BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,030	A→G	8.4%	D209D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,030	0	A→G	8.4%	255.3 ‑0.9 ‑1.5	1457	D209D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (50/76): ref base (582/747): total (634/823)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.98e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.41e-02

Only 100 of 1797 total aligned reads displayed.


GGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGC  >  NC_014034/221931‑222130


gtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                                     >  2:641449‑M1/26‑101 (MQ=255)


atccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                                     >  2:2957529‑M1/26‑101 (MQ=255)


 tccgtggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                                    >  2:1529534‑M1/25‑101 (MQ=255)


 tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGTGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                                    >  1:1718180‑M1/25‑101 (MQ=255)


 tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                                    >  1:3950777‑M1/25‑101 (MQ=255)


   cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                                  <  2:945697‑M1/79‑1 (MQ=255)


    gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                                 <  2:2047280/101‑1 (MQ=255)


     ggggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                >  2:429171‑M1/21‑101 (MQ=255)


       ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                              >  2:2812592/1‑101 (MQ=255)


             gTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTTTGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                                        <  2:704922/101‑1 (MQ=11)


              tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                       <  1:1397394/101‑1 (MQ=255)


               cgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTgg                                                                                      <  1:2579821‑M1/91‑1 (MQ=255)


                gggttcgtgggatgggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                     <  2:818666/92‑1 (MQ=11)


                 ggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                                                    <  1:2352430‑M1/93‑1 (MQ=255)


                 gatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                                    >  1:1528030‑M1/9‑101 (MQ=255)


                  gcgcgtgggatcagtcgggtccgtgggatctgtcgggtccgtgGGGTCCGTCGAATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                   <  2:3860177/94‑1 (MQ=11)


                    cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                 <  2:1791235/101‑1 (MQ=255)


                    ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                 <  2:3285694‑M1/96‑1 (MQ=255)


                    ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                 <  1:2955516‑M1/96‑1 (MQ=255)


                    ccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGCGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtag                                                                                 >  2:2742604/3‑99 (MQ=11)


                     cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                <  1:2278998‑M1/97‑1 (MQ=255)


                     cgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                <  1:1999200/100‑1 (MQ=11)


                      gtggggtccgtcaggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCGGGAGCCGTGGGAtcggc                                                                               >  1:2418537/10‑100 (MQ=11)


                       tgGGGTCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                              >  1:3724135‑M1/3‑101 (MQ=255)


                       tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                              >  1:3145237‑M1/3‑101 (MQ=255)


                       ggGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                              >  1:4067918‑M1/3‑101 (MQ=255)


                        gGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                             >  2:169005‑M1/2‑101 (MQ=255)


                        gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                             <  1:4181928‑M1/100‑1 (MQ=255)


                        cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCTTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                             >  1:318561/1‑101 (MQ=255)


                           gtcggtcgggtccttgtgaggggttggattcgttgtaTGGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                                          <  2:1991360/100‑3 (MQ=11)


                           gtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTTGGATCGGGGGGGTGCGTGGGGTCGGGCgggg                                                                          >  1:2081666/5‑100 (MQ=11)


                           atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGTTCGGTGCGGTCCGTGGGAtccgtcggct                                                                          >  1:2690905/1‑99 (MQ=11)


                           atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATTCGTGGGAGAGGTCggga                                                                          >  1:1790630/1‑100 (MQ=14)


                           atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtctgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCAGTGGGATCGCTCGGATCCGTGGGAtggggcggtt                                                                          >  1:2756505/1‑99 (MQ=14)


                           atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                                          >  2:3756685/1‑99 (MQ=11)


                            tcggtcgcgtacgagggatcgggcgggtccgggggaCCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                         <  2:3668925/101‑1 (MQ=11)


                              ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                       >  1:91567/1‑101 (MQ=14)


                              cgtcggggcggcgggctcgatcgggtctgttggctcgGGCGGGGTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                       <  1:326696/100‑1 (MQ=2)


                               gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTcgga                                                                      >  1:3515457/1‑98 (MQ=11)


                                tcgggtgcggggggtcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                                     <  1:1879909/101‑2 (MQ=14)


                                 tgggtccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                    >  1:2506151‑M2/2‑99 (MQ=255)


                                 cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                                    <  1:3993336/101‑3 (MQ=14)


                                 cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                    <  2:1269919‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                 cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                                                                    >  1:1649731/1‑99 (MQ=11)


                                  ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                                                   >  2:3458139/4‑101 (MQ=11)


                                   ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                                                  >  1:4439276‑M2/1‑97 (MQ=255)


                                    gtccgtgggaccggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                 <  2:1877245/101‑1 (MQ=11)


                                     gccgttggagcgttcagggccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                <  1:4371822/100‑1 (MQ=11)


                                      ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGGAgggggg                                                               >  2:4100932/1‑97 (MQ=14)


                                       cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCGGTgggatcgg                                                              <  2:1182068‑M2/101‑9 (MQ=255)


                                         tgggatcggtcggttccgtcggatcggtcgtGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                            <  2:1471865/101‑1 (MQ=11)


                                         tgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGGGGGGtcggtc                                                            >  1:3345432/1‑101 (MQ=11)


                                          gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGGGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGTtcggccg                                                           >  2:4175892/1‑101 (MQ=11)


                                           ggatcggtcgggtccggtggatcggttggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                          <  2:2241860/101‑1 (MQ=11)


                                            gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggg                                                         <  1:1189808‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                             gtcggtcgggtccgtggggtcgggcggGTCCGTGGGATCGCTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt                                                        <  1:1466875/100‑1 (MQ=14)


                                             gtcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggat                                                        >  2:3367764‑M2/2‑87 (MQ=255)


                                             atcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGgtcgggc                                                        >  1:1050274/1‑100 (MQ=11)


                                              tcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtc                                                       <  2:3535779/101‑1 (MQ=255)


                                               cggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                                                      <  2:3983283/101‑1 (MQ=11)


                                                tccgatctccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCgtcggatccg                                                     <  1:3880983/94‑1 (MQ=11)


                                                ggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTTCgtcggatccg                                                     >  2:322993/1‑101 (MQ=11)


                                                 gtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgt                                                    >  1:1343055/1‑101 (MQ=11)


                                                   cgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGgggatcggtcgggaccgtgg                                                  <  2:1090701‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                                     ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggg                                                <  2:2496763‑M2/101‑23 (MQ=255)


                                                      gtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGggcgggtccgtgggat                                               >  2:1019956/1‑99 (MQ=11)


                                                      atccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggat                                               <  1:1001929/100‑3 (MQ=255)


                                                      atccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggat                                               >  2:132870/2‑99 (MQ=255)


                                                       tccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatc                                              <  1:1279609/101‑1 (MQ=255)


                                                        tcgtaggatcgttcggTGCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                                             <  2:560957/100‑1 (MQ=14)


                                                        ccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtcg                                             <  2:3156998‑M2/101‑26 (MQ=255)


                                                        ccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                                             <  1:3645785/101‑1 (MQ=14)


                                                          gggggctcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt                                           <  2:4040744/99‑1 (MQ=11)


                                                           tgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                          <  1:2166776‑M2/101‑29 (MQ=255)


                                                           taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTg                                          >  1:970207/3‑101 (MQ=14)


                                                             ggatcggccggATCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggattggtcgg                                        >  2:2564072/1‑92 (MQ=11)


                                                              gatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgga                                       <  2:2641548‑M2/101‑32 (MQ=255)


                                                              gatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGa                                       <  1:511561/101‑1 (MQ=11)


                                                                 cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtcc                                    <  1:674500/101‑2 (MQ=11)


                                                                 ccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtcc                                    >  1:429211/3‑100 (MQ=11)


                                                                  ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccg                                   <  2:3930193‑M2/101‑36 (MQ=255)


                                                                   gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtggggtccgt                                  <  2:4373665‑M2/101‑37 (MQ=255)


                                                                     cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                >  2:2312270‑M2/1‑63 (MQ=255)


                                                                      ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTCGGAtccgtggg                               >  1:756352/1‑101 (MQ=11)


                                                                         tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                            >  2:877064‑M2/1‑59 (MQ=255)


                                                                             tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggctcggtc                        <  1:2844879‑M2/101‑47 (MQ=255)


                                                                               ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtaga                      >  2:483140/1‑98 (MQ=14)


                                                                                gATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                     <  1:3444209‑M2/101‑50 (MQ=255)


                                                                                    ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccg                 <  1:3057922‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                                                     gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgt                <  1:1114048‑M2/101‑55 (MQ=255)


                                                                                     gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgt                <  2:3056891‑M2/101‑55 (MQ=255)


                                                                                      tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatgggtcgggtccgtg               <  2:1627562‑M2/101‑56 (MQ=255)


                                                                                        ggggcggTGGGGTGGGTCGGATGCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg             <  1:596042/95‑1 (MQ=14)


                                                                                        gggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggatccgtggg             <  1:839472‑M2/101‑58 (MQ=255)


                                                                                        gggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggttgg             >  2:1387931/1‑101 (MQ=14)


                                                                                         ggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg            <  2:2412477/101‑1 (MQ=255)


                                                                                          gTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt           >  2:2138098/1‑101 (MQ=17)


                                                                                          atcCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggat           >  1:4105033‑M2/2‑42 (MQ=255)


                                                                                             cGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatagg        >  2:2887285‑M2/1‑39 (MQ=255)


                                                                                               tGGGATCGGTCGGATCCTTGGGATCGGTCGGGTGCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc      >  1:3796305‑M2/1‑37 (MQ=255)


GGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGC  >  NC_014034/221931‑222130

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG