New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_014034 221953 =245 (1.130)30 (0.140) 35/192 15.1 0.09 coding (704/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
?NC_014034 = 222101 377 (1.670)coding (556/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
Rejected: Position hash score below cutoff.

Only 100 of 286 total aligned reads displayed.

GGTTTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGT  >  NC_014034/221853‑222053
                                                                                                    |                                                                                                    
ggTTTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCtcgg                                                                                                      >  2:3382063/1‑101 (MQ=255)
    tCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCtcggtcgg                                                                                                  <  2:3868947/101‑1 (MQ=255)
    tCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCAACGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCtcggtcgg                                                                                                  <  1:4098587/101‑1 (MQ=255)
     cGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCgga                                                                                                 <  1:3141272/101‑1 (MQ=255)
     cGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTGCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCgga                                                                                                 <  1:3169516/101‑1 (MQ=255)
      gCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggat                                                                                                <  2:3095386/101‑1 (MQ=255)
      gCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGCGTTGGGGGTCAGCGTCGCCGGATCCCGCTCATCGACGGTGGGCGGCGGATGCGTGGGCtcggtcggtc                                                                                                >  1:3734544/1‑99 (MQ=255)
         ggTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcgg                                                                                             <  1:3406758/101‑1 (MQ=255)
          gTGCCCGACCCCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggt                                                                                            <  2:3640435/101‑1 (MQ=255)
             cccGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgg                                                                                         >  1:2323019/1‑101 (MQ=255)
                 acacCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtcc                                                                                     >  2:1717864/1‑101 (MQ=255)
                  cacCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccg                                                                                    <  2:3812482/101‑1 (MQ=255)
                   acCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgg                                                                                   >  1:3507360/1‑100 (MQ=255)
                   acCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgg                                                                                   >  2:3571311/1‑100 (MQ=255)
                    ccGTCTCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtg                                                                                  <  2:144848/101‑1 (MQ=255)
                    ccGTCGCGGAGGTGTCGGTGGTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGGCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtg                                                                                  <  2:881120/101‑1 (MQ=255)
                    ccGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtg                                                                                  <  2:2954613/101‑1 (MQ=255)
                            gAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                          >  2:1160995/1‑101 (MQ=255)
                              ggCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                                        <  2:1576670/101‑1 (MQ=255)
                               gCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                       >  2:4380582/1‑101 (MQ=255)
                                cTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                                                                      >  1:2794425/1‑101 (MQ=255)
                                cTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgggggatcggtcggg                                                                      >  2:2400617/1‑101 (MQ=255)
                                  tCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                                    >  1:221183/1‑101 (MQ=255)
                                   cGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                   >  1:2717931/1‑101 (MQ=255)
                                    ggTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                                  >  1:4228742/1‑101 (MQ=255)
                                    ggTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcggggccgtgggatcggtcgggcccg                                                                  >  1:1323444/1‑101 (MQ=255)
                                      tgtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                                                                <  1:3245833/101‑1 (MQ=255)
                                       gtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGgatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                                               >  1:2435846/1‑101 (MQ=255)
                                        ttGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                              <  1:2250892/101‑1 (MQ=255)
                                          ggtggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                            <  1:1735420/101‑1 (MQ=255)
                                           ggggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                                           <  2:3416810/99‑1 (MQ=255)
                                             ggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                         <  2:2331178/101‑1 (MQ=255)
                                             ggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                         >  1:501825/1‑101 (MQ=255)
                                               tCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                       <  2:1043157/101‑1 (MQ=255)
                                               tCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                       >  2:1115933/1‑101 (MQ=255)
                                                 aGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGccgggtccgtgggctcggtcgggtccgcgggatcggcggg                                                     >  2:2652984/1‑97 (MQ=255)
                                                 aGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtggg                                                     >  2:3927896/1‑101 (MQ=255)
                                                  gCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGa                                                    <  2:416416/101‑1 (MQ=255)
                                                   cGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAt                                                   >  2:3217367/1‑101 (MQ=255)
                                                      cGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGCTCCg                                                >  1:440372/1‑101 (MQ=255)
                                                           ggtCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                           <  1:1053284/99‑1 (MQ=255)
                                                               gcgcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                       <  2:2550190/101‑1 (MQ=255)
                                                                ggcTCATGGGCGGTGGGCGGCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                      <  1:1279094/100‑1 (MQ=255)
                                                                 gcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                     >  2:1788020/1‑101 (MQ=255)
                                                                 gcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                     <  2:4336675/101‑1 (MQ=255)
                                                                  cTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                    >  2:1555913/1‑101 (MQ=255)
                                                                    cATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTTGGATCCGCGGGATCGGTGggg                                  >  1:54564/1‑101 (MQ=255)
                                                                     aTCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                 <  1:1586585/101‑1 (MQ=255)
                                                                      tCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                <  1:2122477/101‑1 (MQ=255)
                                                                        gACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                              >  2:3154343/1‑101 (MQ=255)
                                                                         aCGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                             <  1:3874441/101‑1 (MQ=255)
                                                                          cGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGtcgggcggcgcccgg                            >  2:784879/1‑94 (MQ=21)
                                                                           gggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGtcg                           >  1:734787/8‑99 (MQ=11)
                                                                            gTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                          >  1:986648/1‑101 (MQ=255)
                                                                            gTGGGCGGCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                          <  2:2322869/101‑1 (MQ=255)
                                                                               tcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtc                       <  1:4164851/98‑1 (MQ=1)
                                                                               ggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATAGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtg                       >  1:3971212/1‑100 (MQ=255)
                                                                                tggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtcc                      <  1:4118884/99‑2 (MQ=11)
                                                                                gCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                      <  1:3382300/101‑1 (MQ=255)
                                                                                gCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                      >  1:237556/1‑101 (MQ=255)
                                                                                  gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                    <  2:2047280/101‑1 (MQ=255)
                                                                                   ttcgttccGTTGGGTCCGTCGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCTTTGCATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtccgtg                   <  2:215016/94‑2 (MQ=18)
                                                                                   tCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGGCCGTGGGGCCGGCGCGGTCCCGGCGAtcggtc                   >  2:839387/1‑101 (MQ=11)
                                                                                    cGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                  <  2:3296059/101‑1 (MQ=255)
                                                                                     ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                 >  2:2812592/1‑101 (MQ=255)
                                                                                     ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                 >  1:1863547/1‑101 (MQ=255)
                                                                                      gATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGa                >  1:3115316/1‑101 (MQ=255)
                                                                                       atccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcggtcgggt               >  2:4072354/4‑99 (MQ=11)
                                                                                          cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg            <  2:1862255/101‑1 (MQ=11)
                                                                                          cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg            >  2:1387222/1‑101 (MQ=1)
                                                                                           gTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt           <  2:4057471/101‑1 (MQ=255)
                                                                                           gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcgggggggaccgt           >  2:450755/1‑91 (MQ=11)
                                                                                           gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGAGGGTCCgg           >  2:3723882/1‑100 (MQ=14)
                                                                                            tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg          >  1:1807487/1‑101 (MQ=255)
                                                                                            tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg          <  1:1397394/101‑1 (MQ=255)
                                                                                            tGGGCTCGGTCGGATCGGACGGGCCCGTGGGATCGGACGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCggg          >  2:246925/1‑99 (MQ=17)
                                                                                            tGGGCGCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg          <  2:1807368/101‑1 (MQ=255)
                                                                                            tGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg          >  2:4035154/1‑101 (MQ=11)
                                                                                             gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg         <  2:1974226/101‑3 (MQ=11)
                                                                                             cgtgtccgtccgATCGGTCGGCTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTCGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTgg         <  2:4311998/94‑1 (MQ=11)
                                                                                              ggatcggtgggGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTggg        <  2:4103545/98‑1 (MQ=11)
                                                                                              ggCTCGGTCGGAGCCGTTGCGTCCGTGGGATCGGTCGCGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgg        <  2:2844672/101‑1 (MQ=17)
                                                                                                gtcggtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt      <  1:800861/100‑1 (MQ=11)
                                                                                                gtcagtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGAt      >  2:918091/5‑101 (MQ=11)
                                                                                                ggccgtcgcACCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt      <  2:1288895/97‑1 (MQ=11)
                                                                                                atccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCAGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGAt      <  1:3682232/97‑1 (MQ=11)
                                                                                                  cggtgggGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcg    <  2:3044139/101‑1 (MQ=14)
                                                                                                  cggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGGCCGTGGGAtcg    >  1:847279/1‑101 (MQ=11)
                                                                                                  cggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCCGGTCCGTCGGAtcg    <  2:2703505/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                  cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg    >  2:3434638/1‑101 (MQ=255)
                                                                                                  cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGNCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg    <  1:1028071/101‑1 (MQ=255)
                                                                                                  ccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGCGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtag    >  2:2742604/3‑99 (MQ=11)
                                                                                                  cagtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg    <  2:694324/99‑1 (MQ=14)
                                                                                                   ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg   >  1:3028697/1‑101 (MQ=11)
                                                                                                   ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCCGGTCCGTCGGAtcgg   <  1:3749405/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                   cgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg   <  1:1999200/100‑1 (MQ=11)
                                                                                                    gtcggGTCGGGGGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt  <  1:2052559/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                    gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt  >  1:4356727/1‑101 (MQ=255)
                                                                                                    gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt  >  1:3536027/1‑101 (MQ=255)
                                                                                                    gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt  <  1:2633904/101‑1 (MQ=255)
                                                                                                    |                                                                                                    
GGTTTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGT  >  NC_014034/221853‑222053

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 15 ≤  ATCG  < 23 ≤  ATCG  < 31 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG