BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,036	C→G	4.1%	P207P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,036	0	C→G	4.1%	96.1 ‑3.8 ‑0.7	1355	P207P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (16/43): ref base (547/749): total (563/792)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.18e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.01e-01

Only 100 of 1785 total aligned reads displayed.


TCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGG  >  NC_014034/221936‑222136


tCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                      <  1:1116024/101‑1 (MQ=255)


  ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGCGAACGCACGGATCCGAGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                    >  2:3681979/1‑101 (MQ=18)


      gggTGGGTTCGGTGGGGCCGG.CGGGGCCCGGGGATCGGTCGGGTTCCGGGGATCCGGCGGGTTCGGGGGGTCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                               <  2:491495/99‑1 (MQ=9)


      ccgtcgtatcgggcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATcg                                                                                                <  2:732361/93‑2 (MQ=14)


       gctcggCTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGCTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                               <  2:2822447/97‑1 (MQ=11)


             ggccgtcgcACCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                                                         <  2:1288895/97‑1 (MQ=11)


              tccgtcggATCGGTCGGCTCTGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                        <  2:2139993/98‑1 (MQ=11)


              tccggggggtcggtcgggtccgggggatcggtcgcgtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                        <  1:3827873/92‑1 (MQ=11)


              gccgccggATCTGTCGGGTCCGTGGGACCGGTACGGTCCGTTGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                                                                        <  2:3942505/96‑1 (MQ=11)


               cggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGGCCGTGGGAtcg                                                                                       >  1:847279/1‑101 (MQ=11)


                cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGCGGGAtcgg                                                                                      <  2:3392958‑M1/97‑1 (MQ=255)


                   gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                   >  1:541664/2‑101 (MQ=11)


                   gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                   <  2:2969971‑M1/100‑1 (MQ=255)


                    ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg                                                                                  >  1:2028716/1‑101 (MQ=11)


                     gatcgggcggatccgtgggatcggtcggatccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgga                                                                                 <  1:3202571/101‑2 (MQ=11)


                      ggcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtgggat                                                                                <  1:2312046/99‑3 (MQ=11)


                        tcgtcgggtgcgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                              <  1:971583/99‑1 (MQ=14)


                        ggggggggtccgtgggatgggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                                              <  1:2249754/96‑1 (MQ=11)


                         ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGGGGGATCGGTGGGGTCCg                                                                             >  2:3303643/1‑101 (MQ=14)


                         ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGATCGGCTCCg                                                                             >  2:2050942/1‑101 (MQ=11)


                         ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCg                                                                             >  1:4312267/1‑101 (MQ=11)


                          gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGGCCGTGGGGTCGGGCggggcagg                                                                            >  2:3465041/1‑96 (MQ=11)


                           tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                           <  1:4077130‑M2/101‑2 (MQ=255)


                           gtgggtgcgtggggtcggtcgggtccgtggggtcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                                           <  1:4115091/99‑2 (MQ=11)


                           gtgggtccgtgggatcggtcgggtgcgtggggtccttcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                                           <  1:1957902/99‑2 (MQ=11)


                            cgggtcctggtgatccgtcggggccgcgggaccggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                                          <  2:2418380/101‑3 (MQ=1)


                            cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcgggtcggtGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCTGtgg                                                                          <  2:3766932/101‑3 (MQ=11)


                            cgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCggggcggggg                                                                          >  1:3745872/1‑94 (MQ=11)


                             gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAGCGGTCGGATCCGTCGGTTCGGTCGGGTCCgcggg                                                                         >  2:1096629/1‑97 (MQ=11)


                              ggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                                                        >  1:2408738‑M2/1‑97 (MQ=255)


                              ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                                                        >  2:1788604‑M2/1‑97 (MQ=255)


                               ttccgtgggatcgggcggatccgtgggatctggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                       <  1:1767942/100‑1 (MQ=11)


                                tcggtgggttcggtcggttccgtcggatccgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                      <  2:1192136/98‑1 (MQ=11)


                                  cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                    >  2:1989559/1‑101 (MQ=11)


                                   gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                                                   >  1:1485385‑M2/1‑92 (MQ=255)


                                     gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                                                 <  2:2249611‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                     gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGAtcggtcg                                                                 >  2:1337914/1‑101 (MQ=11)


                                      ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg                                                                <  1:3151998‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                         tcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtc                                                             >  2:1712024‑M2/1‑86 (MQ=255)


                                          cggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgggtcg                                                            <  1:1570859‑M2/101‑17 (MQ=255)


                                          cggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                                                            <  1:1684638/101‑1 (MQ=11)


                                          cggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                                            >  2:3569426‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                           gggcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg                                                           >  1:2558968/4‑101 (MQ=11)


                                            gtcggatcggtgggaccggtcggAT.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGTTCGgtcgggtccgtc                                                         <  2:4057686/101‑1 (MQ=14)


                                             tcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtc                                                         <  2:4107914/101‑1 (MQ=255)


                                              cgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgg                                                        <  2:819899‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                              cgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcg                                                        <  2:3862901/101‑1 (MQ=11)


                                              cgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcg                                                        >  1:2781782/1‑101 (MQ=11)


                                              cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcg                                                        >  1:3655479/1‑101 (MQ=255)


                                              cggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtgggggccgtgg                                                        >  2:4208387/1‑99 (MQ=11)


                                               gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCGGTGGGGTGGGTGGGGGCGGTGGGATCGggcgtgtccgtggg                                                       >  2:102450/1‑101 (MQ=11)


                                               ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccggggg                                                       <  2:880948‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                               ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                                                       >  1:3284457/4‑101 (MQ=255)


                                               ggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGACCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgg                                                       >  1:1421556/4‑101 (MQ=11)


                                                tgcccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGCGTGGGTGGGTCTGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg                                                      <  1:246952/98‑1 (MQ=2)


                                                gatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg                                                      >  1:2991610/3‑101 (MQ=11)


                                                 tgccgtggggtccgttggATCCGTGGGGTCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggt                                                     <  1:780274/99‑1 (MQ=11)


                                                 gtccgtgggatcggtcggGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggat                                                     >  1:273812‑M2/1‑78 (MQ=255)


                                                 atccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggat                                                     <  1:1001929/100‑3 (MQ=255)


                                                    cgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcgg                                                  <  2:1530672/101‑3 (MQ=255)


                                                        ggatcgggcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTggg                                              <  2:3170165/101‑1 (MQ=11)


                                                         gatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgggggatcggtcggg                                             <  2:3990008‑M2/101‑32 (MQ=255)


                                                         gatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcgggcggg                                             <  1:3070197‑M2/101‑32 (MQ=255)


                                                          gtccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggt                                            <  1:2639566‑M2/100‑33 (MQ=255)


                                                           tccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtc                                           <  2:2751487/98‑1 (MQ=11)


                                                             ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGGCGGGTCCGTGGGAtcgg                                         >  1:611125/1‑101 (MQ=14)


                                                               tgggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtagggtccgtg                                       <  2:2319248‑M2/99‑38 (MQ=255)


                                                                 ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATAGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg                                     >  1:4003287/1‑101 (MQ=11)


                                                                  ggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTGGGATCGGACGGa                                    >  1:2136532/3‑101 (MQ=14)


                                                                   gtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgggt                                   <  1:1202808/100‑3 (MQ=11)


                                                                    tCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                  >  1:2879443‑M2/1‑59 (MQ=255)


                                                                     cggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGACcc                                 >  2:289075/6‑101 (MQ=17)


                                                                     ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                 >  1:352794/1‑101 (MQ=14)


                                                                      ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                >  1:1061773/5‑101 (MQ=17)


                                                                       gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCgg                               >  1:4231758/1‑100 (MQ=14)


                                                                       gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                               <  2:4324698‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                                         gggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                             <  2:652153‑M2/101‑48 (MQ=255)


                                                                         gggATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                             <  2:3057701/101‑1 (MQ=14)


                                                                          ggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg                            <  1:1842783/101‑1 (MQ=14)


                                                                            aTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggat                          >  2:325018‑M2/1‑51 (MQ=255)


                                                                            aTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                          >  1:3964262/1‑101 (MQ=255)


                                                                              cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatcc                        >  1:456782‑M2/1‑49 (MQ=255)


                                                                               ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggggccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccg                       <  2:2505988‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                                               ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                       <  2:1877148‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                                                gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgt                      >  2:1395055‑M2/1‑47 (MQ=255)


                                                                                 tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatgggtcgggtccgtg                     <  2:1627562‑M2/101‑56 (MQ=255)


                                                                                 tcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtc                     <  1:13538/101‑1 (MQ=17)


                                                                                  cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGACGGGTCCGGGGGAtcgggcg                    >  2:2566602/1‑101 (MQ=14)


                                                                                   gggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg                   <  1:3918430/101‑1 (MQ=17)


                                                                                    ggTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggc                  <  1:129227‑M2/101‑59 (MQ=255)


                                                                                     gTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                 >  1:916498‑M2/1‑42 (MQ=255)


                                                                                       ccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGAcc               >  2:4403865/1‑101 (MQ=14)


                                                                                        cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGCCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg              >  1:4382876/1‑101 (MQ=255)


                                                                                         gTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt             >  2:948868‑M2/1‑38 (MQ=255)


                                                                                           cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGGCGGGTCGGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGATGGGTCGGGTCCGGgg           >  2:1473248/2‑101 (MQ=14)


                                                                                            ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTggg          >  1:694404/1‑101 (MQ=18)


                                                                                                cggtcggGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcc      >  1:3353720‑M2/1‑31 (MQ=255)


                                                                                                  gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgg    <  2:2669032‑M2/101‑73 (MQ=255)


                                                                                                   tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtg   <  2:576058‑M2/101‑74 (MQ=255)


                                                                                                    cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg  >  1:3453009/1‑93 (MQ=11)


TCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGG  >  NC_014034/221936‑222136

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 14 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG