Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,823,740 | +C | 100% | intergenic (+25/‑148) | RCAP_rcc01687 → / → RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,823,740 | 1 | .→C | 100.0% | 39.1 | 139 | intergenic (+25/‑148) | RCAP_rcc01687/RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (84/41): ref base (0/14): total (84/55) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.43e-07 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.91e-01 |
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
CTATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.CCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCG > NC_014034/1823640‑1823833
|
aTGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.cc < 2:3288244/101‑1 (MQ=255)
aTGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGGGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.cc > 1:1810136/1‑101 (MQ=255)
cGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.ccccg < 2:1205023/101‑3 (MQ=255)
gAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.ccccgg > 1:4379079/1‑98 (MQ=255)
gAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.ccccgg > 1:315466/1‑98 (MQ=255)
aaGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgc > 2:47789/1‑101 (MQ=255)
aaGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgc > 1:349305/1‑101 (MQ=255)
aaGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgc > 1:89620/1‑101 (MQ=255)
gCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCTGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgccg < 1:3985606/101‑1 (MQ=255)
gCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgccg > 2:3460178/1‑101 (MQ=255)
gCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgccg < 1:3202093/101‑1 (MQ=255)
gCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgccg < 2:1677822/101‑1 (MQ=255)
cGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgccgc > 2:1597228/1‑101 (MQ=255)
gggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgccgcc > 2:534594/1‑101 (MQ=255)
gggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgccgcc < 2:309865/101‑1 (MQ=255)
gggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgccgcc < 2:621453/101‑1 (MQ=255)
ggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGG.A.ACCCC.GGCTGccgccg > 1:4287465/1‑101 (MQ=255)
ggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGccgccg > 2:1457046/1‑101 (MQ=255)
ggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGccgccg > 2:1572391/1‑101 (MQ=255)
ggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGccgccg > 2:2811267/1‑101 (MQ=255)
gTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCgg > 1:996157/1‑101 (MQ=255)
tGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGt > 1:3096104/1‑101 (MQ=255)
gggCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGtt < 1:4195159/101‑1 (MQ=255)
gggCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGtt > 2:3637191/1‑101 (MQ=255)
ggcggcGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTc < 2:3845545/101‑1 (MQ=255)
ggcggcGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTc < 1:1978969/101‑1 (MQ=255)
ggcggcGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTc > 2:1787853/1‑101 (MQ=255)
ggcggcGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTc < 1:534646/101‑1 (MQ=255)
cggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCAGTTCGc > 1:759003/1‑101 (MQ=255)
ggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGcc > 1:4353516/1‑101 (MQ=255)
ggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGcc > 1:4144051/1‑101 (MQ=255)
cgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCgg > 2:1249405/1‑101 (MQ=255)
cgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCgg > 1:1008613/1‑101 (MQ=255)
aTGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTc < 2:2108850/101‑1 (MQ=255)
aTGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTc < 2:2637382/101‑1 (MQ=255)
gTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgg < 1:3744189/101‑1 (MQ=255)
gtggCGATTCCGCGGCGAGCAGGCTCTTAAATTTTCCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGGGGGGGGC.C.C.CCCGGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcggg < 2:3047177/98‑1 (MQ=255)
cAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggc > 2:4351322/1‑101 (MQ=255)
cAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggc > 2:644364/1‑101 (MQ=255)
cgCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggcg < 2:2049637/100‑1 (MQ=255)
aGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggcg < 1:1727310/101‑1 (MQ=255)
gCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggcgg > 1:1512063/1‑101 (MQ=255)
ggATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggcggg < 2:597332/100‑1 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCgggcgggc > 1:567715/1‑101 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGA.A.ACCCC.GGGTGCCGCCGGTTCGCCGGTCgggcgggc > 1:4172525/1‑101 (MQ=255)
tttCGCGGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgc < 1:1056282/101‑1 (MQ=255)
tCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcgg < 2:2806066/101‑1 (MQ=255)
cgccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcggg > 1:605003/1‑101 (MQ=255)
cgccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcggg > 1:2469549/1‑101 (MQ=255)
gccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcgggc > 2:1940735/1‑101 (MQ=255)
ccgcGATCAAGCTTTTGAAGTTTTCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCt < 1:2733944/101‑1 (MQ=255)
cgcgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGCC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCtt < 2:1837185/101‑1 (MQ=255)
cgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCAGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTcc < 2:3303315/101‑1 (MQ=255)
gATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCg > 1:3506551/1‑101 (MQ=255)
gATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCg > 1:2892109/1‑101 (MQ=255)
aTCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCGGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCgg < 2:875319/101‑1 (MQ=255)
aTCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCgg > 1:2681650/1‑101 (MQ=255)
aTCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCgg > 1:2832414/1‑101 (MQ=255)
cAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGcc > 1:1901126/1‑101 (MQ=255)
gCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAGCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCt < 2:3938688/101‑1 (MQ=255)
tGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GCCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGc > 2:2520035/1‑101 (MQ=255)
gTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAGGGGGCGGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGcc < 2:1511958/101‑1 (MQ=255)
gTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGcc > 1:3677878/1‑101 (MQ=255)
ttGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCt < 2:554376/101‑1 (MQ=255)
tGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTa < 1:1621181/101‑1 (MQ=255)
tGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTa > 2:686154/1‑101 (MQ=255)
tGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGGGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGACGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCGGcccg > 2:1369970/1‑99 (MQ=255)
gAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAg > 1:2063234/1‑101 (MQ=255)
gAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAg < 2:2849746/101‑1 (MQ=255)
aGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGGCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgct > 2:3458641/1‑101 (MQ=255)
aGTTTCCCGCCGCGGAGGGGGGGGGGAAGGGGCGGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgct < 1:870425/101‑1 (MQ=255)
gTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctg > 1:87111/1‑101 (MQ=255)
ttGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgcc > 2:4036143/1‑100 (MQ=255)
gccgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctcc < 1:1168944/101‑1 (MQ=255)
gccgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctcc < 2:2929385/101‑1 (MQ=255)
gccgccTCGTAACGGGCAGTGAAGGGTCCGGGGGC.A.A.CCCGGGATGCCCCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCACGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctcc < 2:3680403/101‑1 (MQ=255)
cgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccct < 2:4353245/101‑1 (MQ=255)
cccgcttagcGGGGGGTGAAGGGGCCGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGGGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctc < 1:4349546/92‑1 (MQ=255)
ccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctcc < 2:3813558/101‑1 (MQ=255)
ccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctcc > 1:2249219/1‑101 (MQ=255)
cTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccg > 2:2104060/1‑101 (MQ=255)
cTCGTAACGGGCAGTGAGGGGGTCGGGGGT.ACC.CCC.GGTTGCCTCCGGTTCGCTGGTCGGGTGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTTCCTAGCTGCTCCCtccg < 2:758605/101‑1 (MQ=255)
cGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtc < 1:2787858/101‑1 (MQ=255)
tAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtccg > 1:1283307/1‑101 (MQ=255)
tAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtccg > 1:392031/1‑101 (MQ=255)
aaCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGa > 2:1420952/1‑101 (MQ=255)
gggGGGTGAAGGGGCCGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTg < 2:2652637/101‑1 (MQ=255)
gggCGGTGAGGGGGCCGAGGCCTA.C.CCC.GCCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTg < 2:758923/101‑1 (MQ=255)
ggCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.CCCGGGGTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTgg < 2:4237243/101‑1 (MQ=255)
ggCGGTAAAGGGGCCGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTgg < 1:644432/101‑1 (MQ=255)
tGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTg > 2:1193999/1‑101 (MQ=255)
ggAAGGGGCGGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGTTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTg < 1:81476/100‑1 (MQ=255)
gAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGc > 1:4294498/1‑101 (MQ=255)
aaGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGGGCg > 2:936830/1‑101 (MQ=255)
aGGGGCCGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCgg < 2:2744602/101‑1 (MQ=255)
ggggCGGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCggg < 1:4307442/101‑1 (MQ=255)
gggCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCgggg > 2:2213548/1‑101 (MQ=255)
ccGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCt < 2:1008528/101‑1 (MQ=255)
cGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGGCTg > 2:3386968/1‑101 (MQ=255)
ggggC.A.ACCCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTgcg > 2:2591049/1‑101 (MQ=255)
|
CTATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.CCC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCG > NC_014034/1823640‑1823833
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 16 ≤
ATCG
< 24 ≤
ATCG
< 32 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|