cmonkey.stringdb
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stringdb.py - cMonkey STRING database interface module
 
This file is part of cMonkey Python. Please see README and LICENSE for
more information and licensing details.

 
Modules
       
logging
math
cmonkey.network
cmonkey.patches
re
cmonkey.util

 
Functions
       
get_network_factory(organism_code, filename, weight, sep='\t', normalized=False)
STRING network factory from preprocessed edge file
(protein1, protein2, combined_score), scores are already
normalized to 1000.
This is the standard factory method used for Microbes.

 
Data
        __all__ = ['get_network_factory']