New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_014034 | = 3317647 | 300 (1.340) | 2 (0.010) | 2/198 | 36.0 | 0.01 | intergenic (+64/‑86) | RCAP_rcc03121/RCAP_rcc03122 | hypothetical protein/FRG domain‑containing protein |
? | NC_014034 | = 3317659 | 296 (1.310) | intergenic (+76/‑74) | RCAP_rcc03121/RCAP_rcc03122 | hypothetical protein/FRG domain‑containing protein | |||||
Rejected: Position hash score below cutoff. |
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
GAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGAATACACCTCACCTCAGACTTGAAGCAACCCCGATTGCATGTTATTTTTTTGCCGTTCTAATCTG > NC_014034/3317559‑3317759
|
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gAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTta > 1:1605043/1‑101 (MQ=255)
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cGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTtaataa < 2:87097/101‑1 (MQ=255)
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gTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATaaa > 2:485492/1‑101 (MQ=255)
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acgCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATa > 2:4278685/1‑101 (MQ=255)
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taataaAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGAATACACCTCACCTCAGACTTGAAGCAACCCCGATTGCATGTTATTTTTTTGCCGTTCTAATCt < 2:1263881/101‑1 (MQ=255)
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aataaAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGAATACACCTCACCTCAGACTTGAAGCAACCCCGATTGCATGTTATTTTTTTGCCGTTCTAATCTg > 2:3627448/1‑101 (MQ=255)
|
GAGGCGTGCAAATGCCAACGCGTAAGCAAACGACGCCCTATTAAATTTTCTCAACACAAGGGAATCATTTTCCAGAAAAGAGCACATTTCAACTTAAGTTAATAAAGGTATAAATTTATACCTCAAAGCAATAACGAATACACCTCACCTCAGACTTGAAGCAACCCCGATTGCATGTTATTTTTTTGCCGTTCTAATCTG > NC_014034/3317559‑3317759
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 36 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|