New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_014034 221953 =245 (1.150)62 (0.290) 23/174 14.8 0.21 coding (704/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
?NC_014034 = 222128 215 (0.880)coding (529/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
Rejected: Position hash score below cutoff.

Only 100 of 302 total aligned reads displayed.

GGTTTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGT  >  NC_014034/221853‑222053
                                                                                                    |                                                                                                    
 gTTTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGGGTCGGATGCGTGGGCtcggt                                                                                                     >  1:2277324/1‑101 (MQ=255)
  tttCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCtcggtc                                                                                                    <  2:1024126/101‑1 (MQ=255)
  tttCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCtcggtc                                                                                                    <  1:3575717/101‑1 (MQ=255)
  tttCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCtcggtc                                                                                                    <  2:1485029/101‑1 (MQ=255)
    tCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCtcggtcgg                                                                                                  <  2:3711386/101‑1 (MQ=255)
    tCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCtcggtcgg                                                                                                  <  2:3244220/101‑1 (MQ=255)
     cGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCgga                                                                                                 <  2:2027219/101‑1 (MQ=255)
      gCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggat                                                                                                >  2:3533109/1‑101 (MQ=255)
      gCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggat                                                                                                <  1:2008377/101‑1 (MQ=255)
      cccGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggat                                                                                                <  1:1952837/100‑1 (MQ=255)
      cccGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggat                                                                                                <  2:1457259/100‑1 (MQ=255)
         ggTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcgg                                                                                             <  2:2743458/101‑1 (MQ=255)
         ggTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcgg                                                                                             >  2:4720356/1‑101 (MQ=255)
          gTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggt                                                                                            >  1:470096/1‑101 (MQ=255)
          gTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggt                                                                                            >  2:265517/1‑101 (MQ=255)
                gACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtc                                                                                      <  1:3367556/101‑1 (MQ=255)
                      gTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGGCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtggg                                                                                >  2:4163932/1‑101 (MQ=255)
                        cGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtggggt                                                                              >  1:1831086/1‑99 (MQ=255)
                         gCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                             <  2:4545162/101‑1 (MQ=255)
                           cGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                           >  2:1567890/1‑101 (MQ=255)
                           cGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                           <  2:2436925/101‑1 (MQ=255)
                             gggCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGGCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                         <  2:4418937/100‑1 (MQ=255)
                             aGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGGGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtggggtcggtc                                                                         >  1:3037129/1‑101 (MQ=255)
                               gCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                       <  1:88916/101‑1 (MQ=255)
                                   cGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                   >  1:4428982/1‑101 (MQ=255)
                                   cGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                   <  2:4503379/101‑1 (MQ=255)
                                    ggTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                                  <  2:2212775/101‑1 (MQ=255)
                                    ggTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                                  >  2:4841833/1‑101 (MQ=255)
                                      tgtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                                                                >  1:2454752/1‑101 (MQ=255)
                                      tgtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcggggccgtgggatcggtcggggccgtg                                                                >  2:4674213/1‑101 (MQ=255)
                                       ggtggtggTCAGCGTCGCCGGAGCGGGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGgatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                                               <  2:4060823/99‑1 (MQ=255)
                                          ggtggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                            >  1:3175828/1‑101 (MQ=255)
                                            tggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                          <  1:707563/101‑1 (MQ=255)
                                             ggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGAGGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                         <  1:2083003/101‑1 (MQ=255)
                                               gcAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                       <  2:1656611/100‑1 (MQ=255)
                                                cAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcg                                                      >  2:2802623/1‑101 (MQ=255)
                                                cAGCGTCCCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGgggccgtgggatcggggggggccgtgggagcggtcg                                                      >  2:2900789/1‑101 (MQ=255)
                                                 aGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                     >  1:4614581/1‑101 (MQ=255)
                                                   cGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                   >  1:1030726/1‑101 (MQ=255)
                                                      cGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                >  1:2898827/1‑101 (MQ=255)
                                                        ccGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGAGCCggg                                              >  2:4345220/1‑99 (MQ=255)
                                                        ccGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                              <  2:246353/101‑1 (MQ=255)
                                                             tCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                         <  1:4821728/101‑1 (MQ=255)
                                                              cgcgCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGCGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCTGCGGGTCCGTCGGAccg                                        >  2:858960/1‑101 (MQ=25)
                                                                  cTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                    <  1:1433662/101‑1 (MQ=255)
                                                                    cATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGGCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCggg                                  >  1:265492/1‑101 (MQ=255)
                                                                     aTCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCgggg                                 >  2:3653711/1‑100 (MQ=255)
                                                                      tCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                <  2:2158529/101‑1 (MQ=255)
                                                                       cGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                               >  2:4447330/1‑101 (MQ=255)
                                                                       cGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                               >  1:2565137/1‑101 (MQ=255)
                                                                           gggggcggTCGGTTCCGTGGGGTCGGGGGGGTCGGTGGGGTCGGTGGGATCGGTGGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                           <  2:1831133/94‑3 (MQ=2)
                                                                             tGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTgcat                         >  1:1523878/1‑98 (MQ=255)
                                                                               tcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtc                       <  1:435763/98‑1 (MQ=11)
                                                                                tggTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                      <  2:2316827/99‑1 (MQ=11)
                                                                                gCGTCGGATGCGTGGGCTGGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                      <  2:3410818/101‑1 (MQ=255)
                                                                                  gTCGGATGCGTGGGCTGGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                    <  2:3318434/101‑1 (MQ=255)
                                                                                  gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                    >  1:2181092/1‑101 (MQ=255)
                                                                                     ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggtcgg                 >  2:1120016/1‑101 (MQ=255)
                                                                                        tcggtgtccTCGGTGGGCTCGGTCGTGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc              <  2:1047287/93‑1 (MQ=11)
                                                                                        tccGTGGGGCCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATc              <  2:3056770/99‑1 (MQ=14)
                                                                                        tccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc              <  1:3242147/99‑1 (MQ=11)
                                                                                         gCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc             <  1:2790637/101‑1 (MQ=255)
                                                                                         cggtcgttccggtgggATCGGTCGGGCCCTTGGGATCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc             <  2:748397/92‑1 (MQ=11)
                                                                                         cggtcggCTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGTTCGGGTcc             <  2:3994722/96‑1 (MQ=11)
                                                                                         cggTGGGGTCGGGGGGATGGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc             <  1:76494/99‑1 (MQ=11)
                                                                                         cggTGGGCTCGGTGGGATCCGTCGGGTCCGTTGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc             <  2:119583/99‑1 (MQ=14)
                                                                                          cctGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg            <  1:627537/99‑1 (MQ=255)
                                                                                          cGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg            <  1:503679/101‑1 (MQ=255)
                                                                                           gTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt           >  1:3498206/1‑101 (MQ=255)
                                                                                           gTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCgg           >  1:413556/1‑100 (MQ=255)
                                                                                           gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt           >  2:546907/1‑101 (MQ=11)
                                                                                           gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt           >  1:3708418/1‑101 (MQ=1)
                                                                                            tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTg          >  2:192723/1‑101 (MQ=255)
                                                                                              ggatcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGTcgg        >  1:1844097/4‑101 (MQ=1)
                                                                                              ggatcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg        >  1:2108416/4‑101 (MQ=1)
                                                                                               ggtcggtgggGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa       <  2:4242133/99‑1 (MQ=11)
                                                                                               gCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa       <  2:3198814/101‑1 (MQ=255)
                                                                                                gtcggtgggCTCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt      <  2:1719598/100‑1 (MQ=11)
                                                                                                gtccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt      <  1:546986/97‑1 (MQ=11)
                                                                                                gtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAt      >  1:4299175/5‑101 (MQ=11)
                                                                                                cTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt      <  1:169133/101‑1 (MQ=255)
                                                                                                atcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt      <  1:3752871/100‑1 (MQ=11)
                                                                                                atcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt      <  2:626457/100‑1 (MQ=11)
                                                                                                 tcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc     >  2:3501785/1‑101 (MQ=11)
                                                                                                 tccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc     <  2:5005106/98‑1 (MQ=11)
                                                                                                  gggtgggATGGGTCGGATCCGGGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg    <  1:1217022/100‑1 (MQ=11)
                                                                                                  cggtcggGTCGGTCGGCTCCGCGGGGTCGGTCGTGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcc    <  2:3134882/101‑2 (MQ=11)
                                                                                                  cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtcc    <  2:385623/101‑2 (MQ=14)
                                                                                                  cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTGGGATCGGCCGGATCCGGGGGAtcg    >  1:3878873/1‑101 (MQ=255)
                                                                                                  ccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTGGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGGCCGGTGGGAtcg    >  1:4452698/3‑101 (MQ=11)
                                                                                                  ccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg    <  2:879520/99‑1 (MQ=11)
                                                                                                   ggtcggGTGGGTCTGGTCCTTTCGAGCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg   <  2:940448/101‑1 (MQ=14)
                                                                                                   ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtcgg   >  1:4327192/1‑101 (MQ=11)
                                                                                                   cgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACGGTGGGAtcg  >  2:477159/2‑100 (MQ=11)
                                                                                                    gtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt  >  1:4757247/1‑101 (MQ=11)
                                                                                                    gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtgggg  >  1:274605/1‑100 (MQ=11)
                                                                                                    gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt  <  1:3025423/101‑1 (MQ=255)
                                                                                                    gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt  >  1:665444/1‑101 (MQ=255)
                                                                                                    gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgat  <  2:4614259/101‑3 (MQ=255)
                                                                                                    gtcggATCGGTCGGGTCCGCGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGCTCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGAtcggt  >  1:936338/1‑101 (MQ=14)
                                                                                                    |                                                                                                    
GGTTTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGT  >  NC_014034/221853‑222053

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 15 ≤  ATCG  < 23 ≤  ATCG  < 31 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG