Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 681,548 | A→G | 10.8% | F687L (TTT→CTT) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 681,548 | 0 | A→G | 10.8% | 44.4 0.0 ‑0.7 | 195 | F687L (TTT→CTT) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (12/9): ref base (98/76): total (110/85) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.98e-01 |
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
TCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTGCACCGAGCCAAGCCCG > NC_014034/681448‑681648
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tCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa < 2:4280718/101‑1 (MQ=255)
cGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAg < 1:780467/101‑1 (MQ=255)
cGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAg > 2:175137/1‑101 (MQ=255)
gAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGc > 2:1917211/1‑101 (MQ=255)
aGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGcc < 1:3509416/101‑1 (MQ=255)
aGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGcc > 2:2289594/1‑101 (MQ=255)
cgccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccct > 1:2597334/1‑99 (MQ=2)
gccgcGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCcgcg > 2:1293045/1‑101 (MQ=255)
gccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccctt < 1:3082810/101‑4 (MQ=9)
cgcgATCTGCGTGCGGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGa < 2:2525780/101‑1 (MQ=255)
gcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGAt < 1:1917335/101‑1 (MQ=255)
gcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGAt > 1:4170241/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg < 1:3220519/101‑1 (MQ=255)
accTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCCTCGGTGCCGAGGCCCTTGATcgc > 1:147936/3‑101 (MQ=2)
aTCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgc > 1:4219645/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgc > 2:861525/1‑101 (MQ=255)
tCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgcc > 1:3190304/1‑101 (MQ=255)
cTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGCCCTTGATcgcat > 2:3641289/1‑99 (MQ=2)
cTGCGGGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgccg < 2:3287112/101‑1 (MQ=255)
tGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgccgc < 1:1186836/101‑1 (MQ=255)
gTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGt > 2:2308907/1‑101 (MQ=255)
tGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTg > 2:4161584/1‑101 (MQ=255)
ggTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa < 2:3574863/101‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa > 1:4339994/1‑101 (MQ=255)
gTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAg > 1:2038975/1‑101 (MQ=255)
atctcggtgcCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAg > 2:2030951/9‑101 (MQ=255)
tCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgc < 1:685771/101‑1 (MQ=255)
tCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgc < 1:4161094/101‑1 (MQ=255)
aGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcgc > 2:2347894/1‑101 (MQ=255)
cgcgcCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGcgccg < 2:817906/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGcgccgc < 2:546586/101‑1 (MQ=255)
gcCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCa < 2:1567954/101‑1 (MQ=255)
ccGATCTGCCCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAc < 1:826334/101‑1 (MQ=255)
cGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAcc > 1:1226624/1‑101 (MQ=255)
cTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCg < 2:940128/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGGCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCg < 2:1396715/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCCGCCCCGCCCCCGTCGc > 1:1046853/1‑101 (MQ=255)
tGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGc < 2:3125059/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCCCCGTCGTCAGCTCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGc < 2:3688540/101‑1 (MQ=255)
cgcCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCg > 2:4029198/1‑101 (MQ=255)
cgcCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCg > 1:71686/1‑101 (MQ=255)
cgcCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCg > 1:2621328/1‑101 (MQ=255)
gcCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGa < 2:3497503/101‑1 (MQ=255)
ccGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGaa < 1:3567722/101‑1 (MQ=255)
cGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAg < 1:2523802/101‑1 (MQ=255)
cGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAg < 2:4169980/101‑1 (MQ=255)
cGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCCCCGCAGTGCCCAGCGCCGCCACCGCCGCCgcac > 1:1727166/1‑98 (MQ=37)
gAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGc > 1:3406452/1‑101 (MQ=255)
aGCCCAGCCGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGcc < 2:1664634/101‑1 (MQ=255)
aGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCCCCGTCGCCGAAGca > 1:3551043/1‑100 (MQ=255)
aGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGcc < 1:4058288/101‑1 (MQ=255)
cccAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAg < 1:2433432/101‑1 (MQ=255)
ccAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAgc < 1:2952995/101‑1 (MQ=255)
ccAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAgc < 1:227247/101‑1 (MQ=255)
gACGCGCCCCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGcgcc < 1:1077993/101‑1 (MQ=255)
aCGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGGGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGcgccg > 2:716535/1‑101 (MQ=255)
gcgcCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCcgcg > 1:1177141/1‑101 (MQ=255)
ccgccgcCTGCGCCGTCGTCAGCGCCCCGATGTCATCGGTGCCGAGGCCCTTGATCGCATTGGCACTCAGCGCCGTCACGCTGGCCGTATTCAGcgccgca > 2:2096282/2‑100 (MQ=25)
gccgccTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGAt > 2:227697/1‑101 (MQ=255)
gccgccTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGAt > 2:558931/1‑101 (MQ=255)
ccgccTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATc > 1:3942465/1‑101 (MQ=255)
cgccTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGCCCTTGATCGCATTGGCACTCAGCGCCGTCACGCTGGCCGTATTCAGcgccgcaagct < 2:952210/101‑6 (MQ=37)
gccTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTg > 1:3640733/1‑101 (MQ=255)
ccTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGCCCTTGATCGCATTGGCACTCAGCGCCGTCACGCTGGCCGTATTCAGCGCCGCAAGCTgc > 1:2004199/1‑101 (MQ=37)
cTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTgcg < 2:2873621/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTCCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTgcg > 2:64881/1‑101 (MQ=255)
tGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTgcgc > 1:2502967/1‑101 (MQ=255)
gcCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGt > 2:4378896/1‑101 (MQ=255)
ccGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTg > 2:3880636/1‑101 (MQ=255)
cgtcgtCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGc > 1:3031839/1‑101 (MQ=255)
cgtcgtCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGc > 2:486234/1‑101 (MQ=255)
gtcgtcAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCt > 1:2840947/1‑101 (MQ=255)
tcgtcAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTc < 2:68885/101‑1 (MQ=255)
tcgtcAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTc < 1:2207369/101‑1 (MQ=255)
cgtcAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCa > 1:3779551/1‑101 (MQ=255)
cgtcAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCa < 2:4192471/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAgcg < 2:112489/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAgcg > 2:2131196/1‑101 (MQ=255)
aGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAgcgc > 1:3332760/1‑101 (MQ=255)
gcgcCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGcgcc < 1:1318374/101‑1 (MQ=255)
ccACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGcgccgcc < 1:4007466/101‑1 (MQ=255)
gATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCt > 1:576900/1‑101 (MQ=255)
gATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGAGCCCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTTCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCt < 2:2519267/101‑1 (MQ=255)
aTGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTg < 2:1226531/101‑1 (MQ=255)
aTGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTg > 2:2582160/1‑101 (MQ=255)
tGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTGc > 2:3958104/1‑101 (MQ=255)
tGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGAACCGCCCCCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGCTCTCCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCtcc > 1:2751457/1‑99 (MQ=38)
gTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTGCa < 1:1784879/101‑1 (MQ=255)
gTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTGCa > 2:1747965/1‑101 (MQ=255)
cATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTGCAcc > 2:1003088/1‑101 (MQ=255)
cGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTGCACCGAg > 2:4356492/1‑101 (MQ=255)
cGGTCCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTGCACCGAg < 2:2009030/101‑1 (MQ=255)
ggTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTGCACCGAGc > 2:1585657/1‑101 (MQ=255)
ggTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTGCACCGAGc < 2:3406215/101‑1 (MQ=255)
ggTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTGCACCGAGc > 2:776302/1‑101 (MQ=255)
tGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTGCACCGAGCCa > 2:2176252/1‑101 (MQ=255)
ccAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTGCACCGAGCCAAg > 2:27554/1‑101 (MQ=255)
ccAAAGCCGCGGATCCCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTGCACCGAGCCAAg < 2:4211899/101‑1 (MQ=255)
aaaGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTGCACCGAGCCAAGcc > 1:3654916/1‑101 (MQ=255)
aaaGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTGCACCGAGCCAAGcc > 1:185118/1‑101 (MQ=255)
|
TCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCGCCTGCACCGAGCCAAGCCCG > NC_014034/681448‑681648
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 25 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|