BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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Rejected: Position hash score below cutoff.

Only 100 of 207 total aligned reads displayed.


CGGTCGAGCCGGTTTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCG  >  NC_014034/221843‑222043


cGGTCGAGCCGGTTTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGc                                                                                                      >  1:2176914/1‑101 (MQ=255)


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    cGAGCCGGTTTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTgg                                                                                                  >  1:3094738/1‑101 (MQ=255)


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      aGCGGGTTGCGCCGGGGCCCGACACCGTCGTCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCCCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGc                                                                                                <  2:2860425/101‑1 (MQ=255)


      aGCCGGTTTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGNGCGTCGGATGCGTGGGc                                                                                                >  2:558981/1‑101 (MQ=255)


      aGCAGGTTTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGc                                                                                                >  2:3585375/1‑101 (MQ=255)


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                                                           aGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGgtccgtggggtcggtcgggtccgggggatcgggcgg                                           >  2:860262/1‑101 (MQ=255)


                                                              gTCGCCGGATCGCCCTCATCGACGGTGGGCGTCTGATGCGTGGGCCCGGTCGGCTCGGCGGGGACCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGCCCGGTGGGGTc                                        >  2:2105700/1‑101 (MQ=255)


                                                                cGCCGGATCGCGCTCATCGAGGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                      <  2:730205/101‑1 (MQ=255)


                                                                 gCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                     <  2:3077253/101‑1 (MQ=255)


                                                                 gCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                     >  1:3491539/1‑101 (MQ=255)


                                                                 gCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                     >  2:1317439/1‑101 (MQ=255)


                                                                 gCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCCGCTCGGTCGGGGCCGTGGGACCGGGCGGGTCCGGGGGGTCGGTCGGATCCGt                                     >  1:1079973/1‑101 (MQ=255)


                                                                   cGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                   >  2:2450178/1‑101 (MQ=255)


                                                                     gATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                 <  2:3959292/101‑1 (MQ=255)


                                                                       tCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGTCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                               <  2:1326219/101‑1 (MQ=255)


                                                                         gcgcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                             <  1:2452504/101‑1 (MQ=255)


                                                                          cgcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                            >  2:1913818/1‑101 (MQ=255)


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                                                                            cTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                          >  2:1564479/1‑101 (MQ=255)


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                                                                                tCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggggc                      >  2:3735724/1‑99 (MQ=255)


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                                                                                   aCGGTGGGAGTCGGCTGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGCCGGGTGCGTGGGACCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCTTGGGACAGTCCGGGTCCgg                   >  2:3133310/1‑100 (MQ=18)


                                                                                    cGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                  <  1:3130509/101‑1 (MQ=255)


                                                                                    cGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                  >  1:3625768/1‑101 (MQ=255)


                                                                                    cGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                  <  1:1815927/101‑1 (MQ=255)


                                                                                      gTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                >  1:2962715/1‑101 (MQ=255)


                                                                                        gggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGGCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt              <  2:745005/101‑1 (MQ=255)


                                                                                         ggggTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc             >  1:2413805/4‑101 (MQ=255)


                                                                                         ggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc             <  1:2052160/101‑1 (MQ=255)


                                                                                         ggCGTCAGATGCGGGGGCTCGGTCGGATCGGGCGGGGGCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc             <  1:2105838/101‑1 (MQ=18)


                                                                                          ccGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGGTCGCGGGAtgg            >  2:3840682/2‑99 (MQ=1)


                                                                                           ggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtccg           >  2:2213199/2‑99 (MQ=11)


                                                                                            gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt          >  1:1434621/1‑101 (MQ=255)


                                                                                            gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt          <  1:2042472/101‑1 (MQ=255)


                                                                                            gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt          >  1:413635/1‑101 (MQ=255)


                                                                                             tCGGGTCCGTGGGCTCGGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtccgtg         <  1:868695/101‑2 (MQ=11)


                                                                                              cGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg        >  2:3471668/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                gATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGa      >  2:1221572/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                 atccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCGGTGGGAtcggcggggt     >  1:1313022/4‑95 (MQ=14)


                                                                                                  tGCGTGGGCTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc    <  2:2519909/101‑1 (MQ=255)


                                                                                                   gCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc   <  2:3257619/101‑1 (MQ=255)


                                                                                                   gCGTCGGCTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc   <  2:1789165/101‑1 (MQ=14)


                                                                                                   ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc   <  1:2990604/100‑1 (MQ=1)


                                                                                                   ccGTGCGATCGGTCGCATTCGTGGGGTCCATCCGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATcg   <  2:2606316/100‑2 (MQ=14)


                                                                                                    cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg  <  2:330468/101‑1 (MQ=11)


CGGTCGAGCCGGTTTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCG  >  NC_014034/221843‑222043

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 17 ≤


ATCG

< 24 ≤


ATCG

< 33 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG