New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_014034 | = 3317647 | 300 (1.340) | 2 (0.010) | 2/198 | 36.0 | 0.01 | intergenic (+64/‑86) | RCAP_rcc03121/RCAP_rcc03122 | hypothetical protein/FRG domain‑containing protein |
? | NC_014034 | = 3317659 | 296 (1.310) | intergenic (+76/‑74) | RCAP_rcc03121/RCAP_rcc03122 | hypothetical protein/FRG domain‑containing protein | |||||
Rejected: Position hash score below cutoff. |
Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
ATATGTGCATGCGAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGAATACACCTCACCTCAGACTTGAAGCAACCCCGATTGCATGTTATTTTTTTGC > NC_014034/3317547‑3317747
|
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atatGTGCATGCGAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACAttt < 2:4254614/101‑1 (MQ=255)
atatGTGCATGCGAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACAttt > 2:29870/1‑101 (MQ=255)
atatGTGCATGCGAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACAttt < 1:4004408/101‑1 (MQ=255)
atGTGCATGCGAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCa < 1:29883/101‑1 (MQ=255)
atGTGCATGCGAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCa > 1:1331436/1‑101 (MQ=255)
atGTGCATGCGAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCa < 2:2867791/101‑1 (MQ=255)
atGTGCATGCGAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCa < 2:1484269/101‑1 (MQ=255)
tgtgCATGCGAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCaa > 1:3318271/1‑101 (MQ=255)
gtgCATGCGAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAAc > 2:408583/1‑101 (MQ=255)
gtgCATGCGAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAAc > 1:4128608/1‑101 (MQ=255)
gtgCATGCGAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAAc < 2:1545295/101‑1 (MQ=255)
tgCATGCGAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACt < 1:1440671/101‑1 (MQ=255)
gCATGCGAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACtt > 1:2301714/1‑101 (MQ=255)
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aTGCGAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTaa < 2:619630/101‑1 (MQ=255)
ggCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAACGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTtaat < 1:3806075/101‑1 (MQ=255)
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cGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTtaataa < 2:87097/101‑1 (MQ=255)
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gTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATaaa > 1:2873426/1‑101 (MQ=255)
gTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAACaaa < 2:3769869/101‑1 (MQ=255)
tGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAg > 1:3365401/1‑101 (MQ=255)
gCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAgg > 1:4363574/1‑101 (MQ=255)
aaaTGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGta > 2:3151892/1‑101 (MQ=255)
aaTGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGtat < 2:459012/101‑1 (MQ=255)
ccAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAAt < 1:3152116/101‑1 (MQ=255)
ccAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAAt < 1:2245198/101‑1 (MQ=255)
cAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAAtt < 2:1319302/101‑1 (MQ=255)
cAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAAtt < 2:2301569/101‑1 (MQ=255)
aaCGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAAttt < 1:3946576/101‑1 (MQ=255)
gcgTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTtata > 1:4049111/1‑101 (MQ=255)
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gTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATAcc > 1:1703876/1‑101 (MQ=255)
gTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATAcc > 2:2112037/1‑101 (MQ=255)
aaGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTc < 1:1472471/101‑1 (MQ=255)
gCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCaa < 1:3876094/101‑1 (MQ=255)
cAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCaaa < 1:2087449/101‑1 (MQ=255)
cAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCaaa > 1:4338347/1‑101 (MQ=255)
aaaCGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATATTTCAAAg > 2:1019444/1‑101 (MQ=255)
aaaCGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAg > 2:2652941/1‑101 (MQ=255)
aaaCGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAg < 2:645086/101‑1 (MQ=255)
aaCGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGc < 1:2359831/101‑1 (MQ=255)
aaCGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGc > 2:1103665/1‑101 (MQ=255)
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gacgCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAAt < 2:1642418/101‑1 (MQ=255)
gCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAAc > 2:3978408/1‑101 (MQ=255)
cccTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACg < 1:2955624/101‑1 (MQ=255)
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cTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGaa > 1:1051179/1‑101 (MQ=255)
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cTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGaa < 2:2247030/101‑1 (MQ=255)
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tCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGAATACACCTCACCTCAGACTTGAAGCAAc > 2:4378948/1‑101 (MQ=255)
ttttCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGAATACACCTCACCTCAGACTTGAAGCAAcccc < 1:502538/101‑1 (MQ=255)
ttttCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGAATACACCTCACCTCAGACTTGAAGCAAcccc < 2:3438191/101‑1 (MQ=255)
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aaaaGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGAATACACCTCACCTCAGACTTGAAGCAACCCCGATTGCAt > 1:1909164/1‑101 (MQ=255)
aaaGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGAATACACCTCACCTCAGACTTGAAGCAACCCCGATTGCATg > 1:1502406/1‑101 (MQ=255)
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tttCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGAATACACCTCACCTCAGACTTGAAGCAACCCCGATTGCATGTTAttttttt > 1:3460888/1‑101 (MQ=255)
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ttCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGAATACACCTCACCTCAGACTTGAAGCAACCCCGATTGCATGTTATTTTTTTg > 1:610070/1‑101 (MQ=255)
ttCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGAATACACCTCACCTCAGACTTGAAGCAACCCCGATTGCATGTTATTTTTTTg < 2:3365164/101‑1 (MQ=255)
tCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGAATACACCTCACCTCAGACTTGAAGCAACCCCGATTGCATGTTATTTTTTTGc > 2:4441475/1‑101 (MQ=255)
|
ATATGTGCATGCGAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGAATACACCTCACCTCAGACTTGAAGCAACCCCGATTGCATGTTATTTTTTTGC > NC_014034/3317547‑3317747
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 36 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|