New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_014034 221968 =709 (2.920)74 (0.310) 7/198 25.1 0.12 coding (689/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
?NC_014034 = 222119 335 (1.370)coding (538/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
Rejected: Position hash score below cutoff.

Only 100 of 1574 total aligned reads displayed.

GACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGG  >  NC_014034/221869‑222070
                                                                                                   |                                                                                                      
tcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                                                                       >  1:4663430‑M1/88‑101 (MQ=255)
 cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtggggtcc                                                                                                      <  1:635357‑M1/15‑1 (MQ=255)
         tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtc                                                                                              <  1:495672‑M1/23‑4 (MQ=255)
             aGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGGGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtggggtcggtc                                                                                          >  1:3037129/1‑101 (MQ=255)
                    ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccg                                                                                   <  1:3408830‑M1/34‑1 (MQ=255)
                      ggggttccgtgggatgggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                                                                                 >  1:2172996‑M1/66‑101 (MQ=255)
                       cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgg                                                                                <  2:2856757‑M1/37‑1 (MQ=255)
                        ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                                               <  2:649501‑M1/38‑1 (MQ=255)
                          atccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggat                                                                             <  2:2699550‑M1/40‑1 (MQ=255)
                          atccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggat                                                                             <  2:3785789‑M1/40‑1 (MQ=255)
                           tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatc                                                                            <  1:3616341‑M1/41‑1 (MQ=255)
                            ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                           >  1:3202518‑M1/60‑101 (MQ=255)
                             cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggggtcgg                                                                          <  1:4899009‑M1/43‑1 (MQ=255)
                              gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggt                                                                         <  1:3888642‑M1/44‑1 (MQ=255)
                              gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                         >  2:251537‑M1/58‑101 (MQ=255)
                              gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                         <  1:2568863‑M1/44‑1 (MQ=255)
                               tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                        >  1:1433877‑M1/57‑101 (MQ=255)
                               gcAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                        <  2:1656611/100‑1 (MQ=255)
                                    tccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                   <  1:4439255‑M1/50‑1 (MQ=255)
                                     cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                                  >  1:1834262‑M1/51‑101 (MQ=255)
                                       gCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                <  2:2191448/101‑1 (MQ=255)
                                           ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgggg                                                            <  1:4011809‑M1/57‑2 (MQ=255)
                                              ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTccgtggggtcc                                                         <  1:417754‑M1/60‑5 (MQ=255)
                                                 tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                      >  1:1007584‑M1/39‑101 (MQ=255)
                                                 tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGatcggtg                                                      <  2:4136778‑M1/63‑2 (MQ=255)
                                                 tgggatcggtccgatccgtgggatcggtcgtgtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                      >  2:841143‑M1/39‑101 (MQ=255)
                                                 tgggagcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                      >  1:4478601‑M1/39‑101 (MQ=255)
                                                 ggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                      >  1:763179‑M1/39‑101 (MQ=255)
                                                    gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCggg                                                   <  2:2978477‑M1/66‑1 (MQ=255)
                                                      tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                 >  1:4825269‑M1/34‑101 (MQ=255)
                                                          tcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                             >  1:505938‑M1/30‑101 (MQ=255)
                                                          cGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCggg                                             >  2:1027618/1‑99 (MQ=255)
                                                           gggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                            >  2:3460898/8‑99 (MQ=11)
                                                           cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                            <  1:2786304‑M1/73‑1 (MQ=255)
                                                            ggctccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                           >  1:2703996‑M1/28‑101 (MQ=255)
                                                              atccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                         <  1:576089‑M1/76‑1 (MQ=255)
                                                               tccgtgggatcggtcggggccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                        >  1:3149522‑M1/25‑101 (MQ=255)
                                                                ccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGgattg                                       <  1:171624‑M1/78‑3 (MQ=255)
                                                                ccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                       >  1:2274634‑M1/24‑101 (MQ=255)
                                                                ccggctgATGCGTCTGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                       <  2:4414395/95‑1 (MQ=11)
                                                                 cgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                      <  2:3524278‑M1/79‑1 (MQ=255)
                                                                  gtgagatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                     >  2:1275418‑M1/22‑101 (MQ=255)
                                                                  gggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggggtccgt                                     >  2:497394‑M1/22‑95 (MQ=255)
                                                                   tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                    >  2:557576‑M1/21‑101 (MQ=255)
                                                                   gcGGATCGGTCGGGTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                    <  2:3175577/100‑1 (MQ=11)
                                                                    gggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                   <  1:1654016‑M1/82‑1 (MQ=255)
                                                                         cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                              >  1:4281184‑M1/15‑101 (MQ=255)
                                                                         cggTGGGCTCGGTGGGATCCGTCGGGTCCGTTGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                              <  2:119583/99‑1 (MQ=14)
                                                                          ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                             <  1:691087‑M1/88‑1 (MQ=255)
                                                                           gTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg                            >  2:4804690/1‑100 (MQ=255)
                                                                           gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                            >  1:3708418/1‑101 (MQ=1)
                                                                             cggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                          <  1:1898878‑M1/91‑1 (MQ=255)
                                                                              gggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                         <  2:240992‑M1/92‑1 (MQ=255)
                                                                              gggtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGGGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCGGTggg                         >  2:3640827/7‑101 (MQ=11)
                                                                               ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgagGGATCGGCCGGGTCCGTGGGGTCCGAAGCCAACGTGGTATCGGACGGTTCGGTGGGa                        >  1:409787/9‑101 (MQ=2)
                                                                                cTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAACCGTGGGag                       >  2:923653/1‑100 (MQ=255)
                                                                                atccgtgggatcggtcgggtccgtgggttcggtcggatccgtgGGTTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCNGATCCGTGGGCTCGGCCGGCCCCGGGGGAt                       >  1:871304/8‑101 (MQ=11)
                                                                                 gccgggggatcggtcgggtccgggggatcggtgggggccgggGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                      <  1:2376503/95‑1 (MQ=11)
                                                                                  ccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                     <  2:2584961/93‑1 (MQ=11)
                                                                                   ggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                    >  1:247845/1‑101 (MQ=255)
                                                                                   cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                    <  1:2095988‑M1/97‑1 (MQ=255)
                                                                                    gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                   <  1:3491397‑M1/98‑1 (MQ=255)
                                                                                    gtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                   >  2:4028417‑M1/4‑101 (MQ=255)
                                                                                    gtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                   >  1:4734485/1‑101 (MQ=11)
                                                                                    gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgat                   <  2:4614259/101‑3 (MQ=255)
                                                                                    gtcggATCGGTCGGGTCCGCGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGCTCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGAtcggt                   >  1:936338/1‑101 (MQ=14)
                                                                                     tgggttcgttcgtgtccgtgttatcggtcgggtccgtcgtgCCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                  <  2:2282174/96‑1 (MQ=11)
                                                                                     tgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCTGGTCCGTGGGAtcggtc                  >  2:4536712/3‑101 (MQ=11)
                                                                                     tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                  >  1:1253057‑M1/3‑101 (MQ=255)
                                                                                     tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                  >  2:1098996‑M1/3‑101 (MQ=255)
                                                                                      gggatccgtcgggtccgtgggttcggtcgggtccgtgGGATCTGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                 <  2:3905938/100‑1 (MQ=11)
                                                                                      gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                 <  2:4729523‑M1/100‑1 (MQ=255)
                                                                                      cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                 >  1:1369424/1‑101 (MQ=255)
                                                                                       gggtcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggaTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                <  1:3527732/98‑1 (MQ=11)
                                                                                         gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggaTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGt              <  2:1843964/100‑1 (MQ=11)
                                                                                         atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGATCGGTGGGGTCCGTGgggc              >  2:2104037/1‑100 (MQ=11)
                                                                                          tcggtcgggtccctggggtccgtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc             <  2:1501795/101‑1 (MQ=14)
                                                                                          tcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc             <  1:4391925/101‑1 (MQ=11)
                                                                                          tcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc             <  1:3333373/101‑1 (MQ=11)
                                                                                           cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGGAGGGCACGTGGGATCTGTAGGGACAGTGCGATCTGTCGTGTcc            >  1:1529706/1‑101 (MQ=2)
                                                                                           cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATTGGTCGGGGTCGTGGGGTCGGGCGGGAcc            >  2:4320269/1‑101 (MQ=11)
                                                                                            ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGCCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGATGCGTGGGATGGGACGGGTGCg           >  2:4194990/1‑101 (MQ=11)
                                                                                            ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg           <  2:3077558/101‑1 (MQ=14)
                                                                                             gtcgggtccgtggtatcggtcgggtccgggggatccGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGt          <  2:2755405/101‑1 (MQ=11)
                                                                                             gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg          >  1:1060985/1‑100 (MQ=14)
                                                                                             gtcggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCgg          >  2:1944465/1‑100 (MQ=11)
                                                                                             gtcgcatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGt          >  2:3398868/7‑101 (MQ=11)
                                                                                               cggttccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg        >  1:2637944‑M2/1‑99 (MQ=255)
                                                                                               cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg        <  2:141250/101‑3 (MQ=11)
                                                                                               cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgggg        >  1:3775216/1‑98 (MQ=11)
                                                                                                gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTAGGTGGGGTCCGTGgg       >  2:3298188/1‑101 (MQ=11)
                                                                                                gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg       <  2:174852/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGCGGGGtcggtcggagacgcggg       >  2:3724092/1‑92 (MQ=14)
                                                                                                ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTGCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGgg       >  2:4451843/4‑101 (MQ=11)
                                                                                                 ggtccgtgggatcgggagagtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCAGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa      <  1:2005935/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                  gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGGTCGGTCGGGGCCGCGGGAt     >  2:747197/1‑101 (MQ=11)
                                                                                                  gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat     <  1:1178744‑M2/101‑6 (MQ=255)
                                                                                                  gtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTGCGTGgggg     >  2:4884648/1‑99 (MQ=11)
                                                                                                  gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat     >  1:2856970‑M2/1‑96 (MQ=255)
                                                                                                   tccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGCCGGGTCCGGGGGAtc    >  1:2952754/1‑101 (MQ=11)
                                                                                                   |                                                                                                      
GACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGG  >  NC_014034/221869‑222070

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 15 ≤  ATCG  < 23 ≤  ATCG  < 31 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG