BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,015	G→C	7.4%	T214T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,015	0	G→C	7.4%	201.9 ‑0.5 ‑0.0	1383	T214T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (53/52): ref base (607/667): total (662/721)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.12e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.24e-01

Only 100 of 1774 total aligned reads displayed.


GCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221916‑222115


 gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                                    <  2:511509‑M1/62‑1 (MQ=255)


 gtgggagcggtcgtgtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                                    >  2:3069976‑M1/40‑101 (MQ=255)


 ggcTCATGGGCGGTGGGCGGCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                                    <  1:1279094/100‑1 (MQ=255)


  tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   >  1:2494380‑M1/39‑101 (MQ=255)


  tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   <  1:2322739‑M1/63‑1 (MQ=255)


  gcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   <  2:4336675/101‑1 (MQ=255)


   gggatcggtcgtatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                  >  2:3644954‑M1/38‑101 (MQ=255)


        cggtcgggtcggtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                             >  2:3151774‑M1/33‑101 (MQ=255)


         ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                            <  1:4116607‑M1/70‑1 (MQ=255)


            ggTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGtcg                                                                                         >  2:3999026/1‑99 (MQ=255)


             gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                        <  2:2650732‑M1/74‑1 (MQ=255)


             gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                        <  1:1904819‑M1/74‑1 (MQ=255)


             gTGGGCGGCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                        <  2:2322869/101‑1 (MQ=255)


              gatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGCGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTcggg                                                                                       >  2:1273889/6‑100 (MQ=11)


                tccgttggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                     >  1:1487105‑M1/25‑101 (MQ=255)


                tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                     >  1:3950777‑M1/25‑101 (MQ=255)


                tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                     >  1:753775‑M1/25‑101 (MQ=255)


                 gCGTCGGATGCGTGTGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                    <  2:3265993/101‑1 (MQ=255)


                 cggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtcc                                                                                    >  1:510706/3‑100 (MQ=11)


                  cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                   <  2:4423253‑M1/79‑1 (MQ=255)


                  cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                   >  1:2925269‑M1/23‑101 (MQ=255)


                    ttcgttccGTTGGGTCCGTCGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCTTTGCATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtccgtg                                                                                 <  2:215016/94‑2 (MQ=18)


                     gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                <  1:1730168‑M1/82‑1 (MQ=255)


                      ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                               >  1:2159432/1‑101 (MQ=255)


                       gatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggtcggg                                                                              <  2:1820332‑M1/84‑2 (MQ=255)


                        atccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcggtcgggt                                                                             >  2:4072354/4‑99 (MQ=11)


                          gggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                                           >  1:4304271‑M1/15‑101 (MQ=255)


                          cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                           <  1:2563567‑M1/87‑1 (MQ=255)


                           gctcggCTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGCTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                          <  2:2822447/97‑1 (MQ=11)


                            gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGAGGGTCCgg                                                                         >  2:3723882/1‑100 (MQ=14)


                             tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                        >  1:1807487/1‑101 (MQ=255)


                               ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                      >  2:2419885/10‑101 (MQ=11)


                                ggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                                     <  1:282336‑M1/93‑1 (MQ=255)


                                 gtcggtcggGTCCGTCGGATCCGGGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                                    <  2:1101138/100‑1 (MQ=11)


                                 gtcagtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGAt                                                                    >  2:918091/5‑101 (MQ=11)


                                  tccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                   <  2:4122944/92‑1 (MQ=11)


                                  tccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                   <  1:3645207‑M1/95‑1 (MQ=255)


                                  tccgtcggATCTGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                   <  2:847197/98‑1 (MQ=11)


                                    cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGACCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGaacag                                                                 >  1:915925/5‑97 (MQ=11)


                                    cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTACGTCGGACCCGTGGGGtcgg                                                                 >  2:382547/5‑101 (MQ=11)


                                    cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGtccgtggggtctt                                                                 <  2:682130‑M1/97‑6 (MQ=255)


                                    cgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg                                                                 <  1:3141996/100‑1 (MQ=11)


                                     gtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggg                                                                <  2:3877923‑M1/98‑2 (MQ=255)


                                      tgggattggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                               <  2:1646815/99‑1 (MQ=11)


                                      tgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAtcggtg                                                               >  2:1534765/3‑100 (MQ=11)


                                      tgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                               <  2:3950523‑M1/99‑1 (MQ=255)


                                      ggGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGgatccgtggggtccgtg                                                               >  1:4373936‑M1/3‑94 (MQ=255)


                                      ggGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGgatccgtggggtccgtg                                                               >  1:351045‑M1/3‑94 (MQ=255)


                                       gGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                              >  2:2745194‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                       gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggatccgtggggtccgtgg                                                              >  2:3333586‑M1/2‑93 (MQ=255)


                                       cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGCCGGAtctgtcg                                                              >  1:3183817/1‑101 (MQ=11)


                                          gtcggtcgggtccttgtgaggggttggattcgttgtaTGGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                           <  2:1991360/100‑3 (MQ=11)


                                          gtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTTGGATCGGGGGGGTGCGTGGGGTCGGGCgggg                                                           >  1:2081666/5‑100 (MQ=11)


                                           tcggtcgtgtccgtgggatcggtcgggtccgtagggTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                          <  2:4245616/101‑1 (MQ=11)


                                            cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGCGGGGTCGGTGGGGTcc                                                         >  2:77427/1‑101 (MQ=14)


                                            cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                         >  2:3412663/1‑101 (MQ=11)


                                            cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc                                                         >  1:1657904/1‑101 (MQ=11)


                                             ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGATCGGCTCCg                                                        >  2:2050942/1‑101 (MQ=11)


                                             cgtcggatccgtggggtccgtcgggtccgtggggtcgGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCTGTCGGATCGGGCGGGGCCg                                                        >  2:1906919/2‑101 (MQ=11)


                                               tcggttccgggggtttggccgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                      <  2:1417054/101‑2 (MQ=14)


                                               tcgggtctgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGTGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                      <  1:3994096/101‑2 (MQ=11)


                                               tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                      <  1:4077130‑M2/101‑2 (MQ=255)


                                               tcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                      <  1:3878177/101‑2 (MQ=11)


                                               tcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc                                                      <  1:134543/101‑2 (MQ=11)


                                                gtgatgcgtgggtgcggtcgggtccgtgggatccgtcggGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                                                     <  1:3045738/95‑3 (MQ=11)


                                                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                    >  1:2410063‑M2/1‑98 (MQ=255)


                                                  ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                                   >  1:4439276‑M2/1‑97 (MQ=255)


                                                  gggccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggga                                                   >  1:973807‑M2/1‑97 (MQ=255)


                                                  gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggga                                                   <  1:2271201‑M2/99‑5 (MQ=255)


                                                   gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCgggggac                                                  >  1:831099/1‑95 (MQ=14)


                                                   ggcggttggatccgtcgggtccgtgggatccgtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                  <  2:2991389/94‑1 (MQ=11)


                                                   ggccgtggcatcggtctggtcgctggggtccgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                  <  2:3502003/99‑1 (MQ=11)


                                                    tcggtgggttcggtcggttccgtcggatccgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                 <  2:1192136/98‑1 (MQ=11)


                                                    tccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                 <  2:1734593‑M2/101‑7 (MQ=255)


                                                     ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcc                                                >  1:3325490‑M2/1‑94 (MQ=255)


                                                        tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                             <  1:2650904/101‑1 (MQ=14)


                                                         gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                            <  2:2249611‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                         gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                            <  1:583653‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                         gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGAtcggtcg                                            >  2:1337914/1‑101 (MQ=11)


                                                          ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg                                           >  1:674494‑M2/1‑89 (MQ=255)


                                                           gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggg                                          <  1:1189808‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                                           gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggg                                          <  1:2007199‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                                            atcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGgtcgggc                                         >  1:1050274/1‑100 (MQ=11)


                                                              cgggtgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatcc                                       <  1:382586/96‑1 (MQ=11)


                                                                gtcgggtgcgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgt                                     >  1:1561928‑M2/1‑83 (MQ=255)


                                                                  cgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggggccgtgg                                   >  2:2894824/1‑99 (MQ=11)


                                                                   gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCGGTGGGGTGGGTGGGGGCGGTGGGATCGggcgtgtccgtggg                                  >  2:102450/1‑101 (MQ=11)


                                                                   ggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGACCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgg                                  >  1:1421556/4‑101 (MQ=11)


                                                                     atccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggat                                <  1:1001929/100‑3 (MQ=255)


                                                                      tccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtc                               <  1:3721336‑M2/101‑25 (MQ=255)


                                                                            ggatcggccggATCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggattggtcgg                         >  2:2564072/1‑92 (MQ=11)


                                                                                cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                     >  1:4208648‑M2/1‑67 (MQ=255)


                                                                                   tcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtg                  >  1:1112378‑M2/1‑64 (MQ=255)


                                                                                    cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                 >  2:3206606/1‑101 (MQ=14)


                                                                                     ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                >  2:598412‑M2/1‑62 (MQ=255)


                                                                                      ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGGAGCGTCGGAtcagtagaa               >  1:2743936/3‑97 (MQ=11)


                                                                                        tcggTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc             <  1:3440835/98‑1 (MQ=18)


                                                                                          ggTGGGTTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg           <  1:3253409/100‑1 (MQ=18)


                                                                                            taggATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCACGTCGACACCGTGCGGACCGTCGGAGCCGTg         >  2:1481528/3‑101 (MQ=2)


                                                                                                  cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc   <  2:2509445‑M2/101‑53 (MQ=255)


GCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221916‑222115

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 14 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG