BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,027	G→C	12.4%	P210P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,027	0	G→C	12.4%	0.0 ‑0.6 ‑0.4	1473	P210P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (75/105): ref base (562/708): total (650/823)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.22e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.83e-01

Only 100 of 1807 total aligned reads displayed.


GGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221928‑222127


cggttctttgggatcgggcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                                     >  2:198934‑M1/29‑101 (MQ=255)


cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                                     <  2:1013565‑M1/73‑1 (MQ=255)


 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                                    <  1:3502244‑M1/74‑1 (MQ=255)


   atccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                                  >  2:2957529‑M1/26‑101 (MQ=255)


    tccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                                 >  2:2560203‑M1/25‑101 (MQ=255)


    tccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                                 >  1:1650099‑M1/25‑101 (MQ=255)


    tccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                                 >  1:2363523‑M1/25‑101 (MQ=255)


     cggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtcc                                                                                                >  1:510706/3‑100 (MQ=11)


      cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                               <  1:4434320‑M1/79‑1 (MQ=255)


       gtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                              <  1:208822‑M1/80‑1 (MQ=255)


                gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGCCCGt                                                                                     >  2:2409906/1‑101 (MQ=11)


                  gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                                                   >  1:4362110/1‑99 (MQ=1)


                     cTCGGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                <  1:4104342/101‑1 (MQ=255)


                       cggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGAtcg                                                                              >  2:2637041/1‑101 (MQ=11)


                       cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                              <  2:1791235/101‑1 (MQ=255)


                         cgcgggttggtcgggtcccgtggaacggtcggctccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                            <  2:1326639/93‑1 (MQ=11)


                          tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGCCGGGGCCGCGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtcggtg                                                                           >  2:273777/3‑100 (MQ=14)


                           gGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                          >  2:169005‑M1/2‑101 (MQ=255)


                           gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                          >  1:242868‑M1/2‑101 (MQ=255)


                            gggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                         <  2:1385029/95‑1 (MQ=14)


                            ggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGAtcggccgg                                                                         >  1:2509837/1‑101 (MQ=11)


                             gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtggGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg                                                                        >  1:3147835/1‑101 (MQ=14)


                              gtcgtgcggctccgtgtggtcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                       <  2:2118743/95‑1 (MQ=11)


                              gtcggtgcggtgcgtgggatcggtggggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                       <  1:4181055/100‑1 (MQ=11)


                               tcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATc                                                                      <  1:3701188/101‑1 (MQ=11)


                                cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGACCGGTGGGATCCGTGGGGTCGGCCGCGTcc                                                                     >  2:221921/1‑101 (MQ=11)


                                cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATcg                                                                     <  1:3187929/101‑2 (MQ=11)


                                ccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     <  1:1404754/99‑1 (MQ=14)


                                 ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                    >  1:91567/1‑101 (MQ=14)


                                  gtcctgtccgtggggtcggtcgtgtccgtgggatcggtctgGTTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                   <  2:2035879/96‑1 (MQ=14)


                                   tcgggtgcgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                                  <  2:4277124/101‑2 (MQ=11)


                                    cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGACCCGtgg                                                                 >  1:3771840/1‑99 (MQ=11)


                                     gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGAACAGGGGATCGGTCGGGTCTGGGGGTTTGGTCGAGTccagcgg                                                                >  2:4371551/1‑96 (MQ=2)


                                     ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                >  2:2486808‑M2/1‑98 (MQ=255)


                                     ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTACGTGGGGTCCGGCGGATCAGTGGGATCGGTCGGATGCGTGgg                                                                >  1:1542973/4‑101 (MQ=11)


                                       gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggt                                                              >  1:3605119‑M2/1‑96 (MQ=255)


                                       gtccgtgggaccggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                              <  2:1877245/101‑1 (MQ=11)


                                       atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggccgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                                              >  2:694446‑M2/2‑96 (MQ=255)


                                        tccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGtggtgcc                                                             >  2:1457650/1‑95 (MQ=11)


                                        tccgtgggatcggtcggatccggaggatcggtgggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                                             <  1:3874748/101‑1 (MQ=11)


                                        gccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                             >  1:1885607‑M2/2‑95 (MQ=255)


                                         ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGGAgggggg                                                            >  2:4100932/1‑97 (MQ=14)


                                         ccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGTTCGGGAGGGGCCGTGGGAgcg                                                            >  2:93439/1‑101 (MQ=11)


                                           gtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTCGGGTCGGTGGGATCCGGGGGATCTGGCGGGTCCGTGGGGtccgg                                                          >  1:3942759/1‑98 (MQ=11)


                                            tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGtcggtc                                                         >  1:2593297/1‑101 (MQ=11)


                                             gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGGGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGTtcggccg                                                        >  2:4175892/1‑101 (MQ=11)


                                             gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                                        <  2:1168435‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                              ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtcggtcgg                                                       >  2:551159/1‑101 (MQ=14)


                                              ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg                                                       >  1:674494‑M2/1‑89 (MQ=255)


                                               gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggg                                                      <  1:2007199‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                               gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggg                                             >  1:342811/1‑101 (MQ=11)


                                                atcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGgtcgggc                                                     >  1:1050274/1‑100 (MQ=11)


                                                 tcggtcgcgtcgctgggctcgggcggGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                                                    <  2:1260469/101‑1 (MQ=11)


                                                  cggtcgggtgcggggggtcgggcggATCCGTGGGACCGGGCGGGTCCCGTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                                                   <  2:1527888/101‑1 (MQ=11)


                                                  cggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                                                   <  2:3983283/101‑1 (MQ=11)


                                                  cggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGGGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGATCGgtcggggcc                                                   >  2:1089172/1‑101 (MQ=11)


                                                  cgggtgggtccgtgggatcgggcggatccgTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                                   >  1:2210165‑M2/6‑85 (MQ=255)


                                                    gtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGggcgggcccgc                                                 >  1:2697121/1‑100 (MQ=11)


                                                      cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgg                                               <  1:4277393‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                                       ggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg                                              >  1:1725886/4‑101 (MQ=11)


                                                        gatccgtgggatcggtcggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggagccgtggga                                             <  1:305821‑M2/99‑23 (MQ=255)


                                                        gatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtcggggccgggggg                                             >  2:868217/3‑96 (MQ=14)


                                                        gatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg                                             >  1:2759479/3‑101 (MQ=11)


                                                         atccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggat                                            <  1:1001929/100‑3 (MQ=255)


                                                           ccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtcg                                          <  2:3156998‑M2/101‑26 (MQ=255)


                                                            cgtggggtccgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcgggtccgtggggtccg                                         <  1:3264308/101‑1 (MQ=11)


                                                             gggggctcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt                                        <  2:4040744/99‑1 (MQ=11)


                                                              tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGCCGGGTCCCTGGGACCGgccggatccgtgggatgggcc                                       >  1:2288633/1‑94 (MQ=11)


                                                              tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtc                                       >  2:3352654‑M2/1‑73 (MQ=255)


                                                              tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtc                                       >  1:1471970/1‑100 (MQ=11)


                                                                   tcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                  >  2:2809553‑M2/1‑68 (MQ=255)


                                                                    cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTGGGAccg                                 >  2:3511269/1‑101 (MQ=11)


                                                                    ccgtcggATGCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtcc                                 <  2:2890154/99‑2 (MQ=11)


                                                                    ccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtcc                                 <  1:589980/99‑2 (MQ=11)


                                                                     tgtgggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                >  2:3220283‑M2/2‑66 (MQ=255)


                                                                      gtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgt                               <  1:1794868/101‑1 (MQ=11)


                                                                        cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtgg                             >  1:1344907/1‑99 (MQ=11)


                                                                         ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTCGGAtccgtggg                            >  1:756352/1‑101 (MQ=11)


                                                                         gaaTCCCTAGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGAtccgtggg                            <  2:384599/99‑1 (MQ=14)


                                                                           ttCCGTGGGACGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGTTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt                          <  2:3928617/100‑1 (MQ=1)


                                                                           gtcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgggag                          <  1:1192227‑M2/100‑42 (MQ=255)


                                                                           aTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                          >  1:967445/1‑101 (MQ=11)


                                                                             ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg                        <  1:4057946‑M2/101‑44 (MQ=255)


                                                                             ccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg                        <  2:3742720‑M2/101‑44 (MQ=255)


                                                                                tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggctcggtc                     <  1:2844879‑M2/101‑47 (MQ=255)


                                                                                 tggttccgtggggTGCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                    <  2:476473/91‑1 (MQ=18)


                                                                                  ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                   <  2:3283479‑M2/101‑49 (MQ=255)


                                                                                  ggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTAGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGggg                   >  2:803743/1‑101 (MQ=18)


                                                                                    aTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                 <  2:1611669/101‑1 (MQ=255)


                                                                                      cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg               <  2:3443970/101‑1 (MQ=17)


                                                                                       ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccg              <  1:3988989‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                                                       ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccg              <  1:2957750‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                                                        gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgt             <  2:3056891‑M2/101‑55 (MQ=255)


                                                                                           gggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggatccgtggg          <  1:839472‑M2/101‑58 (MQ=255)


                                                                                             gTCCGTGTGTTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat        >  2:3665361‑M2/1‑42 (MQ=255)


                                                                                             gTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGt        >  1:1282374/1‑101 (MQ=17)


                                                                                              gccgTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatc       >  1:3341962‑M2/2‑41 (MQ=255)


                                                                                                cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg     <  1:1115876‑M2/101‑63 (MQ=255)


                                                                                                 gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggt    <  2:631788‑M2/101‑64 (MQ=255)


                                                                                                  tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtc   <  2:2311896‑M2/101‑65 (MQ=255)


GGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221928‑222127

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG