BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,045	G→C	7.3%	P204P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,045	0	G→C	7.3%	187.8 ‑0.9 0.0	1352	P204P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (35/59): ref base (504/699): total (562/790)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.87e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1783 total aligned reads displayed.


TGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221945‑222145


 cgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCTGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                                     <  1:2305349‑M1/91‑1 (MQ=255)


   gatcggtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                                   <  1:895464/99‑1 (MQ=11)


   gatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCTGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                                   >  2:2278853‑M1/9‑101 (MQ=255)


    ttccgtgggatcggtcgggtccgttggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                                  <  2:2619677/94‑1 (MQ=11)


    gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                                  >  1:4364802‑M1/8‑101 (MQ=255)


    gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGgag                                                                                                  <  1:501404‑M1/94‑2 (MQ=255)


     tcggtgggGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtc                                                                                                 <  1:3737507/101‑1 (MQ=14)


     tccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                                 <  1:3645207‑M1/95‑1 (MQ=255)


      cggtgggGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                <  2:3044139/101‑1 (MQ=14)


      cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                >  2:3434638/1‑101 (MQ=255)


      cagtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg                                                                                                <  2:694324/99‑1 (MQ=14)


       cgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                               <  1:3197929/91‑1 (MQ=11)


         tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                             >  1:3145237‑M1/3‑101 (MQ=255)


          gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGATCGGTGGGGTCGGGCGGATGCGGGGGGtcgggcg                                                                                            >  2:803499/2‑101 (MQ=11)


          gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTGCGGGGGGtccgtcg                                                                                            >  2:3827620/2‑101 (MQ=11)


          gGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                            >  1:67102‑M1/2‑101 (MQ=255)


           gggtcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                           <  1:1942736/98‑1 (MQ=14)


            gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGATCCGTGCGATCGGTCGGGTTCGTGGGTTCCGTCTGATCCGTggggcccgtgggg                                                                                          >  2:621675/1‑91 (MQ=11)


             ctcgggcggggcggtggagtcggggggggcggtgggaTCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                                         <  2:2781852/100‑1 (MQ=11)


             atcggttggatccgtgggatcggtcggatccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                                                         <  2:397076/101‑3 (MQ=11)


             atcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCgggg                                                                                         >  2:1512829/1‑100 (MQ=11)


             atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggATCGGTGGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTCGGATCGGTCgggc                                                                                         >  1:4104174/1‑100 (MQ=11)


              tcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGCGATCGGTCGGGTc                                                                                        >  2:1649993/1‑101 (MQ=11)


              ccggtctgcttcgtaggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                        <  2:2081529/100‑1 (MQ=14)


               cgttcgggtccgtgggatcggtcgggttcgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                       <  2:3507709/98‑1 (MQ=11)


               cggtcgtggccgtgggatcggtcgggttcgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                       <  2:2166637/101‑1 (MQ=14)


               cggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtgggtgggagac                                                                                       >  2:1833545/1‑97 (MQ=11)


               cggtcgggcccgggggatcggtcgggtccctggggtGCCTCGGTTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                       <  2:2543338/101‑1 (MQ=11)


               cggtccggtccgtgggatcgttcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCCGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                       <  2:1441491/101‑1 (MQ=14)


                ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATTGGTCGGATCCg                                                                                      >  1:75488/1‑101 (MQ=11)


                  gcaggtccgtgggaggggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGtg                                                                                    <  1:2528635/98‑2 (MQ=11)


                   gtgatgcgtgggtgcggtcgggtccgtgggatccgtcggGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                                                                                   <  1:3045738/95‑3 (MQ=11)


                   cgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGtgg                                                                                   >  2:3264247/1‑99 (MQ=11)


                   cgggtccgtgggatcgttcgggtccgtgggatcggcCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                                                                                   >  1:3898669/1‑99 (MQ=14)


                   cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                                                   <  1:3993336/101‑3 (MQ=14)


                   cgggtccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                                                                                   <  1:1609178/101‑3 (MQ=11)


                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGACCGTGgg                                                                                  >  2:2879235/1‑101 (MQ=11)


                    gggtccgtgggagcggtcgggtccgggggatccgtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                                  <  2:4276358/101‑1 (MQ=11)


                    cggtccggggggtcaggcggatccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                                  <  1:4433432/100‑1 (MQ=11)


                     gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTCGGGTCGGGTGGCTCCggggga                                                                                 >  1:2691443/3‑96 (MQ=11)


                       tctgtgggatgggtcgggtccgggggatcggccggGTCCGGGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                               <  1:243160/98‑1 (MQ=11)


                       tccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                                               <  2:1734593‑M2/101‑7 (MQ=255)


                       tccgtgggatcggccgggtccgtgggatcggtcggGTCAGTCGGATCGGTCGGGCCCGTGGGGTAGGACGGATCAGTGGAAACGGTGGGGTcagagggacc                                                                               >  2:3723233/1‑92 (MQ=9)


                        ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCggggggtcg                                                                              >  1:2024853/1‑93 (MQ=11)


                         cgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCCTGGGAtcgg                                                                             >  1:2112789/1‑101 (MQ=11)


                          gtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGggctgcgt                                                                            >  2:2452343/1‑95 (MQ=11)


                           tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                           <  2:2340455/101‑1 (MQ=14)


                           ggggagcggtcggttccgggggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGAGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                           <  2:2950396/100‑1 (MQ=11)


                            gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                                                          <  1:1498729‑M2/101‑12 (MQ=255)


                              gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggg                                                                        >  2:4090952‑M2/1‑88 (MQ=255)


                              gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggg                                                               >  1:342811/1‑101 (MQ=11)


                               atcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGgtcgggt                                                                       >  1:169026/1‑101 (MQ=11)


                                 tggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGGGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                                                     >  1:4176153‑M2/2‑85 (MQ=255)


                                 cggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGGGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGATCGgtcggggcc                                                                     >  2:1089172/1‑101 (MQ=11)


                                    tcgggtccggcggctcggtcggCGCCGTGGGTTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGACCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGggcgggtccgtc                                                                  <  2:201310/101‑1 (MQ=11)


                                    tcgggtacgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtg                                                                  <  2:3345195/101‑2 (MQ=11)


                                    tcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtc                                                                  >  1:2853147/1‑101 (MQ=255)


                                     cgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgg                                                                 <  2:3604028‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                      gggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGCTCGGGCCCCTGGGAACGgccgggcccctccg                                                                >  1:828697/1‑99 (MQ=11)


                                      ggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGACCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgg                                                                >  1:1421556/4‑101 (MQ=11)


                                        gtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggat                                                              <  1:3507950‑M2/101‑24 (MQ=255)


                                        atccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggat                                                              <  1:1001929/100‑3 (MQ=255)


                                          ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCgtcggatccgagatcgga                                                            >  2:3880729/1‑93 (MQ=11)


                                          ccgtaggagcggtcggTTCCGTAAGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                                                            <  2:549002/101‑1 (MQ=14)


                                               ggatcggtcggGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                       >  2:1369599‑M2/1‑71 (MQ=255)


                                                ggtcgggcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGa                                                      <  1:334499/99‑1 (MQ=11)


                                                 gtcggtcgggTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                                                     >  1:1780895‑M2/2‑69 (MQ=255)


                                                  tccgtcggAGCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtc                                                    <  2:4018452/98‑1 (MQ=11)


                                                   cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                   <  1:2760080‑M2/101‑35 (MQ=255)


                                                   cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGGCCGTGGGAtcg                                                   >  2:4164590/1‑101 (MQ=11)


                                                   ccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtcc                                                   <  1:589980/99‑2 (MQ=11)


                                                     gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtggggtccgt                                                 <  2:4373665‑M2/101‑37 (MQ=255)


                                                     gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgt                                                 <  1:223626/101‑1 (MQ=11)


                                                      tcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                >  2:3197700/1‑101 (MQ=14)


                                                       cggATCCGACCGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                               <  1:3951593/101‑1 (MQ=17)


                                                          gtcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                            <  1:4276627‑M2/100‑42 (MQ=255)


                                                          gtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgggt                                            <  1:1202808/100‑3 (MQ=11)


                                                             ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                         >  1:1061773/5‑101 (MQ=17)


                                                              gtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                        >  2:272248/4‑101 (MQ=17)


                                                               tGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcgggc                                       <  1:960554‑M2/101‑47 (MQ=255)


                                                                 ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtaga                                     >  2:483140/1‑98 (MQ=14)


                                                                 ggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg                                     <  1:1842783/101‑1 (MQ=14)


                                                                    tcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                  >  1:2375123‑M2/1‑50 (MQ=255)


                                                                        tcggGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                              >  2:125904‑M2/1‑46 (MQ=255)


                                                                        tcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtc                              <  1:13538/101‑1 (MQ=17)


                                                                           ggTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggc                           <  1:129227‑M2/101‑59 (MQ=255)


                                                                              ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcg                        <  2:875743‑M2/101‑62 (MQ=255)


                                                                               cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                       <  1:1115876‑M2/101‑63 (MQ=255)


                                                                                gTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                      >  2:948868‑M2/1‑38 (MQ=255)


                                                                                         gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggggtcggtcggttccgt             <  1:4053506‑M2/101‑73 (MQ=255)


                                                                                         gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggaacggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt             >  1:3815086‑M2/1‑29 (MQ=255)


                                                                                           cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcagatcggaag           <  1:291569‑M2/101‑75 (MQ=255)


                                                                                           cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgg           <  1:2603438‑M2/101‑75 (MQ=255)


                                                                                            ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTggggtcggtcgg          >  1:3283536/1‑93 (MQ=14)


                                                                                             ggtccgtgtggtcggtcgggtccgtgggaccggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggga         >  2:1009113‑M2/3‑25 (MQ=255)


                                                                                              gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggat        <  2:1177301‑M2/100‑78 (MQ=255)


                                                                                               gccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtc       <  2:1570754/100‑1 (MQ=255)


                                                                                                  gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt    <  2:1919223‑M2/101‑82 (MQ=255)


                                                                                                  gtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggt    <  2:3119689‑M2/101‑82 (MQ=255)


                                                                                                    gggATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGGGGGAtcggtcg  >  2:1318382/1‑101 (MQ=255)


TGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221945‑222145

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG