| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 221,976 | 0 | A→G | 9.2% | 101.9 ‑0.8 ‑2.4 | 542 | D227D (GAT→GAC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (27/24): ref base (232/258): total (259/283) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.65e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.57e-03 | ||||||||||
Only 100 of 1484 total aligned reads displayed.
TCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGG > NC_014034/221876‑222084
|
ggtccgtgggaacggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggga > 2:4328084‑M1/81‑101 (MQ=255)
tccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc > 1:2879443‑M1/79‑101 (MQ=255)
tccgtgggagcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatc > 1:3158137‑M1/79‑101 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg < 1:1124720‑M1/24‑1 (MQ=255)
cGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcgg > 2:3874495/1‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc > 1:97649‑M1/75‑101 (MQ=255)
ggCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 2:2674969/101‑1 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg > 1:1219842‑M1/73‑101 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg < 2:3283479‑M1/29‑1 (MQ=255)
gggttgggtccgtggggtcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc > 1:3995505‑M1/69‑101 (MQ=255)
cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc < 2:2509445‑M1/33‑1 (MQ=255)
cgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggcatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccg < 1:1464940‑M1/34‑1 (MQ=255)
tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatgggtcgggtccgtg < 2:1627562‑M1/36‑1 (MQ=255)
gtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGgatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg > 1:2435846/1‑101 (MQ=255)
gtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGgatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg < 1:4236293/101‑1 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg < 2:735688‑M1/38‑1 (MQ=255)
gtcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt < 1:3523987‑M1/44‑1 (MQ=255)
gtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt < 2:3634545‑M1/44‑1 (MQ=255)
gggggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt > 1:3285926‑M1/58‑101 (MQ=255)
cttccgatctcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc > 2:291534‑M1/57‑101 (MQ=255)
ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 2:56062‑M1/52‑1 (MQ=255)
gtcggatccgtgggatcggtcgggtacgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 1:3218346‑M1/49‑101 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt < 2:48966‑M1/58‑1 (MQ=255)
tCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:1649484/101‑1 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:242841‑M1/63‑1 (MQ=255)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgg < 1:4328353‑M1/71‑2 (MQ=255)
gtcgcgtccttgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 2:3211683‑M1/31‑101 (MQ=255)
cgggtctgtgggatcggtcgggtccgggGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg > 1:3719446‑M1/29‑101 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 1:3445648‑M1/73‑1 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg < 1:3114076‑M1/74‑1 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 1:2705127‑M1/74‑1 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 2:3788645‑M1/28‑101 (MQ=255)
gTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 1:3352891/1‑101 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGTGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 1:1718180‑M1/25‑101 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 1:3950777‑M1/25‑101 (MQ=255)
ggCGCCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 2:1323347/101‑1 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg > 2:1263656‑M1/23‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:866624‑M1/81‑1 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 1:2525279‑M1/20‑101 (MQ=255)
gatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggtcggg < 1:1355440‑M1/84‑2 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATc > 2:1034967‑M1/16‑101 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg < 2:3349846‑M1/88‑1 (MQ=255)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 2:1387222/1‑101 (MQ=1)
tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg > 1:1807487/1‑101 (MQ=255)
gggCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg < 1:4380854/101‑1 (MQ=255)
tgatcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg > 2:4396108/4‑101 (MQ=1)
gggttcgtgggatgggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg < 2:818666/92‑1 (MQ=11)
gatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa > 1:1528030‑M1/9‑101 (MQ=255)
atccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt > 2:3703403‑M1/8‑101 (MQ=255)
tccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:3645207‑M1/95‑1 (MQ=255)
cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg > 2:3434638/1‑101 (MQ=255)
ccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGCGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtag > 2:2742604/3‑99 (MQ=11)
ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGCGGGTCGGCAGGGCTCGTGGGATCGGACGGGTCCGTCGGGtcgg > 1:2387418/1‑101 (MQ=2)
cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg > 1:131580‑M1/5‑101 (MQ=255)
gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt < 1:4123204‑M1/98‑1 (MQ=255)
tggggcccgtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:3949558/93‑1 (MQ=11)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:3147611/99‑1 (MQ=11)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:1928046/99‑1 (MQ=11)
tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 2:1189717‑M1/3‑101 (MQ=255)
gggggtccgtcgggtccgggggatcggtcggggccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 1:2970192/93‑1 (MQ=14)
gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:646291‑M1/2‑101 (MQ=255)
gggtgggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg < 2:4075095/96‑1 (MQ=14)
gggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtcgg < 1:917936/95‑1 (MQ=14)
ggcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtgggat < 1:2312046/99‑3 (MQ=11)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccggggggGCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTTGGGTGGGTGGGGTCCGCGTGGtcggaggcgga > 2:3050566/1‑94 (MQ=0)
ctcgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc < 2:1103847/98‑1 (MQ=14)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGACCGGTGGGATCCGTGGGGTCGGCCGCGTcc > 2:221921/1‑101 (MQ=11)
ggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCg > 1:2140132/1‑101 (MQ=11)
cgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGGTGCGTGGGATCGGGAGGGTCCg > 2:94349/2‑101 (MQ=11)
gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 2:1842659/1‑101 (MQ=11)
ggcggggcggtgggggcggtcgggtccggggggtccgtCGGACCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt < 2:2593126/99‑1 (MQ=14)
tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATGGGTCGGATCCGtg > 1:2772519/1‑100 (MQ=11)
tcggatccgtgggatcggtctgatccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg < 2:2823256/101‑2 (MQ=11)
tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg < 1:4077130‑M2/101‑2 (MQ=255)
gcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGCGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg > 2:3507119‑M2/2‑100 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg > 2:2105968‑M2/1‑99 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGATCGGTGGGATGGGTCGGATCCGtgg > 2:1461785/1‑99 (MQ=14)
cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 2:4012653‑M2/101‑3 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGGGGGATCCGtgg > 1:1004321/1‑99 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg > 1:2068576‑M2/1‑98 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg < 1:1907043/101‑1 (MQ=14)
tgtccgtgggacggttccggtcagcgggatccgtcggGTCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa < 2:4123505/100‑1 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga > 1:4439276‑M2/1‑97 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga < 1:3804665‑M2/101‑5 (MQ=255)
ggtccggggggtctgtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGggg < 1:846700/101‑2 (MQ=11)
gtccgtgggttcgggcgggtccgtggtttcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:2621985/101‑1 (MQ=14)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggat > 1:77440‑M2/1‑96 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat > 1:2249756‑M2/1‑96 (MQ=255)
gtccgggggaccggtcgggtccgggggatgcgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 2:2297335/101‑1 (MQ=11)
atccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt > 2:424834/2‑101 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCGCTGGGCTCGGCCGGGCCCggggggcc > 2:1744391/1‑94 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcggatccggaggatcggtgggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc < 1:3874748/101‑1 (MQ=11)
ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAGCGGTGGGATCCGTGGGAtcg > 2:2015548/1‑101 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGATCGGCCGGGTGCGTGGGAtcggtcg > 2:2356072/1‑101 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg < 1:583653‑M2/101‑12 (MQ=255)
gggagcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 1:50344/101‑1 (MQ=11)
ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGAtcggtcgg > 2:1527925/1‑101 (MQ=11)
ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg > 1:674494‑M2/1‑89 (MQ=255)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggg < 1:2007199‑M2/101‑14 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGgtcgggc > 1:1050274/1‑100 (MQ=11)
|
TCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGG > NC_014034/221876‑222084
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|