New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_014034 221968 =614 (3.220)54 (0.280) 26/180 15.4 0.09 coding (689/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
?NC_014034 = 222083 466 (2.200)coding (574/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
Rejected: Position hash score below cutoff.

Only 100 of 1407 total aligned reads displayed.

CGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATC  >  NC_014034/221868‑222068
                                                                                                    |                                                                                                    
gtcggtcgcgtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                                                                                                      >  2:3284657‑M1/89‑101 (MQ=255)
  cggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                                                    <  1:1236652‑M1/15‑1 (MQ=255)
   ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccg                                                                                                   <  2:4232343‑M1/16‑1 (MQ=255)
    gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt                                                                                                  <  1:2713919‑M1/17‑1 (MQ=255)
     tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                                                                                                 <  1:358068‑M1/18‑1 (MQ=255)
      cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgg                                                                                                <  1:51531‑M1/19‑1 (MQ=255)
      cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                                                                                <  1:1883820‑M1/19‑1 (MQ=255)
         cGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggat                                                                                             <  2:125353/101‑1 (MQ=255)
           ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaccggtcgggtccgtggggtcg                                                                                           <  2:3777439‑M1/24‑1 (MQ=255)
           ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtgggggccgtgggatcg                                                                                           <  2:3682664‑M1/24‑1 (MQ=255)
             gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                                                                                         >  1:3629337‑M1/76‑101 (MQ=255)
                ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                                      <  2:597445‑M1/29‑1 (MQ=255)
                 gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtgggatcggtcggg                                                                                     <  1:1454029‑M1/30‑1 (MQ=255)
                  atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcgggg                                                                                    <  2:3860829‑M1/31‑2 (MQ=255)
                  atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggat                                                                                    <  1:2512305‑M1/31‑3 (MQ=255)
                     ggTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                                                 >  2:1388500/1‑101 (MQ=255)
                              cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                        <  1:3366556‑M1/43‑1 (MQ=255)
                              cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgg                                                                        <  1:3214136‑M1/43‑1 (MQ=255)
                               gtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                       >  2:3553307/1‑101 (MQ=255)
                               gagggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                       <  1:3517480‑M1/44‑1 (MQ=255)
                                tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc                                                                      >  1:3406698‑M1/57‑101 (MQ=255)
                                 cAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                                     <  2:2646024/101‑1 (MQ=255)
                                   ggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGa                                                                   <  1:1607099‑M1/48‑1 (MQ=255)
                                   gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGa                                                                   >  1:435040‑M1/54‑101 (MQ=255)
                                      cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtcg                                                                <  2:2743653‑M1/51‑2 (MQ=255)
                                        gtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                              <  1:2307709‑M1/53‑1 (MQ=255)
                                         tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTg                                                             <  2:3114676‑M1/54‑1 (MQ=255)
                                          cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                            <  1:2846248‑M1/55‑1 (MQ=255)
                                          cgggtccgtgggatcggtcggatcggtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                            >  2:2494034‑M1/47‑101 (MQ=255)
                                            ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                          <  1:1005158‑M1/57‑1 (MQ=255)
                                            ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgggt                                                          <  1:1941562‑M1/57‑2 (MQ=255)
                                            gatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                          <  1:726117‑M1/57‑1 (MQ=255)
                                             ggccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                         >  1:3831136‑M1/44‑101 (MQ=255)
                                                 gtgggatcggtcggttccgtgggctccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                     >  2:3404390‑M1/40‑101 (MQ=255)
                                                 gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                     <  1:583440‑M1/62‑1 (MQ=255)
                                                   gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                   <  2:1069481‑M1/64‑1 (MQ=255)
                                                   gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                   <  1:236280‑M1/64‑1 (MQ=255)
                                                        cggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                              <  1:114800‑M1/69‑1 (MQ=255)
                                                        cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                              <  1:643290‑M1/69‑1 (MQ=255)
                                                        cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                              >  1:2225348‑M1/33‑101 (MQ=255)
                                                        ccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                              >  1:2758927‑M1/33‑101 (MQ=255)
                                                          gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                            <  1:959983‑M1/71‑1 (MQ=255)
                                                            cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                          <  1:4044190‑M1/73‑1 (MQ=255)
                                                               gtcggtggtatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                       >  2:2906751‑M1/26‑101 (MQ=255)
                                                                  ggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtccg                                    >  2:2213199/2‑99 (MQ=11)
                                                                  cgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtcgg                                    <  1:4131656‑M1/79‑1 (MQ=255)
                                                                     gggatctgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                 >  2:3213897‑M1/20‑101 (MQ=255)
                                                                       gatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggtcggg                               <  2:2400988‑M1/84‑2 (MQ=255)
                                                                          tcGTGGGCGCGGTCGGATGTGGGGGGTGCGTGGTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                            <  1:1813002/100‑1 (MQ=14)
                                                                          cggtcgggtcggtcggGTCAGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCTGTCGGTTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                            <  2:1188742/93‑1 (MQ=11)
                                                                          cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                            >  1:2421040‑M1/15‑101 (MQ=255)
                                                                           ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGAGCCg                           <  2:1329742‑M1/88‑1 (MQ=255)
                                                                            gTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                          <  1:3466737/101‑1 (MQ=255)
                                                                              cgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                        >  2:1577195‑M1/11‑101 (MQ=255)
                                                                               gggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                       <  1:1527217‑M1/92‑1 (MQ=255)
                                                                                gatcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTCGGa                      >  1:3679956/3‑101 (MQ=11)
                                                                                  tccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                    >  2:101109‑M1/7‑101 (MQ=255)
                                                                                   cctttggatcggtcggctccgttgaatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                   <  2:1928788/96‑1 (MQ=11)
                                                                                   ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                   >  1:29650‑M1/6‑101 (MQ=255)
                                                                                    cgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcgg                  >  1:3132724/11‑101 (MQ=11)
                                                                                    cgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                  >  2:2273619‑M1/5‑101 (MQ=255)
                                                                                     gtggtctcgggcggatccgtggtatgggtcgggcccgtgggaTCAGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                 <  2:2125512/95‑1 (MQ=11)
                                                                                     ggcggCTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGCGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                 <  1:904675/99‑1 (MQ=11)
                                                                                      tggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCTGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                <  1:2579527/96‑1 (MQ=14)
                                                                                      ggGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                >  2:4011815‑M1/3‑101 (MQ=255)
                                                                                       gggatggggcgggcccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg               <  1:209230/100‑1 (MQ=11)
                                                                                        gggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtcgg              >  1:2905311/7‑101 (MQ=14)
                                                                                        ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTCGGATCCGAGAGAacggccgg              >  2:2336746/1‑101 (MQ=11)
                                                                                        ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtccg              <  2:2846029/101‑3 (MQ=11)
                                                                                         ggtcgatcggagccgtgggaccggtcgggtccgtgggaCCGTGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgga             <  2:2582515/99‑2 (MQ=11)
                                                                                         gatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcgga             <  1:1371767/101‑2 (MQ=11)
                                                                                          gtgggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt            <  1:214135/98‑1 (MQ=11)
                                                                                          atcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGCCGGGt            >  2:817408/1‑101 (MQ=11)
                                                                                           tcggtgggatccgt.ggatcggtcgggtccgtggggtCGGTCGGGGCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGACGGTCGGGTCCGGGGGGTCGGTCGGGttc          >  2:4104425/1‑99 (MQ=2)
                                                                                           tcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc           <  2:1681962/101‑1 (MQ=11)
                                                                                           tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc           >  2:1785381/1‑101 (MQ=14)
                                                                                           tccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCggggc           >  2:528007/4‑99 (MQ=14)
                                                                                            cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGGGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc          >  1:816465/1‑101 (MQ=11)
                                                                                            cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGGcc          >  1:2631777/1‑101 (MQ=11)
                                                                                            cgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc          <  1:1316212/101‑1 (MQ=11)
                                                                                             ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGTTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg         >  1:3884598/1‑101 (MQ=14)
                                                                                             ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggctCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCGGCGTGGTCGGTCGGATCCGTGGGCtcgcggggcgcgg         >  2:741676/1‑91 (MQ=9)
                                                                                              gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCgg        >  2:362533/1‑100 (MQ=14)
                                                                                              gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGt        >  1:1751030/1‑101 (MQ=14)
                                                                                              gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt        >  1:3073678/1‑101 (MQ=11)
                                                                                               tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg       >  2:654820‑M2/1‑100 (MQ=255)
                                                                                               tcggggccgtgggatcggtcggggccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg       <  1:203595/101‑2 (MQ=11)
                                                                                               gcgggtccgtcggatcggtcggggccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg       <  1:3764921/100‑2 (MQ=11)
                                                                                                cgggtccgtgggatcggtcggttccgtgggatcggtCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGtgg      <  2:2964316/101‑3 (MQ=11)
                                                                                                cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATAGGTCGGATCCGtgg      >  2:3939404/1‑99 (MQ=14)
                                                                                                cgcgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg      <  2:306147/98‑3 (MQ=11)
                                                                                                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg     >  2:1869665/1‑101 (MQ=11)
                                                                                                 ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGGGGGGTCGGTCGGGTCCGTGgg     >  2:91787/4‑101 (MQ=11)
                                                                                                  ggtccgtggggtcggtcgggtgcgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa    <  2:2051682/101‑1 (MQ=14)
                                                                                                   gtctgttggatcgttctggtccgtttggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtggtat   <  2:3470222/101‑6 (MQ=11)
                                                                                                   gtccgtgggctggggcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt   <  1:3959951/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                   gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAt   >  1:1055777/1‑101 (MQ=14)
                                                                                                   gtccgtgagatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt   <  1:1679235/101‑1 (MQ=14)
                                                                                                    tccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATTCGTGGGATCGGCCGGATTCGTGGGGTCGGTCGGGTTCGTGggttt  >  1:3282285/1‑98 (MQ=14)
                                                                                                    tccgtgggagcggtcggggccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc  <  2:1500308/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                    |                                                                                                    
CGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATC  >  NC_014034/221868‑222068

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 15 ≤  ATCG  < 23 ≤  ATCG  < 31 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG