Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 3,173,565 | +C | 95.9% | intergenic (+600/‑82) | tyrA → / → RCAP_rcc02983 | prephenate dehydrogenase/extensin family protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 3,173,565 | 1 | .→C | 95.9% | 2.2 ‑1.7 ‑1.1 | 73 | intergenic (+600/‑82) | tyrA/RCAP_rcc02983 | prephenate dehydrogenase/extensin family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (52/18): ref base (1/2): total (53/20) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.80e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.64e-02 |
CGCCGGTCACGCCCGCCCCCGCCCCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.G.CCGCCGCGCAAGCGCA.A.GCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGCCTGA > NC_014034/3173467‑3173659
|
cgcCGGTCACGCCCGCCCCCGCCCCCACCGCTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCgcgcaagcgca.ac < 1:4198847/101‑2 (MQ=255)
gTCCCGCCCGCCCCCGCCCCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.A.Cgcccc < 2:3302900/101‑1 (MQ=255)
tcccccccgcccccgccCCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGccccc < 2:3233413/96‑1 (MQ=255)
tCACGCCCGCCCCCGCCCCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGccccc < 2:4447773/101‑1 (MQ=255)
tCACGCCCGCCCCCGCCCCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGccccc < 1:1998913/101‑1 (MQ=255)
cgcccgccCCCGCCCCCACCCCTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCccccgcc < 2:3897393/101‑1 (MQ=255)
cgcccgccCCCGCCCCCACCCCTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCccccgcc < 2:4091146/101‑1 (MQ=255)
ccgcccccgcccCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCccccgccccg > 1:2466598/1‑101 (MQ=255)
cgcccccgccccCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCgg > 1:3148041/1‑101 (MQ=255)
cccgcccccACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAgc > 1:3702609/1‑101 (MQ=255)
ccgcccccACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAgcg > 2:170697/1‑101 (MQ=255)
ccgcccccACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAgcg > 2:2861359/1‑101 (MQ=255)
cgcnccnCCCCCTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAgcgc < 1:693662/101‑1 (MQ=255)
cgcccccACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAgcgc > 2:1059951/1‑101 (MQ=255)
cccccCCCACCCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAgcgccc < 1:2861567/101‑1 (MQ=255)
cccACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAgcgcccgc > 2:3203897/1‑101 (MQ=255)
ccaccaCTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAgcgcccgcg < 2:3147817/101‑1 (MQ=255)
ccaccaCTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGCAAacgcccgcg > 2:370479/1‑101 (MQ=255)
ccccTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAgcgcccgcgccc < 2:2271227/98‑1 (MQ=255)
cacTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGcgcccgcgcccg > 1:722248/1‑101 (MQ=255)
acTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCCAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCCGCCGa > 2:81102/1‑101 (MQ=255)
acTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGa > 2:3519289/1‑101 (MQ=255)
cTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGaa > 1:3308529/1‑101 (MQ=255)
cTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGaa > 1:2777402/1‑101 (MQ=255)
tCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAg > 1:1788786/1‑101 (MQ=255)
tCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAg > 1:2250503/1‑101 (MQ=255)
ccccGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAg < 2:3647862/100‑1 (MQ=255)
cccGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAGGCGCCCGCGCCCGAAGc > 1:1472906/1‑101 (MQ=255)
cccGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGAGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCACC.GCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGCAGc > 1:325567/1‑101 (MQ=255)
ccGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGcc > 2:4091318/1‑101 (MQ=255)
cGCAGCCCGGACGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTCTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCCCAAGCGCA.ACCCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGccc < 1:4197055/101‑1 (MQ=255)
cGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGccc < 2:722168/101‑1 (MQ=255)
cGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGccc > 1:3639885/1‑101 (MQ=255)
cGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGccc > 1:782018/1‑101 (MQ=255)
gCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGcccc > 1:1940887/1‑101 (MQ=255)
cAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCt > 2:909754/1‑101 (MQ=255)
ccccGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTcc < 2:1175805/100‑1 (MQ=255)
ccGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCGGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCACC.GCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCgg < 2:1472801/101‑1 (MQ=255)
ggAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGcc > 1:702474/1‑101 (MQ=255)
ggAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGcc < 1:4088994/101‑1 (MQ=255)
gAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCCGccc > 2:2693792/1‑101 (MQ=255)
aaGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCg > 2:1379384/1‑101 (MQ=255)
aaGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCCGCCCg > 2:3189376/1‑101 (MQ=255)
cgccgccgGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAgg > 2:2167304/1‑101 (MQ=255)
tccgccgGGCGGCGTGCTTTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAggg < 2:1024848/100‑1 (MQ=255)
gccgGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCg < 2:1411550/101‑1 (MQ=255)
cgGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAg > 2:561971/1‑101 (MQ=255)
gggCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGc > 1:1670171/1‑101 (MQ=255)
gcgtctttcTGTCCCTCCTTTTCGCC.CCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGccc < 2:3651659/93‑1 (MQ=255)
gcggcgTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGccc < 2:4317926/101‑1 (MQ=255)
cgTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGcc > 1:1568678/1‑101 (MQ=255)
gTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCt > 2:172950/1‑101 (MQ=255)
gTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCt > 2:2144794/1‑101 (MQ=255)
gTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCt > 2:2626796/1‑101 (MQ=255)
gTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGCGCCGAGCCCGGCCt > 1:4407058/1‑101 (MQ=255)
tGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTg > 1:2203422/1‑101 (MQ=255)
gCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTgc > 2:344976/1‑101 (MQ=255)
cTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTgcg > 1:3404696/1‑101 (MQ=255)
tGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTgcgc > 1:1252541/1‑101 (MQ=255)
gTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGcgcg > 2:3997491/1‑101 (MQ=255)
tCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCgg > 2:1400277/1‑101 (MQ=255)
cgcgCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCggg > 2:4166906/1‑101 (MQ=255)
gcCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGggccg > 1:3071123/1‑101 (MQ=255)
ccTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGggtcgg > 1:692339/1‑101 (MQ=255)
cTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGggtcggt > 1:270049/1‑101 (MQ=255)
cTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGgggcggc > 2:2033347/1‑100 (MQ=255)
tttCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCACC.GCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCt < 2:2250358/101‑1 (MQ=255)
tttCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCt < 2:781938/101‑1 (MQ=255)
ttCG.GCCCGCCGCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGGCGGGCTg > 2:1706526/1‑101 (MQ=255)
cggcccgccgCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTgcg > 2:1375862/5‑101 (MQ=255)
cgcccggccgcGCAAGCGCA.ACGCCCACGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTgcg < 2:1963762/95‑1 (MQ=255)
ggcccgccgCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTgcgg > 2:3215247/4‑101 (MQ=255)
cccgccgCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTgcggcg > 1:3096547/2‑101 (MQ=255)
cccgccgCGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGGCGGCCTgcggcg > 2:2226607/2‑101 (MQ=255)
cgccgcGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTg > 2:906424/1‑101 (MQ=255)
cgccgcGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCCGCCTGCGCGGGGCGGGCTGCGGCGTg > 2:89913/1‑101 (MQ=255)
ccgcGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGcc > 1:1067871/1‑101 (MQ=255)
ccgcGCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGcc > 2:3321790/1‑101 (MQ=255)
cgcgCAAGCGCA.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGccc < 2:1788667/101‑1 (MQ=255)
gcgcaagcgca.acGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCg > 2:2689824/1‑101 (MQ=255)
gcaagcgca.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGc > 1:4389547/1‑101 (MQ=255)
gcaagcgca.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGc > 1:2445876/1‑101 (MQ=255)
gcaagcgca.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGc > 2:2457887/1‑101 (MQ=255)
caagcgca.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGGGTGCCCGGcc > 2:1750829/1‑101 (MQ=255)
caagcgca.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGcc > 1:3920809/1‑101 (MQ=255)
aagcgca.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGCCt > 1:3892166/1‑101 (MQ=255)
aagcgca.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGCCt > 2:2625211/1‑101 (MQ=255)
agcgca.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGCCTg > 1:2531872/1‑101 (MQ=255)
gcgca.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGCCTGa < 2:2777212/101‑1 (MQ=255)
|
CGCCGGTCACGCCCGCCCCCGCCCCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.G.CCGCCGCGCAAGCGCA.A.GCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGCCTGA > NC_014034/3173467‑3173659
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 32 ≤
ATCG
< 39 ≤
ATCG
|