| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_014034 | 2,304,900 | 0 | A→C | 100.0% | 559.8 | 159 | V892G (GTA→GGA) | RCAP_rcc02139 | methyl‑accepting chemotaxis protein |
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| * | NC_014034 | 2,304,901 | 0 | C→A | 100.0% | 549.2 | 159 | V892L (GTA→TTA) | RCAP_rcc02139 | methyl‑accepting chemotaxis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (67/92): ref base (0/0): total (67/92) | ||||||||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
ATAATCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCGCCCTGCATGC.GAAGACCG.CGTAC.GCTCCCGCA.GGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTG > NC_014034/2304809‑2304988
||
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tAATCTTGCGCAAAACCCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGc < 1:1375771/101‑1 (MQ=255)
aaTCTTGCGCAAACCCCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCa < 1:1362138/101‑1 (MQ=255)
aaTCTTGCCAAAACCCCGGCCGGACCCGGCCGGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCa < 2:3354762/101‑1 (MQ=255)
aTCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCA.g > 1:2373229/1‑101 (MQ=255)
tCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGCGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCA.gg > 1:2495508/1‑101 (MQ=255)
ttGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCA.gggt > 1:3349105/1‑99 (MQ=255)
tGCGCAACTCTGGGCGGGACCGGGCCTGTCAGCCGCCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCA.gggtc < 2:1156362/101‑4 (MQ=255)
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tGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCCCCCGCA.gggtc > 1:3845079/1‑98 (MQ=255)
cgcAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCA.gggtctg > 2:2222413/1‑96 (MQ=255)
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gcAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTgc > 2:300292/1‑101 (MQ=255)
caaaacCTCGGCCGGACCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTgc < 2:3965909/99‑1 (MQ=255)
cAAACCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTgcg < 2:3693257/101‑1 (MQ=255)
cAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTTCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTTCCGCAGGGTCTgcg > 2:3090304/1‑101 (MQ=255)
aaaccccGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTgcgc < 1:123745/95‑1 (MQ=255)
aaaaCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGGAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTgcgc > 2:3208965/1‑101 (MQ=255)
aaaaCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCA.ggggctgcgc > 2:3625750/1‑93 (MQ=255)
aaccTCGGCCGGATCCGGCCTGTTAGACGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGcc < 2:3844794/98‑1 (MQ=255)
aaCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCt > 1:702146/1‑101 (MQ=255)
aaCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCt > 2:4607209/1‑101 (MQ=255)
aCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGC.CCCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTc > 2:3879641/1‑101 (MQ=255)
cGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGcc > 1:1032287/1‑101 (MQ=255)
cGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGcc > 2:1091928/1‑101 (MQ=255)
cGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGGGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGGCTGCGCCTCGcc > 1:879308/1‑101 (MQ=255)
ggCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGccc > 2:1734153/1‑101 (MQ=255)
ggCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGccc > 1:3000419/1‑101 (MQ=255)
gCCGGATCCGGCGTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCca < 1:2191981/101‑1 (MQ=255)
cGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagc > 2:2405485/1‑101 (MQ=255)
cGGATCCGGCCTGTCACCCGGCCTGCCGCAACGGCCGCGCCCGGGGCG.CCTGCATGCGGGAGACCGCCGTCA.GCGCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcaga > 2:150026/1‑100 (MQ=255)
aTCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCagcagc > 2:2741159/1‑101 (MQ=255)
tCCGGCCTGTCAGCCGGCGTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAgcg > 2:1273764/1‑101 (MQ=255)
cgcccTGTCACCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGcc < 1:1911371/98‑1 (MQ=255)
ggCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCt > 2:887172/1‑101 (MQ=255)
ggCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCt > 1:1004543/1‑101 (MQ=255)
ggCCTGTAAGCCGCCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCt < 1:2951981/101‑1 (MQ=255)
gCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTg > 2:3068248/1‑101 (MQ=255)
cTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCg < 2:1118771/101‑1 (MQ=255)
cTGTCAGCCGCCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCg < 1:1969233/101‑1 (MQ=255)
tgccAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGt < 2:1032204/98‑1 (MQ=255)
gTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTc < 2:4520872/101‑1 (MQ=255)
gTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTc < 2:1688261/101‑1 (MQ=255)
tCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcg < 1:2124434/101‑1 (MQ=255)
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cAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcgc > 1:4127661/1‑101 (MQ=255)
cAGCCGCCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcgc < 1:4635632/101‑1 (MQ=255)
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cTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGt > 2:3483902/1‑101 (MQ=255)
gCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGttt < 1:3209208/101‑1 (MQ=255)
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ggcgCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACAt < 2:4654727/101‑1 (MQ=255)
ggcgCCGGTGGCG.CCAGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACAt > 1:3934834/1‑101 (MQ=255)
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gTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCa > 1:4567167/1‑101 (MQ=25)
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gggcgccTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCAt < 2:1446126/96‑1 (MQ=25)
ggcgccTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCAtt < 1:1419742/97‑1 (MQ=25)
gcgccTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATtg < 1:1719603/98‑1 (MQ=25)
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ccTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGc > 2:4094683/1‑101 (MQ=21)
cTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCt > 1:3219226/1‑101 (MQ=21)
cTGCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGCCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCt > 2:4332181/1‑101 (MQ=25)
gCATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTgg < 2:196101/101‑1 (MQ=25)
cATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTggg < 1:2122383/101‑1 (MQ=25)
cATGCGGAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTggg < 1:71272/101‑1 (MQ=25)
atgcggAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGt < 2:3745418/96‑1 (MQ=21)
tgcggAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTg < 2:4069613/97‑1 (MQ=25)
tgcggAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTg < 1:989672/97‑1 (MQ=25)
cggAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGAc < 1:3470920/99‑1 (MQ=25)
cggAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGAc < 1:595327/99‑1 (MQ=21)
cggAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGAc < 2:2756275/99‑1 (MQ=21)
gAAGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCt > 1:4302294/1‑101 (MQ=21)
aaGACCGCCGTCA.GCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTg < 1:2556249/101‑1 (MQ=21)
||
ATAATCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCGCCCTGCATGC.GAAGACCG.CGTAC.GCTCCCGCA.GGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTG > NC_014034/2304809‑2304988
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|