BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,967	G→A	20.0%	D230D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	221,967	0	G→A	20.0%	284.5 ‑0.4 ‑1.7	530	D230D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (52/54): ref base (197/226): total (250/280)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.65e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.17e-02

Only 100 of 1321 total aligned reads displayed.


CCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAT  >  NC_014034/221867‑222067


 gtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggt                                                                                                     <  1:2639566‑M1/13‑1 (MQ=255)


 atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                                                                                                     <  1:4075355‑M1/13‑1 (MQ=255)


    cacCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccg                                                                                                  <  2:3812482/101‑1 (MQ=255)


     acCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgg                                                                                                 >  1:3507360/1‑100 (MQ=255)


      tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccggg                                                                                                <  1:1750258‑M1/18‑3 (MQ=255)


      ccGTCTCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtg                                                                                                <  2:144848/101‑1 (MQ=255)


      ccGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtg                                                                                                <  2:2954613/101‑1 (MQ=255)


       cGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgg                                                                                               >  2:4114083/1‑101 (MQ=255)


           tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                                           >  2:877064‑M1/79‑101 (MQ=255)


            ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg                                                                                          <  1:1124720‑M1/24‑1 (MQ=255)


             cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                                         >  2:816626‑M1/77‑101 (MQ=255)


             cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgagggatcggtgcggtccgtgggatcgg                                                                                         <  2:2409864‑M1/25‑1 (MQ=255)


              gtgggcgcggtccggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                                        >  2:1601345‑M1/76‑101 (MQ=255)


              gAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                                        >  2:1160995/1‑101 (MQ=255)


               tgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcgggc                                                                                       <  1:960554‑M1/27‑3 (MQ=255)


                 ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                                     >  1:1219842‑M1/73‑101 (MQ=255)


                  cTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                                                                                    >  1:2794425/1‑101 (MQ=255)


                    tcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                                                  >  1:53492‑M1/70‑101 (MQ=255)


                    tccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatc                                                                                  >  1:289118‑M1/70‑98 (MQ=255)


                     cGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                                 <  2:1083251/101‑1 (MQ=255)


                      ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                                                <  2:1877148‑M1/34‑1 (MQ=255)


                      ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccg                                                                                <  2:1299155‑M1/34‑1 (MQ=255)


                      ggtcgggtccgtcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtggggtccg                                                                                <  2:4364531‑M1/34‑1 (MQ=255)


                         gtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGgatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                                                             <  1:4236293/101‑1 (MQ=255)


                         gggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                                                             <  1:1859068‑M1/37‑1 (MQ=255)


                         cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggagcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                                                             <  1:3860430‑M1/37‑1 (MQ=255)


                           ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                                                           <  1:2106105‑M1/39‑1 (MQ=255)


                                 tggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                     >  1:4385124‑M1/57‑101 (MQ=255)


                                 tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggtc                                                                     <  2:3940140‑M1/45‑1 (MQ=255)


                                 tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                     >  1:803581‑M1/57‑101 (MQ=255)


                                         gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgg                                                             <  2:3655935‑M1/53‑2 (MQ=255)


                                          ccGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                            >  2:3874188/1‑101 (MQ=255)


                                           cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTgg                                                           <  2:4047660‑M1/55‑1 (MQ=255)


                                             ggtCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                         <  1:1053284/99‑1 (MQ=255)


                                               tccgtgggatcggtttgttccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                       >  1:2337173‑M1/43‑101 (MQ=255)


                                                   tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                   <  2:3451843‑M1/63‑1 (MQ=255)


                                                    ggggtcggtcgggtgcgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                  >  1:3604276‑M1/38‑101 (MQ=255)


                                                    gggatgggtcggctccgttggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                  >  2:4438679‑M1/38‑101 (MQ=255)


                                                    gggatcggtcggatccgtgggagcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                  >  2:731549‑M1/38‑101 (MQ=255)


                                                    cTCATCGACGGGGGGCGGCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                  <  2:3528853/101‑1 (MQ=255)


                                                      gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGgtccgtcgga                                                >  2:2322589‑M1/36‑100 (MQ=255)


                                                          ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                            <  1:476525‑M1/70‑1 (MQ=255)


                                                          gACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                            >  2:3154343/1‑101 (MQ=255)


                                                           gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                           <  1:611727‑M1/71‑1 (MQ=255)


                                                           gtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                           >  1:3264479‑M1/31‑101 (MQ=255)


                                                                 tcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtc                                     <  1:2468774/98‑1 (MQ=1)


                                                                 tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                     >  2:2863924‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                                                 tccGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtc                                     <  1:2212989/99‑1 (MQ=11)


                                                                    gtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                  <  1:1593723‑M1/80‑1 (MQ=255)


                                                                      gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtgggtcg                                <  1:2297480‑M1/82‑1 (MQ=255)


                                                                           cggTGGGATCGGGGGGGTCCCTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                           <  2:3070771/99‑1 (MQ=11)


                                                                            ggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                          <  1:3211912‑M1/88‑1 (MQ=255)


                                                                             gttgggtccgtgGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                         >  2:2764060‑M1/13‑101 (MQ=255)


                                                                              tcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGATccgcg                        <  1:4326483‑M1/90‑3 (MQ=255)


                                                                              tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                        <  1:1397394/101‑1 (MQ=255)


                                                                              tGGGCTCGGTCGGATCGGACGGGCCCGTGGGATCGGACGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCggg                        >  2:246925/1‑99 (MQ=17)


                                                                              gcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                        >  1:2740731‑M1/12‑101 (MQ=255)


                                                                               tggatcggtcggGTCCGTTGGGTTCGTGGTGTCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                       <  1:1481633/97‑3 (MQ=11)


                                                                               gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                       <  2:1974226/101‑3 (MQ=11)


                                                                               cgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                       <  2:3245639‑M1/91‑1 (MQ=255)


                                                                                 gctccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                     >  2:1374699‑M1/9‑101 (MQ=255)


                                                                                 gatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCTGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                     >  2:2278853‑M1/9‑101 (MQ=255)


                                                                                  atccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCAGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGAt                    <  1:3682232/97‑1 (MQ=11)


                                                                                   gccgtcggATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                   <  1:3106684/98‑1 (MQ=11)


                                                                                    cggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg                  >  1:3949812/1‑101 (MQ=11)


                                                                                    cggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCCGGTCCGTCGGAtcg                  <  2:2703505/101‑1 (MQ=11)


                                                                                    cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                  <  2:1791235/101‑1 (MQ=255)


                                                                                    ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                  <  2:3285694‑M1/96‑1 (MQ=255)


                                                                                    ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                  <  2:2632212‑M1/96‑1 (MQ=255)


                                                                                     cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                 <  1:1319897‑M1/97‑1 (MQ=255)


                                                                                      gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt                <  1:4123204‑M1/98‑1 (MQ=255)


                                                                                      gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCgaccgatccca                <  2:4322508/101‑11 (MQ=255)


                                                                                      gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGGGGGCtcggc                >  2:2068439/1‑100 (MQ=11)


                                                                                        gggctcggtcgggtccgtggggtccgtcggggccgtgtgaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg              <  1:2993727/97‑1 (MQ=14)


                                                                                        gggatcgggcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg              <  1:3328817/100‑1 (MQ=11)


                                                                                          ggtcggccgggtccgttggagtggggggatccgtgggaTCGGTTGGGTCCGTAGTATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg            <  2:54551/99‑1 (MQ=2)


                                                                                          gatcggtcgggtccggtggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcgga            <  2:1516376/101‑2 (MQ=11)


                                                                                          gatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgga            <  1:902688/101‑2 (MQ=11)


                                                                                           gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtgggat           <  2:3988733/100‑3 (MQ=11)


                                                                                           gtcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcgcat           <  1:2555677/100‑4 (MQ=11)


                                                                                           atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGATCGGTGGGGgcgggcggcc           >  2:2199545/1‑99 (MQ=11)


                                                                                             cggtcgggtccgcgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc         >  1:2019675/1‑101 (MQ=11)


                                                                                             cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc         <  1:3397988/101‑1 (MQ=11)


                                                                                              cgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGGTGCGTGGGATCGGGAGGGTCCg        >  2:94349/2‑101 (MQ=11)


                                                                                                tcgggtgcgtgggatcggtcgggtccgtgcgatcgcCCGGGTCCGTGGTGTCCCTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg      <  2:3721083/101‑2 (MQ=11)


                                                                                                tcgggtctgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGTGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg      <  1:3994096/101‑2 (MQ=11)


                                                                                                tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg      >  2:423797‑M2/1‑100 (MQ=255)


                                                                                                tcgggcccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg      <  2:631529/101‑2 (MQ=11)


                                                                                                tcggatccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg      >  2:2544427‑M2/1‑100 (MQ=255)


                                                                                                 cgggtccgtgggatcggtggggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg     >  1:1679246‑M2/1‑99 (MQ=255)


                                                                                                 cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg     <  2:1244715‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                                                                                 cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg     >  2:1688612‑M2/1‑99 (MQ=255)


                                                                                                 cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTGGGGCGGGTTCGtgg     >  2:1016294/1‑99 (MQ=14)


                                                                                                 cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGGGGGATCCGtgg     >  1:1004321/1‑99 (MQ=11)


                                                                                                 cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGACCCGtgg     >  1:3771840/1‑99 (MQ=11)


                                                                                                  gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg    <  1:693453‑M2/101‑4 (MQ=255)


                                                                                                   ggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga   >  1:2408738‑M2/1‑97 (MQ=255)


                                                                                                   ggtccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa   <  1:3157222/101‑1 (MQ=14)


                                                                                                   ggtccgtcggttccgtcggatccgtctgttccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa   <  2:3386353/101‑1 (MQ=11)


                                                                                                    gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt  >  1:1941616/1‑101 (MQ=11)


CCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAT  >  NC_014034/221867‑222067

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG