BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,096	G→C	3.5%	T187T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,096	0	G→C	3.5%	16.0 ‑1.0 ‑0.3	311	T187T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (4/7): ref base (159/141): total (163/148)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.62e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.82e-01

Only 100 of 438 total aligned reads displayed.


CGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCGCAG  >  NC_014034/221996‑222196


cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGGCCGTGGGAtcg                                                                                                      >  2:4164590/1‑101 (MQ=11)


ccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                      >  1:924420/6‑101 (MQ=14)


 ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGGCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                                     >  1:611125/1‑101 (MQ=14)


 cgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGtcgg                                                                                                     >  1:3053644/5‑101 (MQ=14)


  gtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                                    >  2:1198474/4‑101 (MQ=14)


  gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGTTCGGTCGGATCCGTGGGGGCCGTGGAGtcggc                                                                                                    >  1:711019/1‑100 (MQ=11)


  gtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGGCGGTGGGGtgggt                                                                                                    >  2:398447/1‑101 (MQ=11)


  gtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgt                                                                                                    <  1:4396380/101‑1 (MQ=11)


   tgggcgacGTAGGTTCGGTGGGGTCCGTCGGATCGATCGGATCCGTGGAATCGGTCGGGTCCGTCGGATGCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   <  1:2564235/94‑1 (MQ=14)


   tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   <  2:2704937/101‑1 (MQ=11)


   tcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   <  2:967360/101‑1 (MQ=14)


   gcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   <  1:3154567/100‑1 (MQ=14)


    cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGGGGGGTCGGTGGCGtcggtgg                                                                                                  >  2:2931943/1‑99 (MQ=11)


      ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGGAGCGTCGGAtcagtagaa                                                                                                >  1:2743936/3‑97 (MQ=11)


      ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcggg                                                                                                >  1:1611775/3‑100 (MQ=11)


      gctCCGCGGGGTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcggg                                                                                                <  2:1742818/99‑2 (MQ=14)


       gtgcggtggATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgggt                                                                                               <  1:370557/94‑3 (MQ=14)


        tcggTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                                              <  1:3440835/98‑1 (MQ=18)


        tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATGGGCCGGGTCGGTGGGGTCGGTGGGAtcgggagggtc                                                                                              >  1:4424391/1‑94 (MQ=11)


         ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                             >  1:352794/1‑101 (MQ=14)


          cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                            >  1:2337750/1‑101 (MQ=255)


           gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGCCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgc                                                                                           >  1:148317/1‑100 (MQ=14)


           gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                           >  1:190448/1‑101 (MQ=14)


            tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                                          >  1:2829870/1‑101 (MQ=14)


            gcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                          <  1:786881/99‑1 (MQ=255)


             gggTTCGGTCGGTTCCGTGGGTCCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGACCGATcccacg                                                                                         <  2:3759876/101‑5 (MQ=11)


              gggtcgcgcggCTCCTTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                        <  2:2290174/93‑1 (MQ=18)


              ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtaga                                                                                        >  2:483140/1‑98 (MQ=14)


               gATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGACGGGCCCGTGCGACCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGCCGGGTCCGCCGGGTCCGTGGGATCGTTCGGATCCGAGGGa                                                                                       >  2:1997300/1‑101 (MQ=18)


                gtccggggggGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                      <  1:989948/94‑1 (MQ=18)


                aTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                      >  1:3964262/1‑101 (MQ=255)


                  gggtgggGTCCGGGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                    <  1:875828/100‑1 (MQ=21)


                  gggtcggGTCCGTCGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg                                                                                    <  1:1161086/100‑1 (MQ=14)


                   ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg                                                                                   >  2:314854/1‑101 (MQ=14)


                   ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg                                                                                   >  2:1491012/1‑101 (MQ=14)


                    gtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                  >  2:3107213/4‑101 (MQ=255)


                     tcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtc                                                                                 <  1:13538/101‑1 (MQ=17)


                      ggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                >  1:1440037/2‑101 (MQ=255)


                      cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGACGGGTCCGGGGGAtcgggcg                                                                                >  2:2566602/1‑101 (MQ=14)


                       ggggcggTGGGGTGGGTCGGATGCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                               <  1:596042/95‑1 (MQ=14)


                       gggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg                                                                               <  1:3918430/101‑1 (MQ=17)


                         gTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                             >  1:4253719/1‑101 (MQ=255)


                         gTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                             <  2:4082721/101‑1 (MQ=255)


                          tCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                            <  1:2999774/101‑1 (MQ=17)


                           ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                           >  1:1798198/1‑101 (MQ=255)


                            cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCg                                                                          <  1:2669204/101‑1 (MQ=11)


                              tcggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTCGGTAGGATCGGTCggggcgggg                                                                        >  2:2772042/3‑95 (MQ=17)


                               gggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGCTCGGTCGGGGCCGtag                                                                       >  2:3596055/1‑99 (MQ=17)


                               gggATCGGTCGGATCCGTGAAATCGGTCGGGCCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGGCCCGTGGGACGGGCCGGGTCCGACCGCTCGGTCggggcggtat                                                                       >  2:437310/1‑94 (MQ=2)


                                ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                      <  1:3469310/101‑1 (MQ=17)


                                ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCCGGATCGGTCGGGTCCGGggg                                                                      >  1:2222652/1‑101 (MQ=17)


                                  gtcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggat                                                                    <  2:42591/100‑3 (MQ=14)


                                  aTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTcgggt                                                                    <  2:2866554/101‑2 (MQ=11)


                                  aTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGCTCGGGGCCGTGGGCTCGGTCGGGTccctaggcg                                                                    >  2:1556399/1‑94 (MQ=17)


                                   tcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                                   <  1:1989688/101‑4 (MQ=14)


                                   gccgttggATCGGTGGGAGCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatc                                                                   <  1:2019117/95‑4 (MQ=11)


                                     ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTcggatcgg                                                                 >  1:1089415/1‑96 (MQ=14)


                                      gtcggGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGCTCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggt                                                                <  2:60592/101‑1 (MQ=255)


                                        tggggcggTGGGGTCGGTCGGGTCCGTAGGGGCGGGCGGTTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggtgg                                                              <  1:402665/94‑1 (MQ=18)


                                        cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggtcg                                                              <  1:2907312/101‑9 (MQ=14)


                                         ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTggggtcggtcgg                                                             >  1:3283536/1‑93 (MQ=14)


                                         ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTggg                                                             >  1:3983539/1‑101 (MQ=14)


                                         ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTgggatcgggcgg                                                             >  1:4091986/1‑92 (MQ=11)


                                         ggATCCGTGGGAACGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggaacggtcgg                                                             >  1:3187348/1‑92 (MQ=11)


                                           aTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTggggaacgagggat                                                           >  2:3461339/1‑91 (MQ=11)


                                             ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGCTGGTGGGTtcg                                                         >  1:3773651/1‑101 (MQ=255)


                                                 gggATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtcg                                                     >  2:3367281/1‑101 (MQ=255)


                                                 gggATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGGGGGAtcggtcg                                                     >  2:1318382/1‑101 (MQ=255)


                                                  ggATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtcgg                                                    >  2:69079/1‑101 (MQ=255)


                                                    ttcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAc                                                  <  2:3020501/100‑1 (MQ=255)


                                                    aTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAc                                                  >  1:2532582/1‑101 (MQ=255)


                                                     tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAcc                                                 <  1:1701155/101‑1 (MQ=255)


                                                       ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGc                                               >  2:3900618/1‑101 (MQ=255)


                                                        gtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCt                                              >  1:174429/1‑101 (MQ=255)


                                                        ggcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCt                                              <  1:3873868/99‑1 (MQ=255)


                                                          cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGt                                            >  2:2370818/1‑101 (MQ=255)


                                                           gggTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTc                                           >  1:3588800/1‑101 (MQ=255)


                                                           gggTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTc                                           <  1:1219894/101‑1 (MQ=255)


                                                            ggTCGGTAGGGTCCGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcg                                          <  2:3275167/101‑1 (MQ=255)


                                                            ggTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGGGGGATCGGTCGGACCGCTGTcg                                          >  1:1313575/1‑101 (MQ=255)


                                                             gTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgc                                         >  2:1592523/1‑101 (MQ=255)


                                                              tCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgcc                                        >  2:1717757/1‑101 (MQ=255)


                                                              tCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgcc                                        <  1:3360620/101‑1 (MQ=255)


                                                                 gtgggATCGGTCGGCTCCATCGGCTCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgcc                                     <  2:2965977/98‑1 (MQ=25)


                                                                 gTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgcc                                     >  1:239836/1‑101 (MQ=255)


                                                                  gggggtcggtcggGTGCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgccg                                    <  1:102471/96‑1 (MQ=255)


                                                                    ggATCGGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCgccgccgcc                                  <  1:4153365/101‑1 (MQ=255)


                                                                    ggATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCgccgccgcc                                  <  1:272283/101‑1 (MQ=255)


                                                                             gggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAcc                         >  2:2027120/1‑101 (MQ=255)


                                                                               gtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAcccc                       >  2:3543656/1‑100 (MQ=255)


                                                                                   gtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggcc                   <  2:1446304/101‑1 (MQ=255)


                                                                                     cgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccgg                 >  2:2109745/1‑101 (MQ=255)


                                                                                         tccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAg             <  1:2109882/101‑1 (MQ=255)


                                                                                           cgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGAc           >  2:736361/1‑101 (MQ=255)


                                                                                            gtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGAcc          <  1:69092/101‑1 (MQ=255)


                                                                                            gtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGAcc          <  2:883087/101‑1 (MQ=255)


                                                                                             tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCg         <  2:2482860/101‑1 (MQ=255)


                                                                                              gggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCgg        >  2:1642491/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                gATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGcc      >  2:1390232/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                 aTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGCCCGGCCg     >  2:2188113/1‑101 (MQ=255)


CGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCGCAG  >  NC_014034/221996‑222196

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 14 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG