Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_014034 | 2,177,289 | 2 bp→AT | 100% | coding (87‑88/990 nt) | rbsB ← | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | NC_014034 | 2,177,289 | 0 | T→A | 100.0% | 674.8 | 175 | T30S (ACA→TCA) | rbsB | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (93/82): ref base (0/0): total (93/82) | ||||||||||
* | NC_014034 | 2,177,290 | 0 | A→T | 100.0% | 671.0 | 173 | C29* (TGT→TGA) | rbsB | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (91/82): ref base (0/0): total (91/82) |
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
CATAGGTCGAGGGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAA..GGGTTG..GT..CGGTCTT.GTGTACAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.AGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.GGCAGAGG.CCCCAACAGGGCCAG.TTGCGCATC > NC_014034/2177202‑2177374
||
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gTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTTGGTGT..CGGTCTTGGTGATCAGACAGGcccc < 2:3917758/101‑1 (MQ=255)
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gAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTTGGTGT..CGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGt > 2:1288617/1‑101 (MQ=255)
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ccATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTTGGTGT..CGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aagcc < 2:1182897/101‑5 (MQ=255)
cATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTTGGTGT..CGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aagccg < 1:1053381/101‑6 (MQ=255)
cATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTTGGTGT..CGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aagccg > 2:1441184/1‑96 (MQ=255)
ctcGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTTGGTGT..CGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGccc > 2:3317274/1‑101 (MQ=255)
tcGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTTGGTGT..CGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGcccc < 2:3498720/101‑1 (MQ=255)
tcGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTTGGTGT..CGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGcccc > 1:332814/1‑101 (MQ=255)
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gTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTTGGTGT..CGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGc > 1:4429419/1‑101 (MQ=255)
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ggCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTTGGTGT..CGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCa < 1:3120602/100‑1 (MQ=255)
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cGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTTGGTGT..CGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCa > 2:3549936/1‑101 (MQ=255)
gCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTTGGTGT..CGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAg < 1:3495234/101‑1 (MQ=255)
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tgt..cggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.tttgcgc > 2:667951/2‑96 (MQ=255)
t..cggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGcat < 1:1809581/101‑1 (MQ=255)
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||
CATAGGTCGAGGGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAA..GGGTTG..GT..CGGTCTT.GTGTACAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.AGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.GGCAGAGG.CCCCAACAGGGCCAG.TTGCGCATC > NC_014034/2177202‑2177374
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 24 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 35 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|