BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,012	A→G	5.9%	D215D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,012	0	A→G	5.9%	155.2 ‑0.7 ‑0.1	1432	D215D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (40/48): ref base (660/679): total (704/728)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.10e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.26e-01

Only 100 of 1748 total aligned reads displayed.


ATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAT  >  NC_014034/221913‑222112


 tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                                    >  1:247345‑M1/43‑101 (MQ=255)


  ccgtgggctcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                   >  1:4236317‑M1/42‑101 (MQ=255)


    gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                                 >  1:231954‑M1/40‑101 (MQ=255)


      gggatgggtcggctccgttggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                               >  2:4438679‑M1/38‑101 (MQ=255)


      cTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                               >  2:3080677/1‑101 (MQ=255)


       tCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                              >  2:2535860/1‑101 (MQ=255)


             gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                                        >  2:3659127‑M1/31‑101 (MQ=255)


             gtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                        <  2:351010‑M1/71‑1 (MQ=255)


             gtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                        >  1:3264479‑M1/31‑101 (MQ=255)


             gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGt                                                                                        <  2:1923504‑M1/71‑1 (MQ=255)


              gcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                                       >  1:2252175‑M1/30‑101 (MQ=255)


              cGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGtcgggcggcgcccgg                                                                                       >  2:784879/1‑94 (MQ=21)


               cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTgg                                                                                      <  2:3160543‑M1/73‑1 (MQ=255)


                ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                     <  2:1562723‑M1/74‑1 (MQ=255)


                   tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGTGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                  >  1:1718180‑M1/25‑101 (MQ=255)


                    ccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                 >  2:4014899‑M1/24‑101 (MQ=255)


                      gggggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                               >  1:255698‑M1/22‑101 (MQ=255)


                             gcggtggCTCGGTGGGGGCGGTGGGGGGGGTGGGGCCGGGAGGGGCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                        <  1:3050787/96‑1 (MQ=9)


                              cGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                       >  2:68906/1‑101 (MQ=255)


                               gtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgg                                                                      <  2:1841816‑M1/89‑2 (MQ=255)


                                tcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGATccgcg                                                                     <  1:4326483‑M1/90‑3 (MQ=255)


                                tGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTg                                                                     <  1:3341066/101‑1 (MQ=11)


                                 gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                                    >  1:3651038/1‑99 (MQ=11)


                                  gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggccgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGGCCGTGGGGTGCGTAGGAGCCGTggg                                                                   >  2:3888283/10‑101 (MQ=11)


                                  gggtccgtcggATCGGTCGGGTACGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                   >  2:4350434/7‑101 (MQ=11)


                                  ggCTCGGTCGGAGCCGTTGCGTCCGTGGGATCGGTCGCGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgg                                                                   <  2:2844672/101‑1 (MQ=17)


                                    gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                 >  1:1276554‑M1/8‑101 (MQ=255)


                                     tccggggggtcggtcgggtccgggggatcggtcgcgtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                <  1:3827873/92‑1 (MQ=11)


                                      cggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCCGGTCCGTCGGAtcg                                                               <  2:2703505/101‑1 (MQ=11)


                                       cgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                              <  1:1999200/100‑1 (MQ=11)


                                        gtgggttcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                             <  1:2410021/95‑1 (MQ=11)


                                        gtgGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                             >  2:529300‑M1/4‑101 (MQ=255)


                                        gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                             <  1:4123204‑M1/98‑1 (MQ=255)


                                         tgGGGTCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                            >  1:3724135‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                         tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                            >  2:2603267‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                          gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGCTACGTGGGGtccgtcg                                                           >  2:1294716/2‑101 (MQ=11)


                                          gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                           >  1:541664/2‑101 (MQ=11)


                                            gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtggGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg                                                         >  1:3147835/1‑101 (MQ=14)


                                             atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATTCGTGGGAGAGGTCggga                                                        >  1:1790630/1‑100 (MQ=14)


                                              tgggtgggggcggtgggggcggtggggtcggggggatcGGTGGGATCGGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATc                                                       <  1:784961/99‑1 (MQ=2)


                                              tcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGCGATCGGTCGGGTc                                                       >  2:1649993/1‑101 (MQ=11)


                                              ccggtctgcttcgtaggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                       <  2:2081529/100‑1 (MQ=14)


                                              ccggtcggggccgtgggggcgatcgggtccctgggccCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                       <  2:925465/100‑1 (MQ=11)


                                               cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATcg                                                      <  1:3187929/101‑2 (MQ=11)


                                                ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTAGGGTCGGGCGGATGCGAGGGGTGGGGAGGGTCCg                                                     >  2:4250652/1‑101 (MQ=2)


                                                ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGGGGGAGCGGTCGGGtggg                                                     >  2:3737254/1‑98 (MQ=11)


                                                 gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTcgga                                                    >  1:3515457/1‑98 (MQ=11)


                                                 gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCAGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGTTAGGGTCCGGGGGATCGGGCGGGCCCgg                                                    >  2:1051003/1‑100 (MQ=11)


                                                  tcgggtgcggggggtcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                   <  1:1879909/101‑2 (MQ=14)


                                                  tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                   >  2:3828394/1‑100 (MQ=11)


                                                  tcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                   >  1:2914111‑M2/1‑100 (MQ=255)


                                                   cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                                                  >  1:1649731/1‑99 (MQ=11)


                                                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCgg                                                 >  2:3440596/1‑101 (MQ=11)


                                                     gatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                <  1:208127/99‑1 (MQ=11)


                                                     gaggcgtgggagcggtcgggtcggtgggttcggtgggGGCCGTGGGATCGGTCGAGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                <  1:93460/97‑1 (MQ=11)


                                                        ccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                             <  2:1209316/101‑1 (MQ=14)


                                                          gtgggttctgtcgggcccgtgggatcggccggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                           <  2:4127018/101‑1 (MQ=11)


                                                          gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                           <  2:2428848‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                           tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                          <  2:2340455/101‑1 (MQ=14)


                                                            gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                         <  1:598480‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                             gcatcggtcgggtccgtggcatctgtcggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg                                        >  2:1430799‑M2/3‑89 (MQ=255)


                                                              gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggg                                       <  1:1189808‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                                              gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggg                                       <  1:694526‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                                              gatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgga                                       <  1:1482123‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                                               gtggggcgggtccgggggatggggcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggat                                      <  1:1110619/95‑3 (MQ=11)


                                                               atcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGgtcgggc                                      >  1:1050274/1‑100 (MQ=11)


                                                                 cggtctggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                                    >  1:460132/1‑101 (MQ=11)


                                                                 cggtcggttccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatcc                                    <  2:2275065/101‑1 (MQ=11)


                                                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatcc                                    >  1:856625‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                                 cggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggggcg                                    >  2:2925048/1‑98 (MQ=11)


                                                                 cggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtcc                                    <  2:149307/101‑1 (MQ=255)


                                                                  tccgatctccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCgtcggatccg                                   <  1:3880983/94‑1 (MQ=11)


                                                                   gtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgt                                  >  1:1343055/1‑101 (MQ=11)


                                                                     cgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcg                                >  1:2781782/1‑101 (MQ=11)


                                                                      gggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGGGGGATCGggcgggtccgtggg                               >  2:3963544/1‑101 (MQ=11)


                                                                      gggtccgtcggaactgagggGTCCGTGGGATCGGTCGGGCTCGTCGCTTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg                               <  2:2759289/101‑1 (MQ=2)


                                                                      cgtaccgtgggatctgtgggGCCCGTCGGGTGGTGGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg                               <  2:1350833/97‑1 (MQ=2)


                                                                        gtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggt                             >  2:611659‑M2/1‑78 (MQ=255)


                                                                        gtccgtgggatcggtcggGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggat                             >  1:273812‑M2/1‑78 (MQ=255)


                                                                        atccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggat                             <  1:1001929/100‑3 (MQ=255)


                                                                            gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgggtccgtgggatcggc                         <  1:1413639‑M2/101‑28 (MQ=255)


                                                                             tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtc                        >  2:3352654‑M2/1‑73 (MQ=255)


                                                                             tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtc                        <  2:2007889/101‑2 (MQ=11)


                                                                              aggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTgg                       >  1:1548872/2‑101 (MQ=14)


                                                                                gatgggggggATCCGGGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGa                     <  1:2153472/93‑1 (MQ=11)


                                                                                 gtcggtcggGTCCGTAGGCTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                    <  2:1124629/100‑1 (MQ=11)


                                                                                 gtccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggt                    <  1:2639566‑M2/100‑33 (MQ=255)


                                                                                   cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggacgggtcg                  <  2:3011526‑M2/101‑35 (MQ=255)


                                                                                    tgtgggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                 >  2:3220283‑M2/2‑66 (MQ=255)


                                                                                      gtggggccGGGGGGTCGGTCGGAGCCGTGGGATCCGGCGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtg               <  1:441142/95‑2 (MQ=2)


                                                                                       cggATCCGACCGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg              <  1:3951593/101‑1 (MQ=17)


                                                                                        ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATAGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg             >  1:4003287/1‑101 (MQ=11)


                                                                                           tctgTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATc          <  2:1750139/98‑1 (MQ=11)


                                                                                            ccGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc         <  2:2192648/101‑1 (MQ=14)


                                                                                              gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt       <  2:1001844‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                                                               tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggcg      <  2:856543‑M2/101‑47 (MQ=255)


                                                                                                 ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg    <  2:3283479‑M2/101‑49 (MQ=255)


                                                                                                 ggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg    >  1:4082981/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                  gATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg   <  1:3444209‑M2/101‑50 (MQ=255)


                                                                                                  gATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa   <  2:4081057/101‑1 (MQ=255)


ATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAT  >  NC_014034/221913‑222112

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG