)
cTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGAt < 2:2889449/101‑1 (MQ=255)
tCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATc > 2:1355291/1‑101 (MQ=255)
ccgatctccATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATcgc < 1:3954414/94‑1 (MQ=255)
cgccgcCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCCGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATcgccc > 2:611837/1‑100 (MQ=255)
gccgccATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATcgccgc < 2:306475/101‑1 (MQ=255)
gccgccATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATcgccgc < 2:4540735/101‑1 (MQ=255)
gccgccATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATcgccgc < 2:3795498/101‑1 (MQ=255)
gccgccATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATcgccgc > 2:4627122/1‑101 (MQ=255)
ccgccATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCa > 1:3869317/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGc < 2:943963/101‑1 (MQ=255)
aTCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGc > 2:2275400/1‑101 (MQ=255)
cTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCcg < 2:1817894/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCcg > 1:4425439/1‑101 (MQ=255)
cTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCcg < 1:2941283/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCcgc > 2:2648351/1‑101 (MQ=255)
ccccGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCg > 2:14101/1‑101 (MQ=255)
ccccGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCg < 2:1274005/101‑1 (MQ=255)
ccGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGa > 2:3464493/1‑101 (MQ=255)
ccGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGa > 1:3419202/1‑101 (MQ=255)
|
CGCCGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGA > NC_014034/682449‑682649
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 22 ≤
ATCG
< 30 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|